FuNGI

C6HCB1

Protein Details

Accession

C6HCB1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-53	NPIPSPRPRLQQKPTTHPKTST	Hydrophilic
415-439	PSPSTTKAKRGRPKGAKNFRPPPPT	Hydrophilic
553-579	GRVPGSGMGRRPRKRRKGRMGDVGYLD	Basic
587-611	EKGGGNGWWRRKRRRSASVSSVRSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
421-435	KAKRGRPKGAKNFRP
560-572	MGRRPRKRRKGRM
589-601	GGGNGWWRRKRRR

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 4, cyto 4, cyto_nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin
Gene Ontology	GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF00382 TFIIB
CDD	cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MTSMRPPARFPRAPGGGIRGPVQRLASLRNPNPIPSPRPRLQQKPTTHPKTSTCPNPGCPAPNIVEDDGMKVCSGCGTVVSEANIVSEITFGESASGAAVVQGTFVGAGQSYGRSFGPGFQRGGGMESREITEQNGNRYIAQLSRALNVPESATKAAGQVFKLAVGLNFIQGRRTKTVAAVCLYIACRRQDGNTVMLIDFADVLMINVFKLGRAYKALLDELRLGGNVFIMNPIDPESLIYRFAKQLEFGSSMMQVASEAVRIVQRMNRDWMITGRRPAGICGAALILAARMNNFRRTIREVVYVVKVTELTIHQRLNEFKATESGDLTVDQFRSVQLENAHDPPAFTQGKRLKQAMKQKNATTEIANGDEGENTQQLTTTSSAPRPMRVDADGFAIPDVPIDPALLADKDGVPPSPSTTKAKRGRPKGAKNFRPPPPTASELASESALESEMQELLTTGSNLLASTNSTTSHTAPTAQRPATPQPPKPIPSTPDIDASEFDSDPEVKYCLLSPAEVEIKERIWVHENKDYLRTQQAKALKRALAAEEDLMNGRVPGSGMGRRPRKRRKGRMGDVGYLDGKEGEGEEKGGGNGWWRRKRRRSASVSSVRSSSVVPDRTAVAAAAAAGGLGIRGPVRERVVKGSRSGSSVPAFVSAVPTIPTQAPAPAPAPAPTSSSAQPQPTATTLGEEAEAATPTPPSTNPHEEILGYIPGPERGEEDADADADADADVDGEDTDDEEEEDVEEDVEEDDHVDEAFAGNYYGGASDDDDDYYF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.55
3	0.48
4	0.46
5	0.44
6	0.39
7	0.35
8	0.36
9	0.34
10	0.3
11	0.28
12	0.32
13	0.37
14	0.42
15	0.44
16	0.5
17	0.5
18	0.5
19	0.55
20	0.56
21	0.55
22	0.55
23	0.6
24	0.57
25	0.66
26	0.72
27	0.74
28	0.77
29	0.79
30	0.78
31	0.8
32	0.85
33	0.84
34	0.81
35	0.76
36	0.73
37	0.71
38	0.72
39	0.7
40	0.68
41	0.65
42	0.63
43	0.64
44	0.63
45	0.59
46	0.52
47	0.47
48	0.41
49	0.39
50	0.39
51	0.33
52	0.32
53	0.28
54	0.28
55	0.24
56	0.22
57	0.18
58	0.13
59	0.12
60	0.1
61	0.1
62	0.08
63	0.08
64	0.1
65	0.12
66	0.14
67	0.15
68	0.15
69	0.14
70	0.14
71	0.13
72	0.1
73	0.08
74	0.07
75	0.06
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.05
85	0.05
86	0.06
87	0.05
88	0.05
89	0.05
90	0.04
91	0.04
92	0.04
93	0.04
94	0.04
95	0.05
96	0.05
97	0.07
98	0.08
99	0.1
100	0.1
101	0.11
102	0.12
103	0.16
104	0.24
105	0.27
106	0.28
107	0.27
108	0.28
109	0.27
110	0.29
111	0.25
112	0.2
113	0.17
114	0.16
115	0.17
116	0.17
117	0.17
118	0.17
119	0.22
120	0.23
121	0.26
122	0.3
123	0.3
124	0.29
125	0.3
126	0.29
127	0.24
128	0.23
129	0.22
130	0.19
131	0.2
132	0.22
133	0.21
134	0.2
135	0.19
136	0.19
137	0.17
138	0.18
139	0.17
140	0.16
141	0.15
142	0.16
143	0.19
144	0.19
145	0.18
146	0.17
147	0.17
148	0.16
149	0.16
150	0.15
151	0.11
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.15
156	0.15
157	0.19
158	0.22
159	0.26
160	0.27
161	0.29
162	0.27
163	0.29
164	0.34
165	0.33
166	0.32
167	0.28
168	0.24
169	0.25
170	0.25
171	0.23
172	0.22
173	0.19
174	0.19
175	0.19
176	0.21
177	0.25
178	0.26
179	0.26
180	0.24
181	0.25
182	0.23
183	0.22
184	0.21
185	0.14
186	0.11
187	0.08
188	0.06
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.07
198	0.08
199	0.09
200	0.12
201	0.13
202	0.15
203	0.17
204	0.19
205	0.18
206	0.19
207	0.19
208	0.17
209	0.16
210	0.13
211	0.11
212	0.09
213	0.09
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.11
225	0.11
226	0.14
227	0.14
228	0.14
229	0.15
230	0.17
231	0.16
232	0.15
233	0.16
234	0.17
235	0.19
236	0.17
237	0.17
238	0.15
239	0.15
240	0.14
241	0.11
242	0.08
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.04
247	0.05
248	0.06
249	0.06
250	0.08
251	0.1
252	0.13
253	0.15
254	0.2
255	0.21
256	0.2
257	0.21
258	0.25
259	0.3
260	0.29
261	0.3
262	0.28
263	0.29
264	0.28
265	0.28
266	0.26
267	0.19
268	0.16
269	0.13
270	0.11
271	0.09
272	0.08
273	0.07
274	0.05
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.08
279	0.1
280	0.14
281	0.17
282	0.18
283	0.21
284	0.27
285	0.3
286	0.29
287	0.31
288	0.29
289	0.29
290	0.31
291	0.28
292	0.22
293	0.19
294	0.16
295	0.12
296	0.13
297	0.11
298	0.12
299	0.16
300	0.16
301	0.16
302	0.19
303	0.21
304	0.22
305	0.24
306	0.21
307	0.17
308	0.2
309	0.21
310	0.18
311	0.17
312	0.15
313	0.12
314	0.11
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.11
325	0.14
326	0.16
327	0.17
328	0.19
329	0.17
330	0.16
331	0.15
332	0.2
333	0.18
334	0.16
335	0.23
336	0.28
337	0.33
338	0.37
339	0.39
340	0.37
341	0.42
342	0.53
343	0.54
344	0.57
345	0.56
346	0.55
347	0.58
348	0.56
349	0.51
350	0.41
351	0.34
352	0.26
353	0.22
354	0.2
355	0.14
356	0.11
357	0.1
358	0.09
359	0.08
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.07
366	0.08
367	0.1
368	0.11
369	0.12
370	0.18
371	0.18
372	0.2
373	0.21
374	0.21
375	0.2
376	0.19
377	0.19
378	0.14
379	0.17
380	0.15
381	0.13
382	0.11
383	0.1
384	0.08
385	0.07
386	0.07
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.05
393	0.05
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.1
403	0.12
404	0.14
405	0.19
406	0.22
407	0.32
408	0.39
409	0.48
410	0.54
411	0.6
412	0.68
413	0.72
414	0.79
415	0.81
416	0.83
417	0.83
418	0.84
419	0.85
420	0.82
421	0.77
422	0.68
423	0.62
424	0.56
425	0.5
426	0.42
427	0.35
428	0.29
429	0.24
430	0.23
431	0.19
432	0.14
433	0.1
434	0.09
435	0.08
436	0.06
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.09
457	0.11
458	0.12
459	0.13
460	0.13
461	0.16
462	0.17
463	0.23
464	0.27
465	0.26
466	0.27
467	0.29
468	0.34
469	0.4
470	0.44
471	0.42
472	0.44
473	0.49
474	0.5
475	0.51
476	0.5
477	0.43
478	0.41
479	0.41
480	0.34
481	0.34
482	0.33
483	0.29
484	0.25
485	0.24
486	0.22
487	0.18
488	0.16
489	0.12
490	0.11
491	0.11
492	0.12
493	0.1
494	0.08
495	0.09
496	0.09
497	0.11
498	0.11
499	0.1
500	0.1
501	0.13
502	0.15
503	0.15
504	0.16
505	0.14
506	0.14
507	0.17
508	0.17
509	0.15
510	0.19
511	0.22
512	0.25
513	0.29
514	0.31
515	0.3
516	0.35
517	0.34
518	0.31
519	0.36
520	0.35
521	0.31
522	0.35
523	0.41
524	0.42
525	0.45
526	0.48
527	0.41
528	0.38
529	0.39
530	0.34
531	0.29
532	0.24
533	0.2
534	0.15
535	0.14
536	0.13
537	0.12
538	0.11
539	0.08
540	0.08
541	0.07
542	0.06
543	0.07
544	0.1
545	0.13
546	0.18
547	0.28
548	0.37
549	0.45
550	0.55
551	0.65
552	0.73
553	0.8
554	0.86
555	0.89
556	0.9
557	0.92
558	0.92
559	0.87
560	0.81
561	0.72
562	0.63
563	0.53
564	0.41
565	0.32
566	0.21
567	0.15
568	0.1
569	0.08
570	0.07
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.07
575	0.08
576	0.08
577	0.08
578	0.13
579	0.19
580	0.28
581	0.37
582	0.45
583	0.55
584	0.65
585	0.75
586	0.79
587	0.84
588	0.83
589	0.84
590	0.86
591	0.86
592	0.82
593	0.73
594	0.64
595	0.53
596	0.45
597	0.36
598	0.3
599	0.28
600	0.25
601	0.23
602	0.23
603	0.24
604	0.24
605	0.24
606	0.19
607	0.11
608	0.08
609	0.08
610	0.06
611	0.05
612	0.04
613	0.03
614	0.03
615	0.02
616	0.02
617	0.03
618	0.03
619	0.04
620	0.06
621	0.11
622	0.15
623	0.2
624	0.22
625	0.31
626	0.38
627	0.4
628	0.43
629	0.44
630	0.42
631	0.41
632	0.41
633	0.36
634	0.31
635	0.29
636	0.25
637	0.22
638	0.2
639	0.16
640	0.17
641	0.13
642	0.12
643	0.12
644	0.12
645	0.13
646	0.13
647	0.14
648	0.12
649	0.15
650	0.15
651	0.16
652	0.17
653	0.17
654	0.18
655	0.18
656	0.2
657	0.18
658	0.21
659	0.2
660	0.23
661	0.22
662	0.27
663	0.3
664	0.3
665	0.31
666	0.29
667	0.3
668	0.28
669	0.29
670	0.23
671	0.21
672	0.19
673	0.18
674	0.17
675	0.14
676	0.13
677	0.11
678	0.11
679	0.09
680	0.09
681	0.09
682	0.09
683	0.11
684	0.11
685	0.14
686	0.21
687	0.28
688	0.31
689	0.33
690	0.34
691	0.32
692	0.33
693	0.31
694	0.25
695	0.18
696	0.17
697	0.15
698	0.16
699	0.17
700	0.16
701	0.15
702	0.16
703	0.18
704	0.17
705	0.18
706	0.16
707	0.16
708	0.15
709	0.13
710	0.1
711	0.08
712	0.07
713	0.06
714	0.05
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.08
729	0.08
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.07
734	0.07
735	0.07
736	0.07
737	0.07
738	0.07
739	0.07
740	0.07
741	0.06
742	0.07
743	0.07
744	0.07
745	0.06
746	0.06
747	0.06
748	0.06
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.08
753	0.09
754	0.11

C6HCB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer