Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HNT7

Protein Details
Accession C6HNT7    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSSMRNAIQRRPHRERAQPSSREKWHydrophilic
38-62ARDYNVKKAKLQRLREKARDRNLDEHydrophilic
171-193EASFREKQKRVQRSKKQIEAEERHydrophilic
199-219LAARRLKKRAAEARRKKVEALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-216KQKRVQRSKKQIEAEERARKEMLAARRLKKRAAEARRKKV
253-261KWKIRERKK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAIQRRPHRERAQPSSREKWGILEKHKDYTLRARDYNVKKAKLQRLREKARDRNLDEFAFGMMSEKSNRQGRHGARGSEAASNLSHETIKLLKTQDAGYLRVVGEKVRRQLEGAEQEVRLQDGMSGVLQDGSGRKIVFANSLEEQRRLQIEKVEKMAEVSDEEEGEASFREKQKRVQRSKKQIEAEERARKEMLAARRLKKRAAEARRKKVEALRLQHKELVAAAQELDRQRAKMENSVGGVNKYGIKWKIRERKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.84
3 0.84
4 0.84
5 0.83
6 0.82
7 0.8
8 0.77
9 0.71
10 0.61
11 0.58
12 0.57
13 0.56
14 0.56
15 0.58
16 0.55
17 0.56
18 0.59
19 0.54
20 0.49
21 0.5
22 0.52
23 0.49
24 0.47
25 0.47
26 0.54
27 0.59
28 0.65
29 0.63
30 0.57
31 0.57
32 0.65
33 0.7
34 0.7
35 0.73
36 0.74
37 0.76
38 0.82
39 0.86
40 0.86
41 0.85
42 0.86
43 0.85
44 0.79
45 0.75
46 0.7
47 0.6
48 0.5
49 0.41
50 0.32
51 0.22
52 0.17
53 0.12
54 0.08
55 0.08
56 0.1
57 0.11
58 0.17
59 0.23
60 0.24
61 0.27
62 0.35
63 0.36
64 0.45
65 0.48
66 0.44
67 0.39
68 0.42
69 0.39
70 0.32
71 0.3
72 0.21
73 0.16
74 0.16
75 0.14
76 0.13
77 0.11
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.16
86 0.16
87 0.2
88 0.2
89 0.2
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.13
96 0.16
97 0.18
98 0.23
99 0.23
100 0.23
101 0.22
102 0.23
103 0.27
104 0.26
105 0.25
106 0.22
107 0.21
108 0.21
109 0.21
110 0.19
111 0.13
112 0.09
113 0.07
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.11
130 0.11
131 0.13
132 0.13
133 0.18
134 0.19
135 0.2
136 0.2
137 0.19
138 0.2
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.23
143 0.25
144 0.28
145 0.27
146 0.24
147 0.23
148 0.22
149 0.17
150 0.12
151 0.1
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.09
161 0.14
162 0.2
163 0.22
164 0.31
165 0.4
166 0.51
167 0.61
168 0.68
169 0.75
170 0.8
171 0.87
172 0.87
173 0.84
174 0.8
175 0.78
176 0.75
177 0.74
178 0.73
179 0.64
180 0.58
181 0.52
182 0.45
183 0.39
184 0.37
185 0.35
186 0.34
187 0.41
188 0.45
189 0.54
190 0.57
191 0.58
192 0.56
193 0.58
194 0.6
195 0.63
196 0.67
197 0.69
198 0.78
199 0.83
200 0.8
201 0.75
202 0.71
203 0.7
204 0.68
205 0.66
206 0.66
207 0.62
208 0.64
209 0.62
210 0.56
211 0.47
212 0.38
213 0.31
214 0.22
215 0.17
216 0.14
217 0.12
218 0.17
219 0.17
220 0.21
221 0.21
222 0.2
223 0.21
224 0.26
225 0.28
226 0.31
227 0.34
228 0.33
229 0.33
230 0.38
231 0.37
232 0.33
233 0.31
234 0.26
235 0.25
236 0.21
237 0.27
238 0.28
239 0.32
240 0.38
241 0.47