Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BJD4

Protein Details
Accession Q6BJD4    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-41NVPPSKAPSAKTNKHKPSKSGSDDHydrophilic
52-80FGNKSGSQTNKKSNKKTSKHTSSNTSNNKHydrophilic
302-321QPQQHPQQHPQPQPQPQQLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-164SSKKATKPKEKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG dha:DEHA2G03256g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15365  PNRC  
Amino Acid Sequences MMAHELPLSIHTKKSNHNVPPSKAPSAKTNKHKPSKSGSDDRGLPNGGKVDFGNKSGSQTNKKSNKKTSKHTSSNTSNNKGVTRVLPDGSKPNFGNESSHQNGGNHKKQNNEPCLPNGEKPNFGEGSKSHSKKKNNDHVLPNGEKPNFFNEKSSKKATKPKEKKPLITEDTYAGSSFHSSPAALNLPKPSFKTSPKTNDAKQHTTEPNYHVNPQVNTPPQHSVNVPPQHPVTTYPAGNGVPNIPTVPSNPTAFPPRNHYAQPGFSYYATPQGYINYQYPQVPPPPPPQGGVYPMVAPQYQQQPQQHPQQHPQPQPQPQQLPQQHRPHHLPAIAAPQQGHRISFNELLGSSKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.53
3 0.57
4 0.66
5 0.71
6 0.71
7 0.77
8 0.76
9 0.74
10 0.68
11 0.63
12 0.62
13 0.63
14 0.67
15 0.67
16 0.72
17 0.74
18 0.81
19 0.84
20 0.8
21 0.8
22 0.81
23 0.8
24 0.79
25 0.73
26 0.7
27 0.7
28 0.67
29 0.61
30 0.52
31 0.43
32 0.36
33 0.35
34 0.28
35 0.23
36 0.2
37 0.22
38 0.21
39 0.23
40 0.25
41 0.21
42 0.25
43 0.29
44 0.36
45 0.38
46 0.43
47 0.52
48 0.58
49 0.67
50 0.72
51 0.77
52 0.81
53 0.81
54 0.84
55 0.85
56 0.85
57 0.86
58 0.82
59 0.8
60 0.78
61 0.8
62 0.79
63 0.73
64 0.66
65 0.59
66 0.54
67 0.46
68 0.4
69 0.33
70 0.29
71 0.26
72 0.25
73 0.24
74 0.24
75 0.31
76 0.3
77 0.33
78 0.29
79 0.29
80 0.3
81 0.29
82 0.32
83 0.26
84 0.33
85 0.3
86 0.32
87 0.29
88 0.28
89 0.36
90 0.4
91 0.45
92 0.44
93 0.44
94 0.48
95 0.54
96 0.62
97 0.62
98 0.58
99 0.53
100 0.49
101 0.53
102 0.5
103 0.46
104 0.44
105 0.39
106 0.36
107 0.35
108 0.36
109 0.31
110 0.28
111 0.27
112 0.19
113 0.25
114 0.31
115 0.33
116 0.37
117 0.42
118 0.5
119 0.57
120 0.67
121 0.7
122 0.7
123 0.74
124 0.72
125 0.71
126 0.71
127 0.64
128 0.57
129 0.52
130 0.43
131 0.37
132 0.32
133 0.32
134 0.3
135 0.28
136 0.29
137 0.3
138 0.34
139 0.38
140 0.44
141 0.42
142 0.43
143 0.52
144 0.57
145 0.62
146 0.67
147 0.72
148 0.76
149 0.77
150 0.77
151 0.73
152 0.73
153 0.66
154 0.58
155 0.49
156 0.4
157 0.35
158 0.3
159 0.24
160 0.15
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.14
173 0.16
174 0.17
175 0.19
176 0.21
177 0.22
178 0.27
179 0.33
180 0.37
181 0.43
182 0.49
183 0.53
184 0.53
185 0.57
186 0.6
187 0.58
188 0.52
189 0.52
190 0.49
191 0.46
192 0.45
193 0.4
194 0.41
195 0.38
196 0.37
197 0.33
198 0.33
199 0.31
200 0.3
201 0.32
202 0.29
203 0.29
204 0.3
205 0.31
206 0.29
207 0.29
208 0.28
209 0.26
210 0.31
211 0.35
212 0.33
213 0.31
214 0.31
215 0.3
216 0.3
217 0.28
218 0.25
219 0.23
220 0.22
221 0.2
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.19
226 0.13
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.16
237 0.19
238 0.26
239 0.29
240 0.29
241 0.34
242 0.35
243 0.37
244 0.38
245 0.4
246 0.37
247 0.38
248 0.39
249 0.34
250 0.32
251 0.29
252 0.3
253 0.25
254 0.28
255 0.24
256 0.22
257 0.18
258 0.18
259 0.2
260 0.21
261 0.23
262 0.17
263 0.18
264 0.2
265 0.22
266 0.24
267 0.27
268 0.27
269 0.29
270 0.34
271 0.4
272 0.39
273 0.39
274 0.39
275 0.36
276 0.38
277 0.35
278 0.29
279 0.23
280 0.23
281 0.23
282 0.2
283 0.17
284 0.18
285 0.24
286 0.27
287 0.33
288 0.38
289 0.44
290 0.5
291 0.6
292 0.63
293 0.61
294 0.66
295 0.69
296 0.73
297 0.73
298 0.77
299 0.76
300 0.77
301 0.8
302 0.81
303 0.78
304 0.74
305 0.76
306 0.74
307 0.75
308 0.75
309 0.77
310 0.75
311 0.75
312 0.76
313 0.72
314 0.71
315 0.63
316 0.55
317 0.48
318 0.5
319 0.47
320 0.42
321 0.37
322 0.33
323 0.38
324 0.38
325 0.36
326 0.28
327 0.27
328 0.3
329 0.33
330 0.31
331 0.26
332 0.25