Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H2X2

Protein Details
Accession C6H2X2    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-32ITMETAKESSKKRKRKHGNSGESIRKKEKABasic
47-73AAPSATLRKPKESKKRKTDHSDVSDGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-33SSKKRKRKHGNSGESIRKKEKAT
51-63ATLRKPKESKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044773  DDX18/Has1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17942  DEADc_DDX18  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MPITMETAKESSKKRKRKHGNSGESIRKKEKATTLPRTDAPSAAPSAAPSATLRKPKESKKRKTDHSDVSDGEEDGDLGKIAKANEEEPDPELETTDEAEQVELPQSSAGEKDGDTDKEQEVDSDEEGEEKPTNGKSNEDQLELPSVNAVSLPQTEAEPQKFSELNLSDKTMKAIADMKFETMTEIQRRGIPPLLAGRDVLGAAKTGSGKTLAFLIPAVEMLSALRFKPRNGTGVIVVSPTRELALQIFGVARELMAHHSQTYGIVIGGANRRAEAGKLTKGVNLLIATPGRLLDHLQNTQGFVFKNLKALVIDEADRILEVGFEDEMRQIIKILPAEDRQTMLFSATQTTKVEDLARISLRQGPLYINVDHRKEHSTVEGLEQGYVICDSDKRFLLLFSFLKRNLKKKIIVFFSSCNCVKYHAELLNYIDLPVLDLYGKQKQQKRTNTFFEFCNATQGTLICTDVAARGLDIPAVDWIVQFDPPDDPRDYIHRVGRTARGANGKGRSLMFLQPSEVGFLKHLKEARVPVVDWRNSSDRITI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.76
3 0.84
4 0.89
5 0.93
6 0.93
7 0.93
8 0.93
9 0.93
10 0.93
11 0.9
12 0.86
13 0.81
14 0.74
15 0.66
16 0.63
17 0.62
18 0.61
19 0.64
20 0.67
21 0.69
22 0.69
23 0.7
24 0.69
25 0.62
26 0.53
27 0.46
28 0.39
29 0.33
30 0.28
31 0.25
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.16
36 0.14
37 0.19
38 0.24
39 0.33
40 0.35
41 0.42
42 0.51
43 0.6
44 0.7
45 0.74
46 0.79
47 0.81
48 0.88
49 0.89
50 0.91
51 0.9
52 0.89
53 0.86
54 0.81
55 0.71
56 0.67
57 0.58
58 0.48
59 0.39
60 0.29
61 0.21
62 0.15
63 0.14
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.09
68 0.09
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.17
73 0.19
74 0.2
75 0.19
76 0.22
77 0.2
78 0.18
79 0.18
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.1
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.11
100 0.15
101 0.17
102 0.19
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.21
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.15
116 0.13
117 0.11
118 0.14
119 0.14
120 0.19
121 0.18
122 0.22
123 0.23
124 0.31
125 0.33
126 0.32
127 0.31
128 0.27
129 0.3
130 0.27
131 0.24
132 0.15
133 0.13
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.11
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.24
151 0.22
152 0.24
153 0.24
154 0.27
155 0.25
156 0.25
157 0.26
158 0.2
159 0.18
160 0.15
161 0.2
162 0.18
163 0.21
164 0.21
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.16
170 0.19
171 0.18
172 0.19
173 0.19
174 0.22
175 0.23
176 0.24
177 0.25
178 0.21
179 0.19
180 0.23
181 0.24
182 0.2
183 0.19
184 0.17
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.19
216 0.2
217 0.22
218 0.23
219 0.24
220 0.2
221 0.21
222 0.21
223 0.16
224 0.14
225 0.11
226 0.1
227 0.08
228 0.07
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.04
252 0.05
253 0.04
254 0.07
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.17
269 0.16
270 0.15
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.08
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.13
283 0.14
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.13
290 0.12
291 0.15
292 0.14
293 0.18
294 0.17
295 0.18
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.12
300 0.12
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.05
307 0.04
308 0.03
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.09
320 0.09
321 0.1
322 0.13
323 0.14
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.12
331 0.11
332 0.09
333 0.12
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.13
342 0.14
343 0.16
344 0.17
345 0.16
346 0.16
347 0.19
348 0.19
349 0.18
350 0.17
351 0.14
352 0.17
353 0.2
354 0.2
355 0.23
356 0.28
357 0.29
358 0.29
359 0.3
360 0.3
361 0.28
362 0.27
363 0.23
364 0.21
365 0.2
366 0.22
367 0.23
368 0.2
369 0.19
370 0.17
371 0.14
372 0.12
373 0.11
374 0.09
375 0.05
376 0.07
377 0.08
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.19
385 0.2
386 0.21
387 0.25
388 0.27
389 0.36
390 0.4
391 0.46
392 0.48
393 0.53
394 0.55
395 0.56
396 0.62
397 0.6
398 0.59
399 0.56
400 0.52
401 0.48
402 0.48
403 0.43
404 0.36
405 0.29
406 0.29
407 0.28
408 0.27
409 0.31
410 0.28
411 0.28
412 0.29
413 0.31
414 0.31
415 0.3
416 0.25
417 0.19
418 0.15
419 0.15
420 0.13
421 0.11
422 0.06
423 0.07
424 0.11
425 0.18
426 0.23
427 0.29
428 0.36
429 0.46
430 0.56
431 0.65
432 0.71
433 0.72
434 0.77
435 0.77
436 0.73
437 0.64
438 0.58
439 0.53
440 0.44
441 0.43
442 0.34
443 0.27
444 0.26
445 0.24
446 0.22
447 0.18
448 0.18
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.1
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.08
464 0.07
465 0.09
466 0.1
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.15
471 0.16
472 0.21
473 0.21
474 0.21
475 0.23
476 0.3
477 0.34
478 0.36
479 0.41
480 0.4
481 0.41
482 0.45
483 0.49
484 0.49
485 0.47
486 0.46
487 0.48
488 0.48
489 0.51
490 0.52
491 0.48
492 0.45
493 0.43
494 0.39
495 0.34
496 0.36
497 0.34
498 0.29
499 0.29
500 0.28
501 0.27
502 0.28
503 0.25
504 0.21
505 0.18
506 0.22
507 0.22
508 0.25
509 0.28
510 0.27
511 0.32
512 0.37
513 0.41
514 0.41
515 0.4
516 0.43
517 0.5
518 0.51
519 0.48
520 0.49
521 0.47
522 0.45