Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HDH6

Protein Details
Accession C6HDH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-292NGSSKRIKSPKRKLSAGKNVHLHydrophilic
970-992LLSYARARYKKMKSREREISTNPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-283KRIKSPKRK
Subcellular Location(s) plas 17, nucl 4, vacu 3, mito 1, cyto 1, E.R. 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008010  Tatp1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05346  DUF747  
Amino Acid Sequences MLRAWLSCFDTPTSPFPQDNVYLSETQLRCQKQSPTADNENLLSTIVTLDPVTDITAHLTTGGMGSGSLSENGSVEKTMSTTASSNRGDAEKDPGVKVPLNGSNYGVASGRDFSQMEVLDKEYQAIRNGYHLEENTQRGDRPHSAPISTQRRLSLVNTVKNVEFATAMVSQPYGDRPALQAVQPADTGIRSTKRIDASQQSPSSHDREKDKVLKLSPAKIHELTSSPQSIPLHSIPLEPDKEQRTSGSPIPSGPLAIGASPETSTGVRVVNGSSKRIKSPKRKLSAGKNVHLEDAPDFLTSHQIARPFSSRRKCNSARAVSVTDGFQNRRSSPRPDRIDTARSRVSSSSAPDLFSSPVPQSIPLPPFSISTYLQLELASDRPSPLYIHRSTKSDFPYESSSAKLERLQNFFLLPPALERVLFFGTLACIDAWLYYFTILPLRFLKSIFLLLRSWAINVGAEAQFISRFIITGLGRVWRRRHQGKPAVSGNAHDQKIKLGSAQSRPGLSNSVSTDQDSPFLDDDVKNRASENDRRTQVASSRGHRRVRSIPSTLLPNDKADILKGFLMICTCLILMYFDASRVYHWIRGQAAIKLYVIYNVLEVGDRLLSAIGQDVLECLFSREALERKPDGRSKILRPFWLFIIALIYTVIHSAALFYQVITLNVAVNSYSNALITLLLSNQFVEIKSTVFKKFEKENLFQLTCADVVERFQLWLMLTIIASRNIVETGIFSFGSGLSLFAGSKPAANANATSVFNTQRATSSILPQAFTILPSSLLSSLSKVNSFLPTIGHLLGPFLVVLGSEMLVDWLKHAYINKFNNTRPAMYGRFLDILAKDYYTNAFADQNLNRRLGLPVIPLACLFFRVSIQTYQMFLTSWLPQTQSFVAPSNTTSLTSIHDHYSPSPSPSPPFILPLYPLDASLFIKVSSLFQTMIAHTTPSPASFIPIFTIILVLILYLTLLFTKLILSIILLSYARARYKKMKSREREISTNPISSKLSANQSTATISTPAPSPQREPSNSQTTTASNPDFVEGARRVGGWGAVEVGEDRRRWIYADDPEGARRLREKEERDRVGKPSSSAGGDGIEKVMRYEMAAKRIW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.33
4 0.35
5 0.35
6 0.34
7 0.33
8 0.31
9 0.28
10 0.28
11 0.36
12 0.31
13 0.32
14 0.37
15 0.36
16 0.35
17 0.4
18 0.46
19 0.45
20 0.55
21 0.57
22 0.58
23 0.63
24 0.64
25 0.61
26 0.55
27 0.48
28 0.38
29 0.32
30 0.23
31 0.15
32 0.12
33 0.1
34 0.1
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.14
69 0.17
70 0.25
71 0.25
72 0.25
73 0.26
74 0.27
75 0.27
76 0.26
77 0.3
78 0.28
79 0.3
80 0.31
81 0.31
82 0.32
83 0.32
84 0.32
85 0.31
86 0.31
87 0.32
88 0.31
89 0.3
90 0.29
91 0.27
92 0.27
93 0.22
94 0.16
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.19
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.22
106 0.21
107 0.21
108 0.23
109 0.21
110 0.22
111 0.24
112 0.24
113 0.21
114 0.23
115 0.26
116 0.25
117 0.27
118 0.26
119 0.26
120 0.3
121 0.33
122 0.33
123 0.32
124 0.32
125 0.3
126 0.36
127 0.37
128 0.35
129 0.4
130 0.38
131 0.38
132 0.41
133 0.49
134 0.51
135 0.49
136 0.47
137 0.42
138 0.41
139 0.41
140 0.39
141 0.39
142 0.37
143 0.41
144 0.41
145 0.42
146 0.4
147 0.39
148 0.37
149 0.28
150 0.2
151 0.13
152 0.14
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.2
165 0.21
166 0.21
167 0.23
168 0.21
169 0.22
170 0.21
171 0.2
172 0.15
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.17
177 0.17
178 0.2
179 0.25
180 0.29
181 0.31
182 0.36
183 0.4
184 0.41
185 0.48
186 0.5
187 0.45
188 0.45
189 0.46
190 0.45
191 0.43
192 0.43
193 0.4
194 0.41
195 0.48
196 0.53
197 0.56
198 0.57
199 0.53
200 0.57
201 0.56
202 0.59
203 0.55
204 0.51
205 0.5
206 0.45
207 0.44
208 0.37
209 0.36
210 0.3
211 0.29
212 0.28
213 0.22
214 0.26
215 0.25
216 0.23
217 0.25
218 0.24
219 0.23
220 0.21
221 0.22
222 0.2
223 0.26
224 0.27
225 0.24
226 0.29
227 0.29
228 0.3
229 0.3
230 0.29
231 0.27
232 0.3
233 0.33
234 0.32
235 0.29
236 0.28
237 0.29
238 0.27
239 0.23
240 0.18
241 0.15
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.16
258 0.18
259 0.22
260 0.27
261 0.28
262 0.35
263 0.43
264 0.52
265 0.56
266 0.65
267 0.71
268 0.73
269 0.79
270 0.8
271 0.82
272 0.83
273 0.8
274 0.75
275 0.72
276 0.65
277 0.58
278 0.5
279 0.41
280 0.3
281 0.24
282 0.18
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.16
292 0.19
293 0.25
294 0.27
295 0.36
296 0.43
297 0.49
298 0.52
299 0.61
300 0.63
301 0.67
302 0.71
303 0.68
304 0.64
305 0.61
306 0.58
307 0.49
308 0.46
309 0.37
310 0.3
311 0.27
312 0.24
313 0.25
314 0.26
315 0.26
316 0.32
317 0.35
318 0.4
319 0.46
320 0.54
321 0.57
322 0.56
323 0.6
324 0.59
325 0.64
326 0.59
327 0.56
328 0.51
329 0.44
330 0.43
331 0.38
332 0.35
333 0.28
334 0.28
335 0.28
336 0.24
337 0.24
338 0.22
339 0.23
340 0.22
341 0.19
342 0.19
343 0.12
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.14
348 0.18
349 0.2
350 0.19
351 0.2
352 0.19
353 0.19
354 0.2
355 0.21
356 0.16
357 0.17
358 0.18
359 0.16
360 0.16
361 0.15
362 0.14
363 0.12
364 0.13
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.14
372 0.19
373 0.22
374 0.28
375 0.3
376 0.33
377 0.34
378 0.39
379 0.39
380 0.35
381 0.32
382 0.29
383 0.32
384 0.31
385 0.31
386 0.26
387 0.24
388 0.21
389 0.22
390 0.23
391 0.24
392 0.27
393 0.3
394 0.29
395 0.29
396 0.28
397 0.27
398 0.24
399 0.18
400 0.12
401 0.09
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.12
428 0.15
429 0.15
430 0.15
431 0.16
432 0.13
433 0.17
434 0.16
435 0.16
436 0.14
437 0.14
438 0.16
439 0.15
440 0.14
441 0.1
442 0.1
443 0.07
444 0.07
445 0.1
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.09
457 0.08
458 0.1
459 0.1
460 0.15
461 0.17
462 0.21
463 0.25
464 0.28
465 0.36
466 0.43
467 0.48
468 0.53
469 0.6
470 0.62
471 0.65
472 0.62
473 0.57
474 0.5
475 0.45
476 0.41
477 0.39
478 0.34
479 0.27
480 0.24
481 0.22
482 0.23
483 0.22
484 0.17
485 0.13
486 0.17
487 0.2
488 0.24
489 0.24
490 0.23
491 0.24
492 0.23
493 0.22
494 0.18
495 0.17
496 0.15
497 0.16
498 0.16
499 0.16
500 0.17
501 0.15
502 0.17
503 0.14
504 0.14
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.11
509 0.12
510 0.15
511 0.15
512 0.14
513 0.14
514 0.16
515 0.2
516 0.26
517 0.3
518 0.33
519 0.33
520 0.34
521 0.35
522 0.34
523 0.32
524 0.34
525 0.33
526 0.3
527 0.39
528 0.45
529 0.48
530 0.47
531 0.49
532 0.48
533 0.51
534 0.5
535 0.44
536 0.38
537 0.35
538 0.38
539 0.35
540 0.31
541 0.25
542 0.2
543 0.18
544 0.17
545 0.15
546 0.12
547 0.11
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.06
553 0.07
554 0.06
555 0.06
556 0.05
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.09
569 0.1
570 0.12
571 0.13
572 0.15
573 0.16
574 0.19
575 0.2
576 0.19
577 0.18
578 0.16
579 0.16
580 0.13
581 0.12
582 0.1
583 0.1
584 0.07
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.03
596 0.03
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.06
609 0.09
610 0.11
611 0.12
612 0.17
613 0.18
614 0.19
615 0.25
616 0.28
617 0.29
618 0.33
619 0.37
620 0.4
621 0.47
622 0.49
623 0.49
624 0.47
625 0.45
626 0.39
627 0.37
628 0.3
629 0.2
630 0.19
631 0.14
632 0.11
633 0.09
634 0.08
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.03
639 0.03
640 0.03
641 0.04
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.05
662 0.06
663 0.06
664 0.05
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.07
670 0.06
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.1
675 0.13
676 0.15
677 0.18
678 0.19
679 0.21
680 0.26
681 0.33
682 0.37
683 0.37
684 0.41
685 0.45
686 0.45
687 0.41
688 0.36
689 0.29
690 0.23
691 0.2
692 0.14
693 0.07
694 0.07
695 0.09
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.09
703 0.08
704 0.08
705 0.09
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.08
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.08
717 0.08
718 0.07
719 0.07
720 0.07
721 0.08
722 0.07
723 0.06
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.09
733 0.1
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.15
738 0.15
739 0.16
740 0.16
741 0.16
742 0.17
743 0.17
744 0.15
745 0.13
746 0.15
747 0.18
748 0.17
749 0.2
750 0.24
751 0.24
752 0.24
753 0.23
754 0.23
755 0.19
756 0.18
757 0.15
758 0.1
759 0.1
760 0.09
761 0.11
762 0.09
763 0.1
764 0.1
765 0.1
766 0.12
767 0.13
768 0.13
769 0.13
770 0.14
771 0.15
772 0.16
773 0.15
774 0.13
775 0.13
776 0.15
777 0.14
778 0.13
779 0.11
780 0.1
781 0.1
782 0.09
783 0.07
784 0.05
785 0.04
786 0.04
787 0.04
788 0.04
789 0.04
790 0.04
791 0.04
792 0.05
793 0.05
794 0.05
795 0.05
796 0.06
797 0.06
798 0.08
799 0.11
800 0.15
801 0.23
802 0.29
803 0.36
804 0.4
805 0.42
806 0.49
807 0.48
808 0.45
809 0.4
810 0.4
811 0.36
812 0.33
813 0.33
814 0.26
815 0.25
816 0.23
817 0.22
818 0.17
819 0.17
820 0.16
821 0.15
822 0.13
823 0.12
824 0.13
825 0.13
826 0.13
827 0.11
828 0.11
829 0.11
830 0.17
831 0.2
832 0.27
833 0.28
834 0.29
835 0.28
836 0.28
837 0.28
838 0.24
839 0.23
840 0.17
841 0.18
842 0.18
843 0.18
844 0.17
845 0.17
846 0.14
847 0.14
848 0.12
849 0.09
850 0.09
851 0.11
852 0.14
853 0.14
854 0.17
855 0.17
856 0.18
857 0.18
858 0.17
859 0.15
860 0.14
861 0.15
862 0.15
863 0.16
864 0.17
865 0.18
866 0.18
867 0.21
868 0.21
869 0.21
870 0.2
871 0.2
872 0.2
873 0.19
874 0.2
875 0.2
876 0.19
877 0.17
878 0.16
879 0.14
880 0.16
881 0.18
882 0.2
883 0.19
884 0.19
885 0.2
886 0.21
887 0.27
888 0.25
889 0.27
890 0.29
891 0.29
892 0.3
893 0.32
894 0.35
895 0.29
896 0.31
897 0.28
898 0.25
899 0.26
900 0.25
901 0.26
902 0.21
903 0.2
904 0.17
905 0.17
906 0.17
907 0.16
908 0.14
909 0.1
910 0.11
911 0.11
912 0.12
913 0.13
914 0.14
915 0.13
916 0.13
917 0.15
918 0.15
919 0.18
920 0.16
921 0.15
922 0.13
923 0.16
924 0.15
925 0.14
926 0.15
927 0.13
928 0.16
929 0.15
930 0.16
931 0.15
932 0.16
933 0.15
934 0.13
935 0.13
936 0.09
937 0.09
938 0.08
939 0.06
940 0.04
941 0.04
942 0.03
943 0.03
944 0.03
945 0.03
946 0.04
947 0.04
948 0.04
949 0.05
950 0.06
951 0.06
952 0.06
953 0.06
954 0.07
955 0.07
956 0.09
957 0.09
958 0.09
959 0.12
960 0.16
961 0.21
962 0.22
963 0.27
964 0.35
965 0.45
966 0.55
967 0.62
968 0.69
969 0.72
970 0.8
971 0.86
972 0.83
973 0.81
974 0.77
975 0.77
976 0.71
977 0.68
978 0.58
979 0.51
980 0.46
981 0.39
982 0.38
983 0.33
984 0.37
985 0.34
986 0.35
987 0.33
988 0.32
989 0.32
990 0.29
991 0.25
992 0.19
993 0.16
994 0.16
995 0.16
996 0.2
997 0.23
998 0.25
999 0.28
1000 0.34
1001 0.43
1002 0.46
1003 0.51
1004 0.54
1005 0.59
1006 0.57
1007 0.54
1008 0.49
1009 0.42
1010 0.42
1011 0.42
1012 0.35
1013 0.27
1014 0.27
1015 0.26
1016 0.24
1017 0.21
1018 0.24
1019 0.19
1020 0.2
1021 0.19
1022 0.19
1023 0.18
1024 0.18
1025 0.19
1026 0.13
1027 0.12
1028 0.11
1029 0.1
1030 0.1
1031 0.11
1032 0.15
1033 0.19
1034 0.18
1035 0.2
1036 0.21
1037 0.22
1038 0.23
1039 0.25
1040 0.28
1041 0.32
1042 0.38
1043 0.4
1044 0.4
1045 0.42
1046 0.45
1047 0.42
1048 0.37
1049 0.34
1050 0.34
1051 0.38
1052 0.44
1053 0.51
1054 0.57
1055 0.67
1056 0.73
1057 0.73
1058 0.73
1059 0.69
1060 0.68
1061 0.63
1062 0.54
1063 0.49
1064 0.43
1065 0.4
1066 0.36
1067 0.31
1068 0.26
1069 0.24
1070 0.22
1071 0.19
1072 0.17
1073 0.15
1074 0.15
1075 0.15
1076 0.13
1077 0.13
1078 0.21
1079 0.24