FuNGI

C6HP05

Protein Details

Accession

C6HP05

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
258-297	QFAINKKSKKKARQVEKAIASVKKKEKKKNQPHPLNFSAF	Hydrophilic
496-519	LLEQWKEEERRKRRREQGLPSDGE	Basic
678-737	LKTDRAEHKSKTAKKKERKEEQGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKRKGKRSLVETRNVLK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
263-287	KKSKKKARQVEKAIASVKKKEKKKN
506-509	RKRR
681-749	DRAEHKSKTAKKKERKEEQGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKRKGKRSLVETRNVLKAHIDRQKKGGKR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, mito_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGKRKLGALEKVDADLTNLQHKIRRDPKSYIEDFRNQHYQYESHRDIFISSPSSVTDTGIISLRDLIEFIAHVADCYKDITKNFANELIEILSLHHAALEPELREKIVGSLVLLRKKEIIDSATLLHTLFPVLVSTPSKTLRAFLFQKILSDLRTSNSKTINHKLNRTIQTVLFNLVTSDRTSVKALWAIKITRELWKRQIWSDAKSVEIMKEAALADNEKVAVGGVRFFLGGDKEREELEDESSDDETHDISQIRHQFAINKKSKKKARQVEKAIASVKKKEKKKNQPHPLNFSAFHLLHDPQGFAETLFSKHLQNTKSKLNLEQKLLVLQLVSRLVGLHKLTMIQLYSYFLKYLTPKQPSVTSFLASLAQSTHPLVPPDVLEPLVQKIANEFVSEAAAAEVASAGLNAIREICVRQPLAMNDTLLQDLVMYRKSKDKGVMMAAKGLLSLYREVGAELLKKRDRGKNATIKLSTGERKDIRFGEEDTGEIEGIELLEQWKEEERRKRRREQGLPSDGEDGDEESEDEDWAAWDVAEGDESDDSGGWIDVHSDEEINIEVSDSENEGPAAKKAKLSESNGESRATTEEPQMEKEKKPSTLATTRILTPADLAKLAELRAQQNVSSLLPQNKTKRQKQAATIAARHIDDPLTATEIEGLAALSAGKATRAEKIARMNELKTDRAEHKSKTAKKKERKEEQGKSTTNKEKARKKNFLMTLGKAKRKGKRSLVETRNVLKAHIDRQKKGGKRGNYS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.27
3	0.24
4	0.26
5	0.26
6	0.27
7	0.3
8	0.34
9	0.41
10	0.47
11	0.54
12	0.53
13	0.58
14	0.65
15	0.7
16	0.73
17	0.7
18	0.68
19	0.68
20	0.64
21	0.64
22	0.64
23	0.55
24	0.52
25	0.48
26	0.44
27	0.43
28	0.51
29	0.48
30	0.42
31	0.42
32	0.4
33	0.38
34	0.36
35	0.32
36	0.26
37	0.22
38	0.2
39	0.19
40	0.22
41	0.2
42	0.19
43	0.17
44	0.13
45	0.15
46	0.17
47	0.16
48	0.13
49	0.15
50	0.15
51	0.13
52	0.12
53	0.11
54	0.09
55	0.08
56	0.08
57	0.09
58	0.08
59	0.09
60	0.09
61	0.1
62	0.1
63	0.13
64	0.14
65	0.16
66	0.17
67	0.24
68	0.28
69	0.31
70	0.33
71	0.34
72	0.33
73	0.29
74	0.3
75	0.24
76	0.19
77	0.16
78	0.15
79	0.12
80	0.11
81	0.1
82	0.09
83	0.08
84	0.08
85	0.11
86	0.13
87	0.12
88	0.16
89	0.17
90	0.16
91	0.16
92	0.16
93	0.15
94	0.14
95	0.13
96	0.1
97	0.18
98	0.23
99	0.28
100	0.28
101	0.28
102	0.28
103	0.29
104	0.3
105	0.25
106	0.22
107	0.19
108	0.2
109	0.21
110	0.2
111	0.2
112	0.18
113	0.15
114	0.13
115	0.1
116	0.08
117	0.06
118	0.06
119	0.06
120	0.09
121	0.11
122	0.13
123	0.16
124	0.19
125	0.21
126	0.21
127	0.23
128	0.22
129	0.28
130	0.3
131	0.31
132	0.35
133	0.33
134	0.34
135	0.35
136	0.34
137	0.27
138	0.26
139	0.23
140	0.19
141	0.25
142	0.26
143	0.27
144	0.32
145	0.36
146	0.4
147	0.47
148	0.54
149	0.54
150	0.58
151	0.6
152	0.64
153	0.64
154	0.61
155	0.56
156	0.48
157	0.46
158	0.41
159	0.36
160	0.27
161	0.21
162	0.19
163	0.17
164	0.15
165	0.12
166	0.13
167	0.12
168	0.13
169	0.15
170	0.15
171	0.16
172	0.2
173	0.2
174	0.21
175	0.24
176	0.23
177	0.23
178	0.28
179	0.27
180	0.31
181	0.34
182	0.36
183	0.39
184	0.44
185	0.46
186	0.43
187	0.51
188	0.46
189	0.45
190	0.47
191	0.4
192	0.35
193	0.34
194	0.32
195	0.23
196	0.21
197	0.18
198	0.11
199	0.13
200	0.12
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.07
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.16
227	0.16
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.14
232	0.14
233	0.11
234	0.1
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.15
241	0.2
242	0.21
243	0.22
244	0.22
245	0.26
246	0.33
247	0.43
248	0.46
249	0.5
250	0.54
251	0.63
252	0.71
253	0.74
254	0.77
255	0.76
256	0.79
257	0.8
258	0.83
259	0.82
260	0.77
261	0.72
262	0.67
263	0.61
264	0.53
265	0.5
266	0.51
267	0.5
268	0.55
269	0.6
270	0.66
271	0.73
272	0.82
273	0.85
274	0.87
275	0.9
276	0.9
277	0.88
278	0.82
279	0.75
280	0.64
281	0.55
282	0.5
283	0.39
284	0.32
285	0.26
286	0.21
287	0.19
288	0.19
289	0.17
290	0.11
291	0.12
292	0.11
293	0.08
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.1
298	0.11
299	0.11
300	0.14
301	0.19
302	0.2
303	0.24
304	0.27
305	0.32
306	0.36
307	0.36
308	0.41
309	0.45
310	0.47
311	0.45
312	0.44
313	0.38
314	0.34
315	0.33
316	0.25
317	0.16
318	0.11
319	0.1
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.09
326	0.09
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.08
333	0.06
334	0.06
335	0.08
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.08
340	0.1
341	0.12
342	0.18
343	0.24
344	0.26
345	0.27
346	0.28
347	0.32
348	0.32
349	0.35
350	0.29
351	0.22
352	0.19
353	0.19
354	0.19
355	0.14
356	0.14
357	0.09
358	0.08
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.08
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.02
393	0.02
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.07
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.13
406	0.13
407	0.16
408	0.16
409	0.15
410	0.13
411	0.14
412	0.13
413	0.11
414	0.09
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.09
419	0.09
420	0.1
421	0.16
422	0.18
423	0.2
424	0.23
425	0.24
426	0.25
427	0.3
428	0.34
429	0.28
430	0.29
431	0.27
432	0.23
433	0.21
434	0.17
435	0.11
436	0.07
437	0.08
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.11
445	0.13
446	0.19
447	0.2
448	0.24
449	0.3
450	0.35
451	0.4
452	0.43
453	0.51
454	0.54
455	0.57
456	0.61
457	0.56
458	0.5
459	0.46
460	0.44
461	0.39
462	0.31
463	0.34
464	0.29
465	0.3
466	0.33
467	0.33
468	0.3
469	0.28
470	0.28
471	0.24
472	0.21
473	0.2
474	0.17
475	0.16
476	0.13
477	0.1
478	0.09
479	0.05
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.05
487	0.1
488	0.14
489	0.21
490	0.31
491	0.41
492	0.52
493	0.6
494	0.7
495	0.75
496	0.82
497	0.84
498	0.85
499	0.85
500	0.83
501	0.77
502	0.69
503	0.62
504	0.51
505	0.42
506	0.31
507	0.21
508	0.13
509	0.11
510	0.09
511	0.06
512	0.07
513	0.06
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.04
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.06
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.04
534	0.04
535	0.05
536	0.05
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.08
543	0.08
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.07
549	0.08
550	0.08
551	0.07
552	0.08
553	0.09
554	0.09
555	0.11
556	0.15
557	0.15
558	0.17
559	0.18
560	0.26
561	0.32
562	0.36
563	0.41
564	0.43
565	0.48
566	0.47
567	0.46
568	0.38
569	0.32
570	0.31
571	0.25
572	0.21
573	0.19
574	0.23
575	0.24
576	0.28
577	0.34
578	0.35
579	0.35
580	0.41
581	0.43
582	0.4
583	0.42
584	0.41
585	0.42
586	0.45
587	0.47
588	0.44
589	0.42
590	0.4
591	0.39
592	0.36
593	0.28
594	0.23
595	0.22
596	0.18
597	0.16
598	0.14
599	0.13
600	0.14
601	0.14
602	0.16
603	0.16
604	0.16
605	0.19
606	0.2
607	0.19
608	0.2
609	0.22
610	0.2
611	0.2
612	0.24
613	0.26
614	0.29
615	0.36
616	0.42
617	0.5
618	0.59
619	0.64
620	0.7
621	0.73
622	0.76
623	0.77
624	0.78
625	0.77
626	0.75
627	0.7
628	0.64
629	0.58
630	0.51
631	0.44
632	0.35
633	0.27
634	0.19
635	0.18
636	0.15
637	0.13
638	0.13
639	0.12
640	0.12
641	0.12
642	0.11
643	0.09
644	0.08
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.05
652	0.07
653	0.09
654	0.13
655	0.18
656	0.2
657	0.25
658	0.34
659	0.38
660	0.44
661	0.46
662	0.43
663	0.47
664	0.49
665	0.47
666	0.4
667	0.41
668	0.39
669	0.43
670	0.48
671	0.43
672	0.48
673	0.56
674	0.63
675	0.68
676	0.74
677	0.77
678	0.82
679	0.9
680	0.91
681	0.92
682	0.94
683	0.93
684	0.92
685	0.92
686	0.91
687	0.87
688	0.81
689	0.8
690	0.78
691	0.76
692	0.75
693	0.74
694	0.74
695	0.79
696	0.84
697	0.84
698	0.82
699	0.83
700	0.81
701	0.81
702	0.77
703	0.73
704	0.73
705	0.72
706	0.73
707	0.71
708	0.72
709	0.71
710	0.73
711	0.77
712	0.76
713	0.76
714	0.77
715	0.81
716	0.81
717	0.82
718	0.81
719	0.76
720	0.72
721	0.63
722	0.55
723	0.5
724	0.47
725	0.47
726	0.49
727	0.52
728	0.48
729	0.57
730	0.66
731	0.66
732	0.72
733	0.72

C6HP05

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer