FuNGI

A0A0L0VM80

Protein Details

Accession

A0A0L0VM80

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
449-474	EHPTPTPSSSRKKHSSPKKSTPASDH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
275-281	KPAKSKR
362-390	REGPKKSSRGGGGSGGSGRGGKAGKSKPG

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSERNKLVVRHLPANLPEHIFWKSVAPWLEPCEEGQEARCTATFKSFIPGKTRLNKTKVEIPSRAYIQFATSDQVVEFHQGYASQAFRDSHGNLTYPKVEFAPYQKVAGPLKKIDNRIGTIDSDNDYLAFLEGLKPAVAELNTDAPNKPDPLSENVDRPEITPLIEHLRGVRKAAQEAAMTAKQQRQQANSTKSTTLRPTQIMKRGVINNSTGGSSSSPTVSGFPSRKTTDSVPHDPPPHMLNPVPSSDSKGGNQQTGKSASNPPPKSSTSRTNKPAKSKRSGRGTDDKASTAINHQPKTILQAPKTNDSNPAEKASINPNQSSSTKKENTSSLKKQSPTLEQQPTQHQQNGPTNPSTNSPREGPKKSSRGGGGSGGSGRGGKAGKSKPGPAPSTSQHQIDPSATTTPSKNHELPLSKNIEHQPDLASETAAARRRLGNALAGISSKNEHPTPTPSSSRKKHSSPKKSTPASDH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.48
3	0.43
4	0.38
5	0.34
6	0.34
7	0.29
8	0.25
9	0.25
10	0.23
11	0.25
12	0.26
13	0.26
14	0.27
15	0.3
16	0.32
17	0.29
18	0.28
19	0.27
20	0.26
21	0.24
22	0.24
23	0.25
24	0.23
25	0.24
26	0.25
27	0.22
28	0.22
29	0.27
30	0.26
31	0.21
32	0.29
33	0.32
34	0.34
35	0.39
36	0.45
37	0.47
38	0.54
39	0.63
40	0.64
41	0.65
42	0.67
43	0.66
44	0.69
45	0.69
46	0.67
47	0.61
48	0.57
49	0.58
50	0.56
51	0.51
52	0.43
53	0.35
54	0.28
55	0.26
56	0.23
57	0.19
58	0.15
59	0.15
60	0.14
61	0.14
62	0.13
63	0.14
64	0.14
65	0.11
66	0.11
67	0.11
68	0.12
69	0.14
70	0.14
71	0.12
72	0.14
73	0.15
74	0.16
75	0.2
76	0.2
77	0.22
78	0.23
79	0.24
80	0.23
81	0.26
82	0.28
83	0.24
84	0.24
85	0.2
86	0.2
87	0.2
88	0.24
89	0.29
90	0.27
91	0.28
92	0.28
93	0.33
94	0.36
95	0.39
96	0.37
97	0.33
98	0.41
99	0.45
100	0.47
101	0.48
102	0.47
103	0.45
104	0.44
105	0.41
106	0.34
107	0.3
108	0.28
109	0.24
110	0.2
111	0.17
112	0.14
113	0.12
114	0.1
115	0.09
116	0.07
117	0.05
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.06
124	0.09
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.13
129	0.15
130	0.17
131	0.17
132	0.17
133	0.19
134	0.2
135	0.19
136	0.16
137	0.16
138	0.21
139	0.27
140	0.27
141	0.29
142	0.29
143	0.31
144	0.29
145	0.27
146	0.25
147	0.19
148	0.17
149	0.13
150	0.13
151	0.16
152	0.16
153	0.16
154	0.16
155	0.22
156	0.22
157	0.24
158	0.27
159	0.24
160	0.25
161	0.26
162	0.25
163	0.18
164	0.19
165	0.21
166	0.18
167	0.17
168	0.18
169	0.21
170	0.22
171	0.27
172	0.3
173	0.28
174	0.34
175	0.43
176	0.47
177	0.47
178	0.46
179	0.44
180	0.42
181	0.42
182	0.39
183	0.34
184	0.31
185	0.3
186	0.33
187	0.36
188	0.42
189	0.42
190	0.39
191	0.4
192	0.41
193	0.39
194	0.35
195	0.3
196	0.24
197	0.21
198	0.2
199	0.15
200	0.12
201	0.1
202	0.09
203	0.09
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.13
210	0.14
211	0.15
212	0.2
213	0.22
214	0.22
215	0.24
216	0.25
217	0.28
218	0.34
219	0.38
220	0.37
221	0.4
222	0.41
223	0.39
224	0.38
225	0.32
226	0.26
227	0.22
228	0.18
229	0.16
230	0.16
231	0.17
232	0.18
233	0.15
234	0.18
235	0.19
236	0.2
237	0.18
238	0.22
239	0.23
240	0.24
241	0.25
242	0.22
243	0.24
244	0.26
245	0.26
246	0.22
247	0.27
248	0.32
249	0.41
250	0.41
251	0.39
252	0.4
253	0.41
254	0.44
255	0.43
256	0.45
257	0.44
258	0.5
259	0.56
260	0.62
261	0.65
262	0.7
263	0.74
264	0.72
265	0.73
266	0.74
267	0.74
268	0.74
269	0.74
270	0.7
271	0.7
272	0.68
273	0.64
274	0.57
275	0.5
276	0.4
277	0.36
278	0.3
279	0.23
280	0.25
281	0.25
282	0.24
283	0.23
284	0.24
285	0.24
286	0.3
287	0.34
288	0.32
289	0.28
290	0.34
291	0.36
292	0.42
293	0.44
294	0.39
295	0.38
296	0.36
297	0.37
298	0.33
299	0.33
300	0.27
301	0.25
302	0.26
303	0.26
304	0.29
305	0.28
306	0.27
307	0.25
308	0.28
309	0.29
310	0.32
311	0.3
312	0.33
313	0.34
314	0.36
315	0.37
316	0.41
317	0.48
318	0.53
319	0.57
320	0.56
321	0.59
322	0.58
323	0.6
324	0.58
325	0.57
326	0.55
327	0.56
328	0.55
329	0.51
330	0.54
331	0.58
332	0.58
333	0.55
334	0.52
335	0.45
336	0.44
337	0.5
338	0.52
339	0.47
340	0.44
341	0.42
342	0.38
343	0.41
344	0.4
345	0.34
346	0.32
347	0.32
348	0.38
349	0.44
350	0.49
351	0.52
352	0.56
353	0.6
354	0.59
355	0.61
356	0.55
357	0.5
358	0.47
359	0.43
360	0.34
361	0.29
362	0.27
363	0.21
364	0.18
365	0.15
366	0.13
367	0.12
368	0.12
369	0.12
370	0.2
371	0.24
372	0.32
373	0.35
374	0.41
375	0.45
376	0.52
377	0.54
378	0.48
379	0.5
380	0.46
381	0.51
382	0.48
383	0.43
384	0.37
385	0.35
386	0.35
387	0.3
388	0.28
389	0.22
390	0.22
391	0.2
392	0.21
393	0.21
394	0.23
395	0.27
396	0.32
397	0.31
398	0.32
399	0.39
400	0.42
401	0.46
402	0.5
403	0.52
404	0.46
405	0.51
406	0.52
407	0.5
408	0.46
409	0.43
410	0.36
411	0.3
412	0.32
413	0.26
414	0.21
415	0.16
416	0.17
417	0.22
418	0.25
419	0.25
420	0.24
421	0.26
422	0.29
423	0.32
424	0.31
425	0.3
426	0.26
427	0.27
428	0.26
429	0.24
430	0.21
431	0.19
432	0.2
433	0.17
434	0.2
435	0.2
436	0.21
437	0.24
438	0.3
439	0.35
440	0.4
441	0.47
442	0.5
443	0.6
444	0.65
445	0.72
446	0.74
447	0.76
448	0.8
449	0.82
450	0.85
451	0.85
452	0.88
453	0.89
454	0.89

A0A0L0VM80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer