Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0VYM4

Protein Details
Accession A0A0L0VYM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-317EATGKRGRGRPRKLAEEPSKKHKEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-316KRGRGRPRKLAEEPSKKHKE
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSAHRPANHPVNVSGVFQATSDSELKVIRGNQYGLITTGSFFQCAGIGKDKELDFEVKLMANTAITNALDEGVFYSLSGRMIAMNDGSAPVITYHPDEVLRIGEATTPPLDLTNRSATTGLGFVEERREVETNNGDGEPQLEVIVSHNDWDSHERCHRGFKVKYVVPGTKNMVKTHVLYVVGREVQLIGHVVDWDIENEMAVVLVKGVSLTTGHKEVRSPLKASASGSTPGKNGRNFYQFGKKPKTPTTPMASGSGTKVAESPLKGKEQIEEPPASDKENDTPNEDEEDGVVEATGKRGRGRPRKLAEEPSKKHKED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.24
3 0.2
4 0.17
5 0.18
6 0.12
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.18
14 0.2
15 0.22
16 0.24
17 0.25
18 0.27
19 0.28
20 0.28
21 0.24
22 0.23
23 0.18
24 0.15
25 0.18
26 0.15
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.12
31 0.14
32 0.17
33 0.2
34 0.21
35 0.21
36 0.27
37 0.26
38 0.26
39 0.27
40 0.25
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.08
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.13
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.13
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.15
118 0.17
119 0.15
120 0.16
121 0.15
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.09
126 0.07
127 0.06
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.12
138 0.12
139 0.15
140 0.19
141 0.21
142 0.21
143 0.27
144 0.3
145 0.35
146 0.35
147 0.36
148 0.41
149 0.39
150 0.43
151 0.42
152 0.42
153 0.35
154 0.37
155 0.36
156 0.33
157 0.33
158 0.29
159 0.28
160 0.25
161 0.25
162 0.23
163 0.22
164 0.18
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.09
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.06
198 0.08
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.2
204 0.28
205 0.31
206 0.3
207 0.29
208 0.33
209 0.34
210 0.34
211 0.31
212 0.25
213 0.25
214 0.25
215 0.23
216 0.21
217 0.25
218 0.29
219 0.29
220 0.3
221 0.32
222 0.36
223 0.37
224 0.4
225 0.45
226 0.45
227 0.52
228 0.57
229 0.55
230 0.56
231 0.63
232 0.66
233 0.62
234 0.63
235 0.62
236 0.58
237 0.56
238 0.52
239 0.45
240 0.38
241 0.34
242 0.31
243 0.23
244 0.19
245 0.17
246 0.16
247 0.19
248 0.19
249 0.21
250 0.21
251 0.25
252 0.27
253 0.27
254 0.28
255 0.28
256 0.32
257 0.34
258 0.31
259 0.28
260 0.33
261 0.33
262 0.32
263 0.29
264 0.26
265 0.26
266 0.31
267 0.32
268 0.3
269 0.31
270 0.31
271 0.34
272 0.32
273 0.27
274 0.2
275 0.2
276 0.16
277 0.14
278 0.12
279 0.09
280 0.09
281 0.13
282 0.15
283 0.14
284 0.18
285 0.25
286 0.36
287 0.45
288 0.54
289 0.61
290 0.67
291 0.75
292 0.79
293 0.83
294 0.83
295 0.84
296 0.82
297 0.82