FuNGI

C6HHT6

Protein Details

Accession

C6HHT6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-84	TYGRSSGPGRARRPPRQQLRMFGQVI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 11, cyto 8, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MEIFCRNVPDQVQNNHLTRQFRPVLAPFGIHCFHCRKLPSRNAILTIGDLSKALKLLATYGRSSGPGRARRPPRQQLRMFGQVIVIEQGRNTPDEFLLRSLRNEEETRLARGAISNNVQNHHQAPPVKRIKSFSITAMSCGMWDYHQGNPVFIECYRCGKNGKIAFGKTAVRVALETMQDVIYHLEFTYSNILGSIYTGTINAPSITITADTAPRLYKTDPTDVLAAGLHDMLQIQQKWMRGRPLKTRVGHFGDEHEALAGTCFVYRFLLKSSDDLVVVRDLANERHIPDIARWVDHRAKYDAPYSTLMQRFMAFLSQENMPYRVRFQLQKLVWNGDISPAKAISFASRVRAALVIEDLDIVVRALMRLSSDVKWPSPDVEASEVDVPALVEVFKNALESTAREREMTRSNRPMHPNHISIHRAQITPCGTYLDGPHAETKNRVLRHYSSHVDHFLRVEFVDETGDPVRYDPRASIDMIFESRFKTVLKSGINIAGRKFEFLGFSHSSLRSQTCWFVAPFYKDRILYNASTIIQNLGRFDHIQSPAKQAARIGQTFSDTLTSIPISDKYISIGKDVERNGRVFSDGVGTISPSVMYMIWKDHSLRTVVKPTVFQIRLAGAKGMISLDSRKKGKSLVLRPSMIKFHLPNSYNAFNIEICGSGLKPLPFFLNAQLIKILEDLGVDDSVFLRLQADEISRLRATATSTAKAARFLEDTNIAKSVGLPWLINILEGFGLRHSNDEFLRRVMELAVLIKLRDLKYRARIRVPNAVTLFGIMDETGILKEGEVFCTSLSDKGVREVLVNPRVVVTRSPAMHPGDVQIARAVDVPADSPLRQLHNCIAFSQHGHRDLPSMLSGGDLDGDLYNVIFDNTLLPKRIARPAEYPRVQEKVLGRAVVREDIIDFFVTFMQQDQLGRIATIHQALADRRPLGTFDPECLLLAELHSTAVDFSKTGVPVDLARIPKFPSCRPDFQAPSPRIRIAENLSLLEGDMDAVQDGGDEDDDERPAVRFYKSENILGKLYRSIDEVKFLQHRQSAMELPSAMGAPSVLQGVWEFVQREAEGFLWDHHIEHALDIRQIYEDNLLEIMARYSSTPWKSSITEYEVFVGTILGHGQKLSQRQKDSSKQMREEYEDLVQFVTALIQDREAGGVESLERSIACLYIAVEEEKKDNHSSRTASGPKHDSSVARHYHKLKQQHQDQLGHGYGADKQGRKHRLLSFPWIAAIVCLKEVDKLQRTMPF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.53
3	0.55
4	0.5
5	0.44
6	0.48
7	0.46
8	0.41
9	0.44
10	0.42
11	0.43
12	0.4
13	0.4
14	0.32
15	0.33
16	0.33
17	0.29
18	0.3
19	0.29
20	0.3
21	0.35
22	0.39
23	0.41
24	0.49
25	0.58
26	0.62
27	0.67
28	0.68
29	0.66
30	0.62
31	0.56
32	0.47
33	0.41
34	0.32
35	0.23
36	0.19
37	0.16
38	0.14
39	0.14
40	0.12
41	0.1
42	0.09
43	0.13
44	0.19
45	0.22
46	0.22
47	0.24
48	0.25
49	0.27
50	0.28
51	0.31
52	0.34
53	0.4
54	0.44
55	0.52
56	0.61
57	0.69
58	0.78
59	0.81
60	0.83
61	0.85
62	0.86
63	0.85
64	0.83
65	0.82
66	0.72
67	0.62
68	0.53
69	0.43
70	0.37
71	0.31
72	0.24
73	0.14
74	0.13
75	0.16
76	0.15
77	0.16
78	0.16
79	0.15
80	0.16
81	0.19
82	0.21
83	0.22
84	0.27
85	0.27
86	0.28
87	0.3
88	0.31
89	0.32
90	0.32
91	0.31
92	0.33
93	0.34
94	0.36
95	0.34
96	0.32
97	0.27
98	0.28
99	0.29
100	0.26
101	0.28
102	0.29
103	0.31
104	0.32
105	0.33
106	0.33
107	0.33
108	0.3
109	0.31
110	0.33
111	0.35
112	0.43
113	0.51
114	0.52
115	0.53
116	0.54
117	0.56
118	0.55
119	0.53
120	0.46
121	0.45
122	0.42
123	0.4
124	0.37
125	0.3
126	0.24
127	0.23
128	0.19
129	0.11
130	0.15
131	0.15
132	0.16
133	0.23
134	0.23
135	0.23
136	0.23
137	0.24
138	0.22
139	0.2
140	0.23
141	0.19
142	0.25
143	0.27
144	0.29
145	0.31
146	0.32
147	0.41
148	0.4
149	0.47
150	0.47
151	0.46
152	0.46
153	0.47
154	0.47
155	0.39
156	0.37
157	0.29
158	0.22
159	0.21
160	0.2
161	0.2
162	0.18
163	0.17
164	0.15
165	0.14
166	0.14
167	0.14
168	0.14
169	0.1
170	0.1
171	0.09
172	0.09
173	0.09
174	0.11
175	0.15
176	0.13
177	0.13
178	0.12
179	0.13
180	0.11
181	0.12
182	0.11
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.13
201	0.14
202	0.17
203	0.17
204	0.22
205	0.25
206	0.31
207	0.31
208	0.32
209	0.32
210	0.29
211	0.28
212	0.22
213	0.18
214	0.11
215	0.1
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.12
221	0.12
222	0.14
223	0.17
224	0.22
225	0.27
226	0.31
227	0.4
228	0.42
229	0.48
230	0.56
231	0.62
232	0.67
233	0.66
234	0.67
235	0.65
236	0.64
237	0.6
238	0.5
239	0.45
240	0.41
241	0.37
242	0.32
243	0.24
244	0.18
245	0.15
246	0.14
247	0.1
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.08
253	0.08
254	0.09
255	0.12
256	0.16
257	0.16
258	0.18
259	0.2
260	0.2
261	0.2
262	0.19
263	0.17
264	0.14
265	0.14
266	0.12
267	0.11
268	0.11
269	0.12
270	0.15
271	0.15
272	0.16
273	0.17
274	0.18
275	0.17
276	0.16
277	0.24
278	0.22
279	0.23
280	0.23
281	0.27
282	0.34
283	0.35
284	0.38
285	0.33
286	0.35
287	0.35
288	0.39
289	0.35
290	0.31
291	0.31
292	0.29
293	0.33
294	0.33
295	0.31
296	0.26
297	0.25
298	0.22
299	0.2
300	0.2
301	0.13
302	0.12
303	0.13
304	0.13
305	0.16
306	0.17
307	0.19
308	0.18
309	0.18
310	0.19
311	0.22
312	0.24
313	0.25
314	0.28
315	0.35
316	0.35
317	0.41
318	0.42
319	0.41
320	0.38
321	0.35
322	0.31
323	0.28
324	0.28
325	0.21
326	0.2
327	0.17
328	0.16
329	0.15
330	0.16
331	0.11
332	0.14
333	0.14
334	0.16
335	0.18
336	0.18
337	0.18
338	0.19
339	0.17
340	0.14
341	0.13
342	0.1
343	0.08
344	0.08
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.04
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.04
354	0.04
355	0.06
356	0.09
357	0.1
358	0.15
359	0.18
360	0.19
361	0.21
362	0.21
363	0.2
364	0.2
365	0.19
366	0.16
367	0.17
368	0.17
369	0.16
370	0.17
371	0.15
372	0.13
373	0.12
374	0.1
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.03
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.07
386	0.09
387	0.15
388	0.19
389	0.2
390	0.2
391	0.21
392	0.25
393	0.33
394	0.37
395	0.39
396	0.42
397	0.46
398	0.52
399	0.57
400	0.57
401	0.56
402	0.55
403	0.51
404	0.45
405	0.47
406	0.42
407	0.37
408	0.41
409	0.36
410	0.31
411	0.28
412	0.31
413	0.27
414	0.25
415	0.24
416	0.19
417	0.16
418	0.16
419	0.17
420	0.16
421	0.15
422	0.15
423	0.2
424	0.19
425	0.2
426	0.21
427	0.26
428	0.27
429	0.28
430	0.29
431	0.29
432	0.3
433	0.35
434	0.4
435	0.38
436	0.34
437	0.35
438	0.38
439	0.35
440	0.33
441	0.28
442	0.22
443	0.19
444	0.16
445	0.15
446	0.1
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.09
454	0.1
455	0.12
456	0.11
457	0.12
458	0.1
459	0.12
460	0.14
461	0.14
462	0.15
463	0.14
464	0.14
465	0.15
466	0.15
467	0.12
468	0.12
469	0.11
470	0.11
471	0.1
472	0.11
473	0.12
474	0.17
475	0.17
476	0.18
477	0.19
478	0.24
479	0.26
480	0.25
481	0.24
482	0.23
483	0.22
484	0.22
485	0.21
486	0.16
487	0.15
488	0.14
489	0.2
490	0.17
491	0.18
492	0.21
493	0.2
494	0.2
495	0.21
496	0.21
497	0.16
498	0.16
499	0.16
500	0.14
501	0.15
502	0.15
503	0.16
504	0.18
505	0.2
506	0.21
507	0.23
508	0.25
509	0.24
510	0.24
511	0.25
512	0.25
513	0.21
514	0.2
515	0.19
516	0.17
517	0.16
518	0.16
519	0.14
520	0.12
521	0.12
522	0.11
523	0.09
524	0.1
525	0.1
526	0.12
527	0.16
528	0.18
529	0.22
530	0.23
531	0.27
532	0.31
533	0.31
534	0.3
535	0.24
536	0.25
537	0.26
538	0.25
539	0.21
540	0.17
541	0.18
542	0.18
543	0.18
544	0.13
545	0.09
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.13
557	0.13
558	0.13
559	0.14
560	0.13
561	0.17
562	0.18
563	0.22
564	0.21
565	0.21
566	0.21
567	0.2
568	0.2
569	0.15
570	0.14
571	0.11
572	0.09
573	0.09
574	0.08
575	0.07
576	0.07
577	0.06
578	0.06
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.05
584	0.06
585	0.07
586	0.08
587	0.09
588	0.1
589	0.11
590	0.13
591	0.14
592	0.16
593	0.21
594	0.22
595	0.22
596	0.21
597	0.22
598	0.28
599	0.26
600	0.24
601	0.19
602	0.19
603	0.19
604	0.19
605	0.17
606	0.09
607	0.08
608	0.08
609	0.07
610	0.05
611	0.05
612	0.08
613	0.11
614	0.16
615	0.17
616	0.17
617	0.18
618	0.19
619	0.24
620	0.3
621	0.35
622	0.39
623	0.43
624	0.45
625	0.45
626	0.46
627	0.43
628	0.35
629	0.29
630	0.21
631	0.18
632	0.23
633	0.23
634	0.24
635	0.27
636	0.28
637	0.25
638	0.25
639	0.23
640	0.16
641	0.15
642	0.13
643	0.07
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.08
649	0.08
650	0.08
651	0.08
652	0.09
653	0.1
654	0.11
655	0.11
656	0.17
657	0.16
658	0.17
659	0.17
660	0.16
661	0.15
662	0.15
663	0.13
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.04
676	0.04
677	0.05
678	0.06
679	0.06
680	0.09
681	0.09
682	0.13
683	0.12
684	0.12
685	0.12
686	0.12
687	0.13
688	0.16
689	0.18
690	0.16
691	0.17
692	0.2
693	0.2
694	0.21
695	0.2
696	0.15
697	0.14
698	0.13
699	0.15
700	0.17
701	0.18
702	0.17
703	0.17
704	0.16
705	0.14
706	0.14
707	0.13
708	0.1
709	0.09
710	0.08
711	0.07
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.08
716	0.07
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.05
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.1
726	0.11
727	0.14
728	0.15
729	0.14
730	0.15
731	0.14
732	0.14
733	0.12
734	0.11
735	0.08
736	0.08
737	0.09
738	0.08
739	0.08
740	0.09
741	0.12
742	0.12
743	0.16
744	0.18
745	0.21
746	0.31
747	0.39
748	0.43
749	0.47
750	0.51
751	0.51
752	0.58
753	0.55
754	0.52
755	0.44
756	0.41
757	0.33
758	0.28
759	0.24
760	0.14
761	0.13
762	0.06
763	0.05
764	0.04
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.04
770	0.06
771	0.07
772	0.08
773	0.09
774	0.09
775	0.08
776	0.1
777	0.11
778	0.1
779	0.11
780	0.11
781	0.1
782	0.12
783	0.14
784	0.12
785	0.13
786	0.16
787	0.22
788	0.25
789	0.25
790	0.23
791	0.23
792	0.23
793	0.23
794	0.2
795	0.16
796	0.16
797	0.17
798	0.19
799	0.22
800	0.23
801	0.23
802	0.22
803	0.2
804	0.21
805	0.2
806	0.19
807	0.16
808	0.14
809	0.14
810	0.15
811	0.13
812	0.07
813	0.07
814	0.08
815	0.08
816	0.1
817	0.09
818	0.1
819	0.12
820	0.16
821	0.16
822	0.18
823	0.21
824	0.25
825	0.25
826	0.24
827	0.24
828	0.21
829	0.24
830	0.27
831	0.27
832	0.24
833	0.24
834	0.24
835	0.24
836	0.23
837	0.22
838	0.17
839	0.13
840	0.1
841	0.1
842	0.1
843	0.07
844	0.07
845	0.05
846	0.05
847	0.04
848	0.05
849	0.04
850	0.04
851	0.04
852	0.04
853	0.04
854	0.03
855	0.04
856	0.06
857	0.09
858	0.11
859	0.13
860	0.14
861	0.16
862	0.2
863	0.27
864	0.26
865	0.27
866	0.34
867	0.4
868	0.49
869	0.5
870	0.51
871	0.48
872	0.49
873	0.45
874	0.42
875	0.36
876	0.33
877	0.32
878	0.3
879	0.26
880	0.25
881	0.27
882	0.24
883	0.22
884	0.15
885	0.13
886	0.13
887	0.14
888	0.11
889	0.09
890	0.08
891	0.08
892	0.08
893	0.07
894	0.07
895	0.07
896	0.07
897	0.08
898	0.08
899	0.1
900	0.1
901	0.1
902	0.1
903	0.1
904	0.11
905	0.12
906	0.11
907	0.09
908	0.12
909	0.13
910	0.16
911	0.19
912	0.17
913	0.17
914	0.18
915	0.18
916	0.18
917	0.24
918	0.22
919	0.2
920	0.21
921	0.21
922	0.21
923	0.2
924	0.18
925	0.11
926	0.1
927	0.1
928	0.08
929	0.07
930	0.07
931	0.06
932	0.06
933	0.07
934	0.07
935	0.05
936	0.07
937	0.11
938	0.11
939	0.12
940	0.12
941	0.12
942	0.13
943	0.16
944	0.2
945	0.19
946	0.2
947	0.22
948	0.23
949	0.27
950	0.3
951	0.31
952	0.35
953	0.39
954	0.44
955	0.48
956	0.55
957	0.56
958	0.6
959	0.65
960	0.6
961	0.6
962	0.58
963	0.54
964	0.46
965	0.42
966	0.39
967	0.34
968	0.37
969	0.31
970	0.28
971	0.26
972	0.24
973	0.23
974	0.19
975	0.13
976	0.07
977	0.05
978	0.05
979	0.04
980	0.04
981	0.04
982	0.04
983	0.04
984	0.04
985	0.04
986	0.05
987	0.06
988	0.07
989	0.08
990	0.08
991	0.09
992	0.09
993	0.1
994	0.12
995	0.12
996	0.12
997	0.16
998	0.26
999	0.28
1000	0.34
1001	0.36
1002	0.37
1003	0.39
1004	0.38
1005	0.36
1006	0.3
1007	0.29
1008	0.23
1009	0.22
1010	0.24
1011	0.22
1012	0.26
1013	0.25
1014	0.27
1015	0.31
1016	0.32
1017	0.35
1018	0.33
1019	0.33
1020	0.3
1021	0.33
1022	0.32
1023	0.27
1024	0.29
1025	0.23
1026	0.21
1027	0.2
1028	0.18
1029	0.14
1030	0.1
1031	0.08
1032	0.06
1033	0.06
1034	0.06
1035	0.05
1036	0.06
1037	0.06
1038	0.08
1039	0.09
1040	0.12
1041	0.12
1042	0.12
1043	0.16
1044	0.15
1045	0.16
1046	0.15
1047	0.15
1048	0.13
1049	0.13
1050	0.13
1051	0.15
1052	0.16
1053	0.15
1054	0.15
1055	0.17
1056	0.15
1057	0.16
1058	0.2
1059	0.16
1060	0.18
1061	0.17
1062	0.17
1063	0.15
1064	0.16
1065	0.16
1066	0.14
1067	0.13
1068	0.12
1069	0.12
1070	0.11
1071	0.11
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.07
1075	0.07
1076	0.07
1077	0.1
1078	0.18
1079	0.21
1080	0.22
1081	0.24
1082	0.28
1083	0.29
1084	0.33
1085	0.37
1086	0.35
1087	0.34
1088	0.33
1089	0.34
1090	0.3
1091	0.28
1092	0.23
1093	0.17
1094	0.11
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.08
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.1
1101	0.14
1102	0.24
1103	0.33
1104	0.39
1105	0.44
1106	0.5
1107	0.6
1108	0.67
1109	0.74
1110	0.74
1111	0.75
1112	0.73
1113	0.74
1114	0.73
1115	0.7
1116	0.63
1117	0.56
1118	0.52
1119	0.43
1120	0.37
1121	0.31
1122	0.25
1123	0.19
1124	0.16
1125	0.13
1126	0.08
1127	0.1
1128	0.1
1129	0.1
1130	0.11
1131	0.11
1132	0.12
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.08
1136	0.08
1137	0.09
1138	0.09
1139	0.09
1140	0.09
1141	0.08
1142	0.09
1143	0.09
1144	0.09
1145	0.08
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.1
1149	0.12
1150	0.13
1151	0.15
1152	0.16
1153	0.18
1154	0.19
1155	0.23
1156	0.27
1157	0.29
1158	0.31
1159	0.36
1160	0.38
1161	0.39
1162	0.47
1163	0.5
1164	0.48
1165	0.52
1166	0.53
1167	0.48
1168	0.48
1169	0.49
1170	0.42
1171	0.41
1172	0.47
1173	0.48
1174	0.47
1175	0.53
1176	0.55
1177	0.61
1178	0.65
1179	0.69
1180	0.69
1181	0.71
1182	0.74
1183	0.77
1184	0.79
1185	0.76
1186	0.71
1187	0.68
1188	0.6
1189	0.49
1190	0.41
1191	0.31
1192	0.26
1193	0.28
1194	0.32
1195	0.27
1196	0.32
1197	0.41
1198	0.48
1199	0.51
1200	0.56
1201	0.57
1202	0.6
1203	0.63
1204	0.67
1205	0.64
1206	0.57
1207	0.55
1208	0.48
1209	0.39
1210	0.31
1211	0.29
1212	0.2
1213	0.15
1214	0.15
1215	0.14
1216	0.16
1217	0.2
1218	0.28
1219	0.31
1220	0.33

C6HHT6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer