Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HFF1

Protein Details
Accession C6HFF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
723-744DVSPRDSRKVSRKQPKIARSLSHydrophilic
1013-1038SLEWGYGISRQRKRRKFDFKSTDVDCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MGFKFSYVCDLFTSLENNLTLRASTASRHRNPDVATIANWFSQHGKQIHGGETDRLALLSCLFPERRPERVFGLKEPSLVKIIGRCLLLGISRRQALDSYKICGNGDLGQCVERVMRQAENDNPEDSGVTVEDIDTVLNHIASRCRFSGPDVRRRRTAAGVNEVLGPILRHLTSCEAKWLIRIILKDLSPLTLPARLILQNFHFLLPDLLLLQDSLGAAVALLSRDPMKRFPWRPDPDYAKLLAPSLFLVYLLTLEGIKHCCKMAGKRTMSVERKYDGEYCQIHVDLSKGSGCIQIFSKSGKNSTMDRVGIHSTVKECLRIGKVGCKISRNCILEGELLVWSDVESKILPFHKLRKHVIRSGSFIGTENDSPPHSYEHLYIMLFDVLLIDDQACLPKSYRERRALLKEISHPIDGRAGIAEQEYIDFSLPESQEMLTTAFATAISQRWEGLVLKASDEPYFVIEQQEHSNFGHWIKLKKDYIAGIGDTADFALIGARYDAREAAKLQSIKGVQWTSFFVGCRDTGSKYPYDARPLFRVVDVLNRHNVNIQLLRTLNQSGRFCSCDVDDEDAPFIIKTDQIQLPKVQVLFKTPFVVEMVGSGFEKPAGANYFTLRFPRVLKIHMDRDVEDATTLEELQVLAEAANSVPKDELSQNTAWWAERLDAVDGEPGYIIDTSEHSPISVVSISQPTNLENAPSDTPLRRHLVANEQKVVTSMGKRREIDVSPRDSRKVSRKQPKIARSLSPCIAIHSDHTQTTANTHLSHSQDSVGARHLSNISNLSQPNPIPTYASVGDCEDAVATTSLGNKIECSTTLRKLDEDGLSRSPQPSQQKSAGQNPYQEQQCFAQLELGLAGSSPSVGPLDTLSFLSETPILLGTGVSRDKVDSIPLDPKLLTTSITEFLEKLLDPNFPDKSHFHHSNPDAAQNFSKCSGIVLVESNTTKASQAASDIARIGNALAINQRTGRLPSKRGKLIFLRCEAMLQHGLFERNQAGHPENIRERWESHGKQLFAGSLEWGYGISRQRKRRKFDFKSTDVDCEESSRVGRTKANDSPSPPTMGVDVQLSWDWREVLSLGPVMSDAFMSDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.2
4 0.19
5 0.18
6 0.17
7 0.15
8 0.14
9 0.15
10 0.13
11 0.17
12 0.27
13 0.36
14 0.42
15 0.49
16 0.51
17 0.54
18 0.55
19 0.58
20 0.53
21 0.46
22 0.4
23 0.37
24 0.36
25 0.32
26 0.29
27 0.23
28 0.22
29 0.22
30 0.29
31 0.27
32 0.28
33 0.32
34 0.36
35 0.39
36 0.4
37 0.39
38 0.34
39 0.34
40 0.32
41 0.26
42 0.22
43 0.18
44 0.14
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.16
49 0.17
50 0.19
51 0.28
52 0.32
53 0.39
54 0.4
55 0.43
56 0.44
57 0.53
58 0.55
59 0.51
60 0.56
61 0.48
62 0.49
63 0.48
64 0.43
65 0.35
66 0.32
67 0.28
68 0.23
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.21
73 0.2
74 0.21
75 0.22
76 0.23
77 0.25
78 0.26
79 0.28
80 0.29
81 0.29
82 0.3
83 0.31
84 0.35
85 0.33
86 0.32
87 0.32
88 0.34
89 0.33
90 0.31
91 0.29
92 0.26
93 0.26
94 0.23
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.18
104 0.2
105 0.26
106 0.31
107 0.37
108 0.38
109 0.35
110 0.32
111 0.3
112 0.27
113 0.22
114 0.16
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.14
129 0.16
130 0.21
131 0.21
132 0.23
133 0.23
134 0.28
135 0.37
136 0.4
137 0.49
138 0.55
139 0.59
140 0.62
141 0.65
142 0.64
143 0.61
144 0.6
145 0.57
146 0.55
147 0.52
148 0.47
149 0.44
150 0.4
151 0.33
152 0.25
153 0.18
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.1
159 0.17
160 0.19
161 0.2
162 0.25
163 0.25
164 0.25
165 0.27
166 0.28
167 0.25
168 0.25
169 0.26
170 0.24
171 0.26
172 0.26
173 0.26
174 0.24
175 0.22
176 0.19
177 0.2
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.15
182 0.17
183 0.18
184 0.18
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.23
189 0.23
190 0.2
191 0.18
192 0.18
193 0.15
194 0.13
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.08
212 0.11
213 0.13
214 0.17
215 0.22
216 0.32
217 0.37
218 0.45
219 0.54
220 0.59
221 0.61
222 0.67
223 0.69
224 0.64
225 0.62
226 0.55
227 0.46
228 0.39
229 0.36
230 0.27
231 0.2
232 0.15
233 0.13
234 0.11
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.07
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.15
249 0.19
250 0.28
251 0.35
252 0.42
253 0.43
254 0.47
255 0.53
256 0.6
257 0.62
258 0.58
259 0.53
260 0.44
261 0.43
262 0.42
263 0.39
264 0.31
265 0.32
266 0.28
267 0.26
268 0.27
269 0.25
270 0.22
271 0.2
272 0.19
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.1
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.14
282 0.16
283 0.16
284 0.19
285 0.23
286 0.21
287 0.23
288 0.25
289 0.26
290 0.26
291 0.3
292 0.32
293 0.28
294 0.27
295 0.28
296 0.27
297 0.25
298 0.23
299 0.2
300 0.16
301 0.19
302 0.19
303 0.17
304 0.15
305 0.19
306 0.2
307 0.22
308 0.22
309 0.26
310 0.31
311 0.36
312 0.38
313 0.4
314 0.4
315 0.42
316 0.5
317 0.45
318 0.4
319 0.35
320 0.34
321 0.28
322 0.27
323 0.22
324 0.13
325 0.11
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.11
335 0.12
336 0.16
337 0.17
338 0.26
339 0.32
340 0.38
341 0.46
342 0.52
343 0.57
344 0.59
345 0.64
346 0.59
347 0.57
348 0.54
349 0.47
350 0.38
351 0.33
352 0.28
353 0.23
354 0.2
355 0.16
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.14
362 0.15
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.16
367 0.15
368 0.13
369 0.12
370 0.1
371 0.09
372 0.06
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.13
384 0.21
385 0.29
386 0.38
387 0.43
388 0.46
389 0.53
390 0.6
391 0.62
392 0.57
393 0.52
394 0.49
395 0.48
396 0.47
397 0.41
398 0.33
399 0.27
400 0.26
401 0.22
402 0.17
403 0.12
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.13
439 0.11
440 0.12
441 0.13
442 0.14
443 0.13
444 0.13
445 0.12
446 0.09
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.14
458 0.14
459 0.17
460 0.16
461 0.19
462 0.19
463 0.27
464 0.26
465 0.26
466 0.28
467 0.24
468 0.24
469 0.22
470 0.2
471 0.13
472 0.12
473 0.11
474 0.09
475 0.08
476 0.05
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.09
490 0.1
491 0.14
492 0.15
493 0.15
494 0.17
495 0.17
496 0.16
497 0.19
498 0.18
499 0.14
500 0.15
501 0.16
502 0.14
503 0.15
504 0.15
505 0.11
506 0.12
507 0.11
508 0.12
509 0.12
510 0.13
511 0.13
512 0.15
513 0.15
514 0.16
515 0.2
516 0.2
517 0.26
518 0.27
519 0.27
520 0.27
521 0.28
522 0.27
523 0.23
524 0.22
525 0.15
526 0.19
527 0.2
528 0.19
529 0.21
530 0.2
531 0.2
532 0.2
533 0.2
534 0.16
535 0.15
536 0.14
537 0.13
538 0.13
539 0.14
540 0.14
541 0.15
542 0.15
543 0.18
544 0.18
545 0.18
546 0.19
547 0.2
548 0.19
549 0.18
550 0.17
551 0.14
552 0.15
553 0.17
554 0.16
555 0.15
556 0.15
557 0.13
558 0.13
559 0.1
560 0.09
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.09
565 0.12
566 0.14
567 0.15
568 0.16
569 0.17
570 0.18
571 0.19
572 0.16
573 0.13
574 0.16
575 0.17
576 0.18
577 0.18
578 0.16
579 0.16
580 0.15
581 0.15
582 0.1
583 0.08
584 0.08
585 0.06
586 0.07
587 0.06
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.04
592 0.06
593 0.08
594 0.09
595 0.09
596 0.11
597 0.13
598 0.14
599 0.15
600 0.14
601 0.14
602 0.14
603 0.2
604 0.2
605 0.2
606 0.24
607 0.29
608 0.33
609 0.37
610 0.36
611 0.31
612 0.32
613 0.31
614 0.26
615 0.2
616 0.15
617 0.1
618 0.09
619 0.08
620 0.05
621 0.05
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.03
627 0.03
628 0.03
629 0.03
630 0.05
631 0.05
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.08
636 0.1
637 0.11
638 0.14
639 0.14
640 0.14
641 0.15
642 0.16
643 0.14
644 0.13
645 0.12
646 0.08
647 0.09
648 0.1
649 0.09
650 0.08
651 0.09
652 0.1
653 0.09
654 0.09
655 0.07
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.04
661 0.06
662 0.08
663 0.09
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.09
669 0.08
670 0.06
671 0.07
672 0.1
673 0.11
674 0.12
675 0.13
676 0.11
677 0.13
678 0.13
679 0.12
680 0.1
681 0.12
682 0.12
683 0.13
684 0.15
685 0.15
686 0.17
687 0.2
688 0.23
689 0.21
690 0.22
691 0.23
692 0.32
693 0.38
694 0.4
695 0.4
696 0.37
697 0.35
698 0.35
699 0.34
700 0.25
701 0.23
702 0.24
703 0.27
704 0.33
705 0.34
706 0.35
707 0.38
708 0.39
709 0.42
710 0.43
711 0.43
712 0.44
713 0.45
714 0.46
715 0.43
716 0.46
717 0.48
718 0.51
719 0.54
720 0.58
721 0.65
722 0.73
723 0.8
724 0.82
725 0.81
726 0.76
727 0.73
728 0.69
729 0.66
730 0.58
731 0.53
732 0.45
733 0.38
734 0.35
735 0.27
736 0.23
737 0.22
738 0.22
739 0.18
740 0.19
741 0.18
742 0.17
743 0.18
744 0.19
745 0.16
746 0.15
747 0.17
748 0.2
749 0.21
750 0.22
751 0.21
752 0.18
753 0.19
754 0.18
755 0.18
756 0.17
757 0.17
758 0.16
759 0.17
760 0.18
761 0.16
762 0.18
763 0.19
764 0.16
765 0.19
766 0.19
767 0.19
768 0.2
769 0.2
770 0.22
771 0.21
772 0.2
773 0.18
774 0.18
775 0.21
776 0.19
777 0.2
778 0.17
779 0.16
780 0.16
781 0.14
782 0.14
783 0.08
784 0.07
785 0.07
786 0.06
787 0.05
788 0.06
789 0.08
790 0.09
791 0.1
792 0.1
793 0.1
794 0.11
795 0.12
796 0.12
797 0.17
798 0.2
799 0.25
800 0.3
801 0.31
802 0.3
803 0.31
804 0.35
805 0.33
806 0.32
807 0.3
808 0.28
809 0.29
810 0.3
811 0.29
812 0.26
813 0.28
814 0.34
815 0.35
816 0.38
817 0.42
818 0.47
819 0.52
820 0.6
821 0.61
822 0.55
823 0.55
824 0.52
825 0.53
826 0.5
827 0.45
828 0.38
829 0.31
830 0.33
831 0.29
832 0.26
833 0.22
834 0.17
835 0.17
836 0.15
837 0.14
838 0.09
839 0.08
840 0.07
841 0.04
842 0.04
843 0.04
844 0.04
845 0.04
846 0.04
847 0.05
848 0.06
849 0.08
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.11
856 0.1
857 0.08
858 0.08
859 0.08
860 0.08
861 0.07
862 0.07
863 0.06
864 0.1
865 0.11
866 0.11
867 0.1
868 0.11
869 0.13
870 0.13
871 0.16
872 0.14
873 0.16
874 0.22
875 0.23
876 0.25
877 0.23
878 0.23
879 0.22
880 0.21
881 0.18
882 0.14
883 0.16
884 0.17
885 0.18
886 0.18
887 0.16
888 0.16
889 0.17
890 0.15
891 0.13
892 0.12
893 0.13
894 0.14
895 0.19
896 0.22
897 0.21
898 0.25
899 0.25
900 0.3
901 0.37
902 0.41
903 0.38
904 0.45
905 0.46
906 0.51
907 0.51
908 0.52
909 0.44
910 0.41
911 0.43
912 0.35
913 0.36
914 0.29
915 0.27
916 0.2
917 0.19
918 0.18
919 0.14
920 0.14
921 0.14
922 0.14
923 0.17
924 0.18
925 0.18
926 0.17
927 0.16
928 0.15
929 0.13
930 0.13
931 0.1
932 0.12
933 0.15
934 0.15
935 0.16
936 0.17
937 0.16
938 0.15
939 0.14
940 0.12
941 0.1
942 0.09
943 0.09
944 0.13
945 0.14
946 0.16
947 0.17
948 0.18
949 0.18
950 0.22
951 0.3
952 0.32
953 0.39
954 0.47
955 0.55
956 0.62
957 0.62
958 0.64
959 0.65
960 0.68
961 0.68
962 0.63
963 0.57
964 0.49
965 0.48
966 0.42
967 0.37
968 0.33
969 0.25
970 0.23
971 0.23
972 0.25
973 0.23
974 0.25
975 0.23
976 0.2
977 0.22
978 0.24
979 0.24
980 0.27
981 0.31
982 0.36
983 0.39
984 0.41
985 0.43
986 0.42
987 0.4
988 0.43
989 0.5
990 0.44
991 0.48
992 0.52
993 0.49
994 0.47
995 0.47
996 0.41
997 0.32
998 0.3
999 0.22
1000 0.15
1001 0.14
1002 0.12
1003 0.11
1004 0.1
1005 0.12
1006 0.2
1007 0.28
1008 0.36
1009 0.47
1010 0.58
1011 0.66
1012 0.74
1013 0.81
1014 0.85
1015 0.85
1016 0.88
1017 0.88
1018 0.83
1019 0.83
1020 0.78
1021 0.74
1022 0.64
1023 0.57
1024 0.46
1025 0.4
1026 0.35
1027 0.29
1028 0.26
1029 0.25
1030 0.25
1031 0.26
1032 0.3
1033 0.31
1034 0.37
1035 0.42
1036 0.48
1037 0.48
1038 0.51
1039 0.55
1040 0.53
1041 0.53
1042 0.45
1043 0.39
1044 0.34
1045 0.3
1046 0.26
1047 0.21
1048 0.18
1049 0.16
1050 0.17
1051 0.18
1052 0.17
1053 0.18
1054 0.17
1055 0.15
1056 0.17
1057 0.14
1058 0.14
1059 0.16
1060 0.16
1061 0.14
1062 0.13
1063 0.14
1064 0.12
1065 0.12
1066 0.1