FuNGI

A0A0L0VTW8

Protein Details

Accession

A0A0L0VTW8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-127	GVAPRAKMNQQRSRRFRASQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKVVEQVIEDVPGQNQVEGGTEEIPIDMSQRNPNGMEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKKPPETEAEMMIEVFKYTERVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRASQEAKVKEEEKQALIEEFIQQGKELPEEYKTDKKAWDSNAITPGTPFMTLLTESLRYWIIYKMNTDKGWSQIQVILSDASVPGEGEHKIMDFVRRQRTQPSYDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFKVLREDVFSDQKKGKGCYTCGQPGHHSSQCQGKPKEKVDEHDTQSKPIERKPFIFLDVKILREYLAIELNLGGLPFPFDLERAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKTNLARMGGYLTDCGELNLKRTEIILEGLASREDDIFRRRREAEERQDQASKRRKIDSDNRQVHIKSSSTNRPQPTVSNQGTPSTLNLPSKPAIPSGNLGQTAVSGIPGLGTTSLSMMSNSDVIKNRFAIRTANMDAAAMLRAELSGTLELPTSSASVDDTPKPSTETSDVTQAESPTQAESTTQVESTTQAESAAPLEAQNPSDPNPTTLETSPSKPSEVGDLEESTDKIQENAASQDPPVGLVEGEADSTIKPATPVHQKRKADELESTDTVIGPIEDSVVLSEDEDEEEAPGDVSVFVPGEPSRPAPLKMLGNNMVEQDDTVKLWEPGYRGRYFRQKFGIELDDEIEKRKIVKYYVEGLAWVLAYYYQGCQSWQWFYPYHYSPFASDFTNLEELEIKFNLGQPFKPYEQLMGVFPTASRSHIPEVYHELMLKDDSPIKDFYPEDFEIDMNGKKMLWQGIALLPFIEQDRLLTSMKACEDNLKAEDKIRNEPGHVVMFCGEAHPQYENFCKIYQKRDNKEAVTLDPARANGVFGSALPDPDCIPGSTFYSPLPTVGLPDISNDKSIFARFFVASQLVPHRSLLLSGVNLERSTLNNHDREVTRRGGSQAQGGNQHHGSDGFHQQRRDFGDGPGIINHYQNHHHSNPGGGGGGGGGGGGHWNGHQQPSRQGWGHAFRNEQPQSNNGHHRDFINRPSAHQQQPQHYPQPHNGYPQGGNHHPQTGSPYGLPTSFGSTNGRGGGGYRPPYGGGGGPTPAPPPQQYYSPPVNNNGSGYIPPVRYGGTGVGGGGPPPQRFIPSFPLPGQPSSTHYSRPGYRPPGILPAVTRMVPNYPSNPLNSNPPPPPHDHSSSSGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.64
3	0.68
4	0.7
5	0.66
6	0.61
7	0.58
8	0.51
9	0.43
10	0.38
11	0.3
12	0.24
13	0.23
14	0.2
15	0.15
16	0.14
17	0.13
18	0.14
19	0.14
20	0.15
21	0.11
22	0.11
23	0.11
24	0.11
25	0.11
26	0.09
27	0.11
28	0.12
29	0.14
30	0.21
31	0.24
32	0.27
33	0.27
34	0.28
35	0.3
36	0.3
37	0.3
38	0.25
39	0.25
40	0.23
41	0.23
42	0.22
43	0.17
44	0.16
45	0.13
46	0.11
47	0.09
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.1
52	0.13
53	0.17
54	0.23
55	0.25
56	0.33
57	0.42
58	0.49
59	0.57
60	0.56
61	0.57
62	0.57
63	0.6
64	0.53
65	0.47
66	0.42
67	0.34
68	0.32
69	0.27
70	0.2
71	0.15
72	0.13
73	0.1
74	0.09
75	0.09
76	0.13
77	0.14
78	0.17
79	0.2
80	0.28
81	0.38
82	0.45
83	0.47
84	0.45
85	0.46
86	0.46
87	0.45
88	0.4
89	0.33
90	0.29
91	0.27
92	0.25
93	0.24
94	0.21
95	0.21
96	0.18
97	0.15
98	0.1
99	0.13
100	0.2
101	0.27
102	0.37
103	0.46
104	0.55
105	0.66
106	0.74
107	0.8
108	0.81
109	0.78
110	0.75
111	0.76
112	0.75
113	0.74
114	0.76
115	0.72
116	0.67
117	0.68
118	0.62
119	0.56
120	0.55
121	0.49
122	0.41
123	0.37
124	0.35
125	0.3
126	0.3
127	0.25
128	0.19
129	0.18
130	0.17
131	0.15
132	0.14
133	0.15
134	0.16
135	0.16
136	0.15
137	0.14
138	0.16
139	0.2
140	0.26
141	0.32
142	0.34
143	0.36
144	0.39
145	0.43
146	0.46
147	0.46
148	0.51
149	0.46
150	0.48
151	0.51
152	0.48
153	0.43
154	0.37
155	0.34
156	0.25
157	0.21
158	0.16
159	0.1
160	0.11
161	0.11
162	0.12
163	0.13
164	0.13
165	0.13
166	0.15
167	0.15
168	0.13
169	0.14
170	0.17
171	0.19
172	0.19
173	0.24
174	0.29
175	0.35
176	0.35
177	0.37
178	0.35
179	0.36
180	0.38
181	0.34
182	0.29
183	0.26
184	0.27
185	0.24
186	0.23
187	0.19
188	0.14
189	0.14
190	0.12
191	0.09
192	0.07
193	0.07
194	0.06
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.16
203	0.21
204	0.28
205	0.37
206	0.41
207	0.43
208	0.5
209	0.55
210	0.56
211	0.58
212	0.6
213	0.59
214	0.65
215	0.66
216	0.61
217	0.61
218	0.54
219	0.47
220	0.39
221	0.31
222	0.24
223	0.24
224	0.21
225	0.15
226	0.14
227	0.14
228	0.11
229	0.1
230	0.08
231	0.04
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.08
238	0.09
239	0.14
240	0.17
241	0.17
242	0.21
243	0.25
244	0.28
245	0.29
246	0.31
247	0.31
248	0.39
249	0.39
250	0.4
251	0.38
252	0.38
253	0.39
254	0.4
255	0.41
256	0.38
257	0.41
258	0.43
259	0.47
260	0.52
261	0.51
262	0.51
263	0.49
264	0.49
265	0.52
266	0.48
267	0.41
268	0.35
269	0.42
270	0.44
271	0.49
272	0.49
273	0.49
274	0.54
275	0.58
276	0.66
277	0.6
278	0.6
279	0.58
280	0.61
281	0.59
282	0.6
283	0.56
284	0.48
285	0.5
286	0.5
287	0.45
288	0.42
289	0.46
290	0.4
291	0.42
292	0.44
293	0.42
294	0.4
295	0.41
296	0.37
297	0.37
298	0.36
299	0.35
300	0.3
301	0.28
302	0.23
303	0.2
304	0.2
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.09
313	0.07
314	0.04
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.08
329	0.07
330	0.05
331	0.04
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.12
346	0.13
347	0.13
348	0.12
349	0.13
350	0.12
351	0.12
352	0.12
353	0.08
354	0.06
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.16
361	0.18
362	0.22
363	0.23
364	0.24
365	0.24
366	0.24
367	0.25
368	0.2
369	0.18
370	0.15
371	0.11
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.11
376	0.11
377	0.13
378	0.15
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.15
383	0.12
384	0.13
385	0.1
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.09
395	0.16
396	0.22
397	0.24
398	0.29
399	0.3
400	0.35
401	0.42
402	0.49
403	0.53
404	0.55
405	0.57
406	0.55
407	0.59
408	0.56
409	0.57
410	0.57
411	0.54
412	0.48
413	0.5
414	0.49
415	0.52
416	0.61
417	0.63
418	0.64
419	0.65
420	0.63
421	0.61
422	0.59
423	0.53
424	0.46
425	0.35
426	0.28
427	0.27
428	0.35
429	0.38
430	0.44
431	0.44
432	0.43
433	0.44
434	0.44
435	0.43
436	0.43
437	0.38
438	0.36
439	0.35
440	0.33
441	0.33
442	0.3
443	0.25
444	0.19
445	0.2
446	0.18
447	0.17
448	0.19
449	0.19
450	0.2
451	0.2
452	0.18
453	0.16
454	0.16
455	0.17
456	0.17
457	0.19
458	0.17
459	0.16
460	0.14
461	0.13
462	0.12
463	0.1
464	0.08
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.03
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.07
480	0.08
481	0.11
482	0.15
483	0.16
484	0.18
485	0.19
486	0.21
487	0.2
488	0.21
489	0.19
490	0.17
491	0.21
492	0.22
493	0.21
494	0.18
495	0.17
496	0.16
497	0.14
498	0.13
499	0.07
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.06
513	0.05
514	0.05
515	0.04
516	0.05
517	0.06
518	0.09
519	0.11
520	0.12
521	0.13
522	0.14
523	0.15
524	0.15
525	0.16
526	0.16
527	0.17
528	0.15
529	0.21
530	0.21
531	0.21
532	0.22
533	0.2
534	0.18
535	0.16
536	0.15
537	0.09
538	0.09
539	0.07
540	0.06
541	0.07
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.1
549	0.09
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.05
557	0.05
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.08
563	0.09
564	0.12
565	0.12
566	0.13
567	0.14
568	0.15
569	0.17
570	0.16
571	0.19
572	0.18
573	0.2
574	0.23
575	0.21
576	0.21
577	0.18
578	0.18
579	0.18
580	0.17
581	0.15
582	0.13
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.13
587	0.09
588	0.1
589	0.08
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.09
595	0.1
596	0.09
597	0.09
598	0.11
599	0.1
600	0.1
601	0.09
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.06
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.09
617	0.19
618	0.28
619	0.37
620	0.45
621	0.47
622	0.48
623	0.56
624	0.54
625	0.45
626	0.39
627	0.36
628	0.32
629	0.31
630	0.3
631	0.22
632	0.2
633	0.18
634	0.15
635	0.09
636	0.04
637	0.04
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.05
649	0.05
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.05
662	0.05
663	0.06
664	0.07
665	0.08
666	0.11
667	0.12
668	0.13
669	0.14
670	0.18
671	0.2
672	0.21
673	0.24
674	0.25
675	0.25
676	0.25
677	0.23
678	0.2
679	0.16
680	0.14
681	0.11
682	0.08
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.08
688	0.1
689	0.1
690	0.14
691	0.19
692	0.22
693	0.23
694	0.27
695	0.37
696	0.37
697	0.4
698	0.42
699	0.38
700	0.36
701	0.38
702	0.37
703	0.27
704	0.26
705	0.22
706	0.18
707	0.17
708	0.18
709	0.15
710	0.12
711	0.12
712	0.14
713	0.15
714	0.14
715	0.18
716	0.19
717	0.24
718	0.26
719	0.25
720	0.22
721	0.2
722	0.19
723	0.15
724	0.12
725	0.06
726	0.04
727	0.04
728	0.05
729	0.05
730	0.06
731	0.06
732	0.07
733	0.08
734	0.1
735	0.13
736	0.14
737	0.16
738	0.16
739	0.18
740	0.24
741	0.26
742	0.27
743	0.26
744	0.25
745	0.23
746	0.24
747	0.24
748	0.18
749	0.16
750	0.14
751	0.15
752	0.16
753	0.15
754	0.13
755	0.15
756	0.14
757	0.15
758	0.15
759	0.12
760	0.1
761	0.14
762	0.18
763	0.16
764	0.16
765	0.18
766	0.23
767	0.23
768	0.25
769	0.22
770	0.2
771	0.2
772	0.21
773	0.18
774	0.15
775	0.14
776	0.11
777	0.11
778	0.13
779	0.11
780	0.12
781	0.12
782	0.13
783	0.16
784	0.19
785	0.2
786	0.19
787	0.25
788	0.26
789	0.26
790	0.24
791	0.21
792	0.18
793	0.18
794	0.16
795	0.11
796	0.13
797	0.13
798	0.14
799	0.16
800	0.15
801	0.18
802	0.19
803	0.18
804	0.21
805	0.21
806	0.21
807	0.2
808	0.19
809	0.17
810	0.19
811	0.18
812	0.12
813	0.12
814	0.1
815	0.1
816	0.12
817	0.13
818	0.11
819	0.1
820	0.11
821	0.14
822	0.15
823	0.14
824	0.12
825	0.1
826	0.1
827	0.11
828	0.09
829	0.06
830	0.06
831	0.07
832	0.1
833	0.11
834	0.11
835	0.11
836	0.13
837	0.15
838	0.16
839	0.15
840	0.17
841	0.18
842	0.2
843	0.22
844	0.22
845	0.21
846	0.24
847	0.28
848	0.26
849	0.31
850	0.33
851	0.32
852	0.31
853	0.32
854	0.31
855	0.31
856	0.28
857	0.23
858	0.18
859	0.18
860	0.16
861	0.15
862	0.12
863	0.08
864	0.09
865	0.1
866	0.1
867	0.12
868	0.16
869	0.18
870	0.19
871	0.2
872	0.26
873	0.28
874	0.38
875	0.45
876	0.51
877	0.55
878	0.62
879	0.66
880	0.61
881	0.63
882	0.55
883	0.47
884	0.44
885	0.39
886	0.32
887	0.28
888	0.26
889	0.22
890	0.19
891	0.18
892	0.11
893	0.1
894	0.09
895	0.07
896	0.11
897	0.1
898	0.1
899	0.1
900	0.11
901	0.11
902	0.12
903	0.13
904	0.1
905	0.11
906	0.12
907	0.15
908	0.15
909	0.16
910	0.14
911	0.17
912	0.17
913	0.15
914	0.16
915	0.12
916	0.13
917	0.13
918	0.15
919	0.11
920	0.13
921	0.17
922	0.16
923	0.18
924	0.16
925	0.17
926	0.17
927	0.18
928	0.17
929	0.13
930	0.16
931	0.14
932	0.14
933	0.15
934	0.15
935	0.14
936	0.15
937	0.21
938	0.2
939	0.21
940	0.21
941	0.2
942	0.19
943	0.19
944	0.18
945	0.14
946	0.11
947	0.13
948	0.14
949	0.14
950	0.14
951	0.15
952	0.14
953	0.13
954	0.17
955	0.21
956	0.26
957	0.26
958	0.27
959	0.32
960	0.33
961	0.37
962	0.37
963	0.35
964	0.31
965	0.32
966	0.34
967	0.33
968	0.32
969	0.34
970	0.33
971	0.31
972	0.37
973	0.37
974	0.38
975	0.34
976	0.33
977	0.27
978	0.24
979	0.23
980	0.19
981	0.27
982	0.31
983	0.34
984	0.36
985	0.36
986	0.41
987	0.45
988	0.46
989	0.38
990	0.31
991	0.35
992	0.33
993	0.34
994	0.31
995	0.28
996	0.23
997	0.24
998	0.24
999	0.2
1000	0.23
1001	0.26
1002	0.31
1003	0.3
1004	0.33
1005	0.31
1006	0.32
1007	0.3
1008	0.26
1009	0.22
1010	0.15
1011	0.13
1012	0.09
1013	0.09
1014	0.06
1015	0.04
1016	0.03
1017	0.02
1018	0.03
1019	0.03
1020	0.04
1021	0.04
1022	0.07
1023	0.09
1024	0.16
1025	0.2
1026	0.22
1027	0.31
1028	0.36
1029	0.42
1030	0.4
1031	0.41
1032	0.43
1033	0.47
1034	0.51
1035	0.48
1036	0.47
1037	0.45
1038	0.53
1039	0.54
1040	0.51
1041	0.45
1042	0.42
1043	0.44
1044	0.47
1045	0.53
1046	0.47
1047	0.47
1048	0.44
1049	0.45
1050	0.48
1051	0.47
1052	0.46
1053	0.46
1054	0.42
1055	0.43
1056	0.49
1057	0.55
1058	0.55
1059	0.57
1060	0.57
1061	0.56
1062	0.65
1063	0.68
1064	0.69
1065	0.67
1066	0.65
1067	0.66
1068	0.68
1069	0.63
1070	0.61
1071	0.57
1072	0.52
1073	0.49
1074	0.49
1075	0.48
1076	0.43
1077	0.43
1078	0.39
1079	0.41
1080	0.36
1081	0.34
1082	0.35
1083	0.31
1084	0.29
1085	0.26
1086	0.26
1087	0.23
1088	0.23
1089	0.24
1090	0.19
1091	0.22
1092	0.2
1093	0.21
1094	0.24
1095	0.24
1096	0.26
1097	0.25
1098	0.24
1099	0.17
1100	0.18
1101	0.22
1102	0.25
1103	0.27
1104	0.26
1105	0.26
1106	0.26
1107	0.27
1108	0.27
1109	0.23
1110	0.18
1111	0.16
1112	0.16
1113	0.16
1114	0.17
1115	0.18
1116	0.19
1117	0.2
1118	0.19
1119	0.24
1120	0.25
1121	0.3
1122	0.33
1123	0.39
1124	0.46
1125	0.5
1126	0.51
1127	0.51
1128	0.53
1129	0.49
1130	0.47
1131	0.42
1132	0.34
1133	0.27
1134	0.28
1135	0.28
1136	0.23
1137	0.22
1138	0.22
1139	0.21
1140	0.19
1141	0.21
1142	0.18
1143	0.14
1144	0.14
1145	0.13
1146	0.14
1147	0.13
1148	0.12
1149	0.16
1150	0.18
1151	0.17
1152	0.2
1153	0.21
1154	0.23
1155	0.25
1156	0.3
1157	0.34
1158	0.36
1159	0.41
1160	0.4
1161	0.47
1162	0.46
1163	0.46
1164	0.45
1165	0.39
1166	0.37
1167	0.38
1168	0.39
1169	0.35
1170	0.36
1171	0.42
1172	0.44
1173	0.49
1174	0.54
1175	0.56
1176	0.58
1177	0.57
1178	0.56
1179	0.57
1180	0.52
1181	0.47
1182	0.39
1183	0.37
1184	0.36
1185	0.33
1186	0.3
1187	0.23
1188	0.26
1189	0.28
1190	0.3
1191	0.28
1192	0.31
1193	0.32
1194	0.36
1195	0.37
1196	0.36
1197	0.41
1198	0.43
1199	0.47
1200	0.47
1201	0.51
1202	0.52
1203	0.55
1204	0.6
1205	0.58
1206	0.58
1207	0.55

A0A0L0VTW8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer