Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HTC2

Protein Details
Accession C6HTC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-75LEDTFGGGRRRRRRRVWPDLSELREWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-64GRRRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044089  Alr1-like  
IPR045861  CorA_cytoplasmic_dom  
IPR002523  MgTranspt_CorA/ZnTranspt_ZntB  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015095  F:magnesium ion transmembrane transporter activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01544  CorA  
CDD cd12829  Alr1p-like  
Amino Acid Sequences MSNSSATSQKFVSPELQRRRTVTLPVEEDVCFPGALSDLGEEDYPPRPPLEDTFGGGRRRRRRRVWPDLSELREWSREEKEERSGGVRAKKIYEPVLIGGRLRPHNARWVREEEDAPYRFTYFNEEFQSTIHSQTISELVQPGQTFRDLFIPDPPELEDDSSDESDDQDPTPHQQHQDNGMDTFNDHRYHGGNLHDAPQNSTDAAAATPKKGTGISEAFPTAKPPKEKRYGPRPTFWLDVLCPTDHEMRVISKAFGIHALTAEDIMVQEAREKVELFRHYYFINYRTFEQDIRSENYLEPVNMYVIVFREGIISFHFSMIPHPANVRRRIRQLKDYLILSADWISYAIIDDITDVFGPLIHSVENEVDDIDDTILQLHSNEKLVTTDSGEGGDGPLPSGSDMLRRVGECRKKVMSLYRLLGNKADVIKGFAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.54
3 0.6
4 0.6
5 0.63
6 0.67
7 0.62
8 0.61
9 0.58
10 0.55
11 0.52
12 0.49
13 0.47
14 0.41
15 0.39
16 0.33
17 0.27
18 0.18
19 0.13
20 0.12
21 0.1
22 0.1
23 0.09
24 0.08
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.13
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.18
36 0.22
37 0.27
38 0.26
39 0.27
40 0.33
41 0.38
42 0.44
43 0.47
44 0.52
45 0.55
46 0.63
47 0.71
48 0.73
49 0.79
50 0.83
51 0.89
52 0.9
53 0.87
54 0.86
55 0.85
56 0.8
57 0.72
58 0.63
59 0.55
60 0.48
61 0.42
62 0.37
63 0.34
64 0.34
65 0.35
66 0.37
67 0.4
68 0.38
69 0.38
70 0.37
71 0.36
72 0.36
73 0.4
74 0.4
75 0.36
76 0.38
77 0.39
78 0.39
79 0.38
80 0.35
81 0.29
82 0.28
83 0.3
84 0.27
85 0.25
86 0.24
87 0.26
88 0.26
89 0.28
90 0.28
91 0.25
92 0.35
93 0.4
94 0.42
95 0.41
96 0.45
97 0.45
98 0.46
99 0.45
100 0.38
101 0.41
102 0.38
103 0.35
104 0.29
105 0.27
106 0.24
107 0.23
108 0.27
109 0.21
110 0.25
111 0.27
112 0.27
113 0.25
114 0.25
115 0.3
116 0.23
117 0.22
118 0.18
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.16
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.16
135 0.14
136 0.15
137 0.19
138 0.21
139 0.2
140 0.2
141 0.2
142 0.17
143 0.16
144 0.16
145 0.12
146 0.1
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.13
158 0.16
159 0.17
160 0.19
161 0.21
162 0.23
163 0.28
164 0.32
165 0.3
166 0.27
167 0.25
168 0.23
169 0.2
170 0.21
171 0.18
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.18
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.19
182 0.21
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.1
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.24
211 0.27
212 0.35
213 0.42
214 0.48
215 0.54
216 0.61
217 0.68
218 0.65
219 0.65
220 0.61
221 0.57
222 0.52
223 0.44
224 0.36
225 0.25
226 0.25
227 0.22
228 0.18
229 0.15
230 0.15
231 0.18
232 0.15
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.15
237 0.15
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.16
262 0.19
263 0.22
264 0.23
265 0.24
266 0.23
267 0.25
268 0.27
269 0.24
270 0.26
271 0.22
272 0.23
273 0.25
274 0.27
275 0.25
276 0.24
277 0.26
278 0.25
279 0.27
280 0.27
281 0.25
282 0.24
283 0.25
284 0.24
285 0.19
286 0.16
287 0.13
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.11
305 0.13
306 0.18
307 0.18
308 0.16
309 0.19
310 0.25
311 0.32
312 0.42
313 0.48
314 0.48
315 0.58
316 0.67
317 0.7
318 0.72
319 0.72
320 0.7
321 0.67
322 0.62
323 0.53
324 0.44
325 0.37
326 0.29
327 0.22
328 0.15
329 0.09
330 0.09
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.09
365 0.1
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.15
375 0.16
376 0.15
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.09
387 0.12
388 0.14
389 0.17
390 0.2
391 0.2
392 0.24
393 0.33
394 0.42
395 0.42
396 0.48
397 0.49
398 0.49
399 0.54
400 0.59
401 0.57
402 0.56
403 0.56
404 0.55
405 0.54
406 0.53
407 0.49
408 0.41
409 0.38
410 0.32
411 0.31
412 0.25
413 0.26