FuNGI

C6HBV0

Protein Details

Accession

C6HBV0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
508-528	EGWSTVSSKQRNNRRGNQTRG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
342-369	LRQKREAEEKAKAEKAEKAEKAEKQKAA

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MFSSFYGGERRTAGGYGNDTGGNERDHRGYSVREELPLPTQPPYTAHIGNLSFEATQADISDLFADCEVTNVRIVEDKMTRAPKGFGYVEFATLEGLKKALSFQGTFLQGRNIRVSVAEPPKERQDTRDYSDWSRKGPLPDAPSQRRVSDRAGFGPRGQDSMSDAGGDRPGRRPFEPADGKVRDYGNWERKGPLSPSLPTASLAREGGRPRSKDGPQFRRASPAWGEARSQDGSRPPRRDFHERPVERAPTAPELDNQWRARMRPDAPPPKQTPSAPEVAPAAAQPAPAQRPKLNLQKRTVEAEPASPTTPGDSKSSPFGGARPIDTSAREREVEEKRQLALRQKREAEEKAKAEKAEKAEKAEKQKAAKEQEQQAKEQEAAKTENLNATIANGSKEDDAGAPQAGKNIEILRRSGNTEETPAAEGSTEAGTSGEKSEPPKEQPREQARQQLPSKTNGNWRNGAPRSRGPSHGHAPPRGPQGQAKAQQPKAAASDPAASPVPAEPEEEGWSTVSSKQRNNRRGNQTRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.24
3	0.23
4	0.23
5	0.22
6	0.21
7	0.23
8	0.23
9	0.21
10	0.2
11	0.21
12	0.22
13	0.24
14	0.26
15	0.27
16	0.28
17	0.31
18	0.37
19	0.36
20	0.35
21	0.34
22	0.34
23	0.36
24	0.37
25	0.33
26	0.27
27	0.27
28	0.26
29	0.27
30	0.28
31	0.29
32	0.26
33	0.25
34	0.27
35	0.27
36	0.27
37	0.25
38	0.23
39	0.16
40	0.15
41	0.15
42	0.1
43	0.09
44	0.09
45	0.09
46	0.08
47	0.08
48	0.1
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.08
54	0.1
55	0.11
56	0.11
57	0.13
58	0.12
59	0.13
60	0.15
61	0.16
62	0.2
63	0.21
64	0.23
65	0.28
66	0.32
67	0.33
68	0.31
69	0.33
70	0.29
71	0.32
72	0.31
73	0.25
74	0.27
75	0.27
76	0.26
77	0.24
78	0.23
79	0.17
80	0.17
81	0.17
82	0.1
83	0.09
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.11
88	0.13
89	0.13
90	0.14
91	0.2
92	0.24
93	0.24
94	0.24
95	0.29
96	0.29
97	0.31
98	0.32
99	0.27
100	0.23
101	0.23
102	0.24
103	0.25
104	0.3
105	0.33
106	0.32
107	0.35
108	0.43
109	0.48
110	0.47
111	0.43
112	0.44
113	0.44
114	0.48
115	0.52
116	0.49
117	0.5
118	0.58
119	0.55
120	0.49
121	0.48
122	0.46
123	0.42
124	0.41
125	0.41
126	0.37
127	0.43
128	0.51
129	0.51
130	0.55
131	0.53
132	0.52
133	0.5
134	0.47
135	0.45
136	0.41
137	0.38
138	0.38
139	0.41
140	0.39
141	0.37
142	0.39
143	0.34
144	0.29
145	0.26
146	0.2
147	0.17
148	0.18
149	0.17
150	0.12
151	0.12
152	0.11
153	0.15
154	0.15
155	0.14
156	0.19
157	0.24
158	0.27
159	0.27
160	0.3
161	0.29
162	0.38
163	0.42
164	0.39
165	0.43
166	0.42
167	0.42
168	0.42
169	0.4
170	0.31
171	0.3
172	0.37
173	0.37
174	0.38
175	0.38
176	0.37
177	0.38
178	0.41
179	0.37
180	0.33
181	0.28
182	0.25
183	0.27
184	0.27
185	0.26
186	0.23
187	0.22
188	0.17
189	0.15
190	0.15
191	0.13
192	0.15
193	0.17
194	0.24
195	0.29
196	0.3
197	0.32
198	0.38
199	0.41
200	0.46
201	0.54
202	0.55
203	0.56
204	0.6
205	0.57
206	0.57
207	0.53
208	0.49
209	0.41
210	0.38
211	0.34
212	0.3
213	0.3
214	0.23
215	0.27
216	0.23
217	0.21
218	0.16
219	0.2
220	0.28
221	0.35
222	0.4
223	0.38
224	0.43
225	0.49
226	0.57
227	0.55
228	0.56
229	0.6
230	0.55
231	0.58
232	0.58
233	0.54
234	0.45
235	0.4
236	0.33
237	0.25
238	0.26
239	0.21
240	0.16
241	0.18
242	0.22
243	0.27
244	0.25
245	0.25
246	0.25
247	0.25
248	0.27
249	0.28
250	0.27
251	0.28
252	0.38
253	0.45
254	0.46
255	0.53
256	0.53
257	0.53
258	0.53
259	0.46
260	0.4
261	0.33
262	0.34
263	0.27
264	0.24
265	0.2
266	0.17
267	0.17
268	0.12
269	0.11
270	0.07
271	0.08
272	0.07
273	0.09
274	0.13
275	0.14
276	0.17
277	0.17
278	0.21
279	0.27
280	0.37
281	0.42
282	0.45
283	0.48
284	0.52
285	0.53
286	0.53
287	0.48
288	0.41
289	0.34
290	0.3
291	0.27
292	0.22
293	0.21
294	0.16
295	0.15
296	0.14
297	0.15
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.14
302	0.17
303	0.18
304	0.18
305	0.16
306	0.16
307	0.18
308	0.18
309	0.18
310	0.16
311	0.17
312	0.17
313	0.19
314	0.21
315	0.19
316	0.21
317	0.2
318	0.19
319	0.25
320	0.31
321	0.36
322	0.36
323	0.35
324	0.33
325	0.37
326	0.39
327	0.41
328	0.44
329	0.45
330	0.49
331	0.5
332	0.52
333	0.54
334	0.57
335	0.53
336	0.51
337	0.49
338	0.47
339	0.47
340	0.44
341	0.4
342	0.39
343	0.39
344	0.4
345	0.37
346	0.38
347	0.41
348	0.46
349	0.53
350	0.56
351	0.55
352	0.51
353	0.55
354	0.56
355	0.57
356	0.58
357	0.56
358	0.58
359	0.61
360	0.59
361	0.55
362	0.51
363	0.45
364	0.41
365	0.37
366	0.3
367	0.24
368	0.25
369	0.24
370	0.23
371	0.22
372	0.22
373	0.19
374	0.18
375	0.15
376	0.13
377	0.14
378	0.13
379	0.13
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.13
392	0.13
393	0.12
394	0.13
395	0.16
396	0.19
397	0.2
398	0.21
399	0.22
400	0.23
401	0.26
402	0.26
403	0.27
404	0.24
405	0.26
406	0.25
407	0.23
408	0.23
409	0.2
410	0.18
411	0.14
412	0.12
413	0.11
414	0.1
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.07
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.15
424	0.2
425	0.25
426	0.32
427	0.42
428	0.46
429	0.51
430	0.6
431	0.66
432	0.7
433	0.71
434	0.74
435	0.68
436	0.72
437	0.7
438	0.69
439	0.62
440	0.6
441	0.59
442	0.53
443	0.59
444	0.56
445	0.57
446	0.52
447	0.52
448	0.56
449	0.57
450	0.59
451	0.55
452	0.55
453	0.57
454	0.57
455	0.61
456	0.57
457	0.59
458	0.58
459	0.6
460	0.6
461	0.57
462	0.57
463	0.56
464	0.59
465	0.54
466	0.5
467	0.47
468	0.48
469	0.52
470	0.55
471	0.58
472	0.59
473	0.59
474	0.6
475	0.57
476	0.52
477	0.47
478	0.43
479	0.35
480	0.28
481	0.3
482	0.26
483	0.29
484	0.26
485	0.21
486	0.19
487	0.19
488	0.21
489	0.17
490	0.19
491	0.16
492	0.18
493	0.21
494	0.22
495	0.21
496	0.17
497	0.18
498	0.18
499	0.22
500	0.27
501	0.3
502	0.37
503	0.46
504	0.55
505	0.64
506	0.73
507	0.78
508	0.82

C6HBV0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer