Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HMJ8

Protein Details
Accession C6HMJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-187KVLQTPKEEKEKKKEKKATGQGGABasic
224-249AVDPPREKKEKKQKQPKQQKQPAAPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-183EEKEKKKEKKATG
226-241DPPREKKEKKQKQPKQ
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 12.833, cyto 10, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036282  Glutathione-S-Trfase_C_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50886  TRBD  
CDD cd10304  GST_C_Arc1p_N_like  
cd02799  tRNA_bind_EMAP-II_like  
Amino Acid Sequences MATAAAPMTSLLSLLYRSFPRAVPSTSIDLDLQKVSPKIFPSCVYSDAEQVEMDQWLVNIASATDILAKADSTALSEFLTALNKHLATRTTLLGTKPSVADISVYAVLGPVVEKWSADERTGENGYHHIVRYIDFVQNAPLFGLKIPAEEKIEIDVDDVKVVPKVLQTPKEEKEKKKEKKATGQGGAEKSIVVGRGKNNSNSNSQSENGKGKGKEAAEPAATGAVDPPREKKEKKQKQPKQQKQPAAPVAPLSPSLIDLRVGHILRAVNHPNADSLYVSTINCGDAPGTDNTSVDEETGLTVRTVCSGLNGLIPLEEMQNRKIVAVCNLKPVTMRGIKSAAMVLAASPKSDDAHAGPVELVRPPVDAQTGERVFFEGWSAGEPEKVLNPKKKIWETFQPGFTTTEALEVAFDSSQVPQLAEKEGEASSTPTTVATIGKLVTKSGGLFSTGWSIDVDMTADMGQETTRDFSYSKKALREA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.15
3 0.15
4 0.19
5 0.22
6 0.23
7 0.27
8 0.31
9 0.33
10 0.33
11 0.35
12 0.37
13 0.36
14 0.36
15 0.32
16 0.29
17 0.28
18 0.25
19 0.22
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.23
24 0.26
25 0.28
26 0.3
27 0.31
28 0.33
29 0.34
30 0.36
31 0.36
32 0.33
33 0.33
34 0.3
35 0.29
36 0.22
37 0.2
38 0.18
39 0.14
40 0.13
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.14
67 0.12
68 0.13
69 0.16
70 0.17
71 0.17
72 0.2
73 0.2
74 0.19
75 0.22
76 0.22
77 0.21
78 0.24
79 0.24
80 0.25
81 0.25
82 0.23
83 0.21
84 0.2
85 0.17
86 0.14
87 0.14
88 0.11
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.09
102 0.15
103 0.16
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.24
108 0.25
109 0.23
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.21
114 0.19
115 0.15
116 0.14
117 0.15
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.16
122 0.16
123 0.19
124 0.19
125 0.18
126 0.15
127 0.13
128 0.11
129 0.1
130 0.13
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.13
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.1
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.15
152 0.2
153 0.26
154 0.3
155 0.37
156 0.41
157 0.51
158 0.58
159 0.57
160 0.63
161 0.68
162 0.72
163 0.76
164 0.81
165 0.78
166 0.81
167 0.84
168 0.82
169 0.77
170 0.73
171 0.67
172 0.6
173 0.53
174 0.43
175 0.33
176 0.24
177 0.18
178 0.15
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.19
183 0.22
184 0.26
185 0.3
186 0.3
187 0.34
188 0.35
189 0.36
190 0.31
191 0.3
192 0.28
193 0.27
194 0.28
195 0.25
196 0.27
197 0.24
198 0.23
199 0.26
200 0.25
201 0.25
202 0.24
203 0.24
204 0.19
205 0.19
206 0.18
207 0.14
208 0.13
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.12
215 0.16
216 0.22
217 0.24
218 0.32
219 0.42
220 0.52
221 0.62
222 0.7
223 0.75
224 0.81
225 0.91
226 0.91
227 0.91
228 0.9
229 0.86
230 0.81
231 0.8
232 0.75
233 0.65
234 0.55
235 0.44
236 0.36
237 0.29
238 0.23
239 0.15
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.14
251 0.14
252 0.15
253 0.2
254 0.21
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.17
259 0.16
260 0.15
261 0.11
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.06
272 0.05
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.09
282 0.08
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.1
304 0.11
305 0.12
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.2
312 0.28
313 0.28
314 0.34
315 0.34
316 0.34
317 0.33
318 0.32
319 0.32
320 0.29
321 0.29
322 0.23
323 0.25
324 0.25
325 0.25
326 0.24
327 0.17
328 0.12
329 0.11
330 0.08
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.13
339 0.09
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.21
356 0.22
357 0.22
358 0.21
359 0.21
360 0.2
361 0.19
362 0.18
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.12
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.15
372 0.22
373 0.28
374 0.34
375 0.39
376 0.44
377 0.54
378 0.61
379 0.61
380 0.61
381 0.65
382 0.65
383 0.67
384 0.66
385 0.58
386 0.52
387 0.48
388 0.41
389 0.33
390 0.24
391 0.19
392 0.14
393 0.12
394 0.11
395 0.09
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.07
400 0.08
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.17
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.14
411 0.15
412 0.14
413 0.15
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.15
428 0.16
429 0.15
430 0.16
431 0.16
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.2
436 0.19
437 0.19
438 0.16
439 0.16
440 0.14
441 0.14
442 0.14
443 0.08
444 0.09
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.08
452 0.1
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.17
457 0.26
458 0.34
459 0.38