Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HLA4

Protein Details
Accession C6HLA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-67RELERERKKAEKMKKFAEKKAKSBasic
72-95PAPAPKTSEKKPKVEKEKNVDAYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-87KSERELERERKKAEKMKKFAEKKAKSGSAAPAPAPKTSEKKPKVEK
Subcellular Location(s) cyto 18, cyto_nucl 13.5, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001412  aa-tRNA-synth_I_CS  
IPR002300  aa-tRNA-synth_Ia  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR009008  Val/Leu/Ile-tRNA-synth_edit  
IPR002303  Valyl-tRNA_ligase  
Gene Ontology GO:0002161  F:aminoacyl-tRNA editing activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004832  F:valine-tRNA ligase activity  
GO:0006438  P:valyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00133  tRNA-synt_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00178  AA_TRNA_LIGASE_I  
Amino Acid Sequences MTSNLADQTPAPQQAAAPVALTNENGTAKNVAIGTQEVQKGKSERELERERKKAEKMKKFAEKKAKSGSAAPAPAPKTSEKKPKVEKEKNVDAYDPLTIESGRYEWWEAQGFFKPEFGPDGKVKPEGKFVIPIPPPNVTGDLHMGHALTNALQDTMIRWQRMKGKTVLWLPGYDHAGISTQSVVEKILWKTEGKTRHDVGRDVMTNMIWDWTHKYHDSITSTLKRLGGSFDWTREAFTMDENLSAAVTETFVRLHEEGTIYRANRLVNWCVALNTSLSNLEVENKDLEGRTLLDVPGYQRKVEFGVLTHFLYPIEGTDETIQVATTRPETMLGDTGIAVHPDDKRYQKYLGKFAKHPFLERLLPIFADVNVDPEFGTGAVKITPAHDFNDFIRGKDNNLEFISIMNDDGTFNANAGPFAGEKRFDARYKVIEALKEKGLQTISSNQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.21
4 0.16
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.18
17 0.17
18 0.15
19 0.14
20 0.16
21 0.16
22 0.21
23 0.26
24 0.24
25 0.25
26 0.3
27 0.31
28 0.32
29 0.38
30 0.38
31 0.38
32 0.46
33 0.56
34 0.6
35 0.67
36 0.72
37 0.69
38 0.7
39 0.75
40 0.75
41 0.75
42 0.76
43 0.74
44 0.76
45 0.82
46 0.83
47 0.84
48 0.85
49 0.8
50 0.77
51 0.78
52 0.73
53 0.65
54 0.62
55 0.59
56 0.55
57 0.52
58 0.46
59 0.43
60 0.39
61 0.38
62 0.36
63 0.34
64 0.33
65 0.39
66 0.48
67 0.48
68 0.56
69 0.65
70 0.73
71 0.79
72 0.83
73 0.84
74 0.82
75 0.86
76 0.84
77 0.76
78 0.67
79 0.57
80 0.48
81 0.4
82 0.31
83 0.21
84 0.14
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.11
93 0.15
94 0.19
95 0.18
96 0.21
97 0.26
98 0.26
99 0.25
100 0.26
101 0.23
102 0.19
103 0.23
104 0.21
105 0.2
106 0.21
107 0.25
108 0.25
109 0.31
110 0.33
111 0.3
112 0.35
113 0.33
114 0.31
115 0.32
116 0.3
117 0.33
118 0.33
119 0.35
120 0.31
121 0.3
122 0.29
123 0.27
124 0.28
125 0.19
126 0.19
127 0.19
128 0.17
129 0.15
130 0.15
131 0.13
132 0.11
133 0.11
134 0.09
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.13
143 0.17
144 0.18
145 0.18
146 0.22
147 0.31
148 0.35
149 0.37
150 0.33
151 0.32
152 0.37
153 0.41
154 0.41
155 0.33
156 0.31
157 0.28
158 0.28
159 0.28
160 0.21
161 0.17
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.14
176 0.14
177 0.16
178 0.21
179 0.28
180 0.28
181 0.34
182 0.34
183 0.38
184 0.4
185 0.39
186 0.35
187 0.33
188 0.29
189 0.25
190 0.23
191 0.17
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.07
196 0.06
197 0.09
198 0.1
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.18
204 0.2
205 0.19
206 0.23
207 0.24
208 0.25
209 0.26
210 0.26
211 0.22
212 0.2
213 0.21
214 0.16
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.17
221 0.15
222 0.16
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.12
246 0.15
247 0.13
248 0.14
249 0.16
250 0.15
251 0.16
252 0.2
253 0.19
254 0.17
255 0.18
256 0.17
257 0.15
258 0.16
259 0.13
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.1
274 0.11
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.13
283 0.2
284 0.2
285 0.19
286 0.18
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.18
291 0.11
292 0.14
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.15
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.13
329 0.18
330 0.23
331 0.27
332 0.3
333 0.37
334 0.4
335 0.45
336 0.53
337 0.56
338 0.57
339 0.59
340 0.61
341 0.64
342 0.59
343 0.57
344 0.5
345 0.47
346 0.44
347 0.4
348 0.37
349 0.29
350 0.27
351 0.24
352 0.21
353 0.16
354 0.16
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.08
363 0.09
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.13
371 0.14
372 0.16
373 0.17
374 0.19
375 0.19
376 0.29
377 0.27
378 0.24
379 0.28
380 0.27
381 0.28
382 0.34
383 0.34
384 0.3
385 0.31
386 0.31
387 0.25
388 0.25
389 0.25
390 0.17
391 0.16
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.1
396 0.12
397 0.1
398 0.09
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.1
405 0.14
406 0.16
407 0.16
408 0.17
409 0.22
410 0.27
411 0.28
412 0.33
413 0.35
414 0.37
415 0.4
416 0.45
417 0.44
418 0.45
419 0.46
420 0.45
421 0.44
422 0.44
423 0.4
424 0.38
425 0.36
426 0.3
427 0.31