FuNGI

C6HLV1

Protein Details

Accession

C6HLV1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-50	VLPPKDIRNRVRDKERSNPKFSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 8, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045146 SF3A1 IPR022030 SF3A1_dom IPR000061 Surp IPR035967 SWAP/Surp_sf
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF12230 PRP21_like_P PF01805 Surp
PROSITE	View protein in PROSITE PS50128 SURP

Amino Acid Sequences

MAPSVTNGSVATPPGLPEEVSKPPEDIVLPPKDIRNRVRDKERSNPKFSFLNPSDAYAAFYSWRLSEIKAGRGTAISAGRAGEPVAAPEPEKPKGPAQPPEFHYSARMPNINALDFEVVKLTALFVAKRGKSFMTALSQRETRNFQFDFLRPQHSLYQFFTRLVDQYTSLLQVDESDGSNSMSSRIAELERNVKDKYHILDRAKQRAEWVKFQQQQKQKKEEQEEQERIAYAQIDWHDFVVVETVLFTEADDQAELPLPTTLNDLQTASLEQKAMMSLQPHDRRIEEAMPTDEETTYYDAYPRSQDVSSPAPQHPIPVPVTADHQQPSPFAPKSPTPISTPTTPMTAPYVSEEEDRIRERQQEREQAQSAQAAARAIPTPPPGSTQQPMRIRADYVPRAQAKRLNTTAAPTTLCPNCRQQIPINEIDHHMRIELQDPRWKEQRAKAEARYATTNLSTADVFNNLKRLASQRTDVFDPSLSAVDSPGATAGSGRQEDNGSGSLDPDEEARRKRAATGMGIGGMPPGVPGYEPAPGQSQAPDGKAQTQGPHIPGHPPPGGPPPPGQTVNIEEQIRHIHQKFKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.15
4	0.17
5	0.21
6	0.27
7	0.29
8	0.29
9	0.27
10	0.27
11	0.29
12	0.27
13	0.26
14	0.27
15	0.3
16	0.32
17	0.34
18	0.4
19	0.45
20	0.52
21	0.54
22	0.57
23	0.61
24	0.67
25	0.75
26	0.78
27	0.78
28	0.81
29	0.85
30	0.83
31	0.81
32	0.74
33	0.68
34	0.64
35	0.59
36	0.59
37	0.5
38	0.5
39	0.43
40	0.43
41	0.41
42	0.36
43	0.37
44	0.26
45	0.24
46	0.17
47	0.17
48	0.15
49	0.12
50	0.15
51	0.13
52	0.14
53	0.21
54	0.24
55	0.3
56	0.32
57	0.32
58	0.31
59	0.3
60	0.3
61	0.26
62	0.24
63	0.18
64	0.16
65	0.16
66	0.15
67	0.15
68	0.15
69	0.11
70	0.09
71	0.11
72	0.12
73	0.12
74	0.13
75	0.18
76	0.23
77	0.23
78	0.26
79	0.27
80	0.31
81	0.38
82	0.44
83	0.48
84	0.5
85	0.56
86	0.58
87	0.61
88	0.57
89	0.49
90	0.46
91	0.4
92	0.4
93	0.37
94	0.35
95	0.29
96	0.33
97	0.36
98	0.32
99	0.28
100	0.24
101	0.21
102	0.18
103	0.18
104	0.14
105	0.11
106	0.1
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.09
111	0.09
112	0.12
113	0.2
114	0.21
115	0.22
116	0.24
117	0.23
118	0.24
119	0.26
120	0.25
121	0.26
122	0.3
123	0.31
124	0.34
125	0.36
126	0.35
127	0.37
128	0.4
129	0.33
130	0.36
131	0.34
132	0.31
133	0.33
134	0.34
135	0.39
136	0.37
137	0.4
138	0.33
139	0.36
140	0.4
141	0.38
142	0.4
143	0.34
144	0.38
145	0.34
146	0.34
147	0.33
148	0.27
149	0.25
150	0.23
151	0.21
152	0.14
153	0.14
154	0.14
155	0.14
156	0.13
157	0.12
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.1
173	0.11
174	0.12
175	0.15
176	0.21
177	0.23
178	0.26
179	0.26
180	0.25
181	0.26
182	0.27
183	0.29
184	0.29
185	0.33
186	0.34
187	0.42
188	0.49
189	0.56
190	0.54
191	0.5
192	0.48
193	0.5
194	0.5
195	0.49
196	0.49
197	0.49
198	0.54
199	0.58
200	0.61
201	0.61
202	0.67
203	0.68
204	0.7
205	0.66
206	0.68
207	0.7
208	0.7
209	0.7
210	0.7
211	0.65
212	0.58
213	0.53
214	0.46
215	0.38
216	0.31
217	0.22
218	0.12
219	0.11
220	0.1
221	0.11
222	0.11
223	0.11
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.08
228	0.07
229	0.05
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.07
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.1
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.09
265	0.17
266	0.22
267	0.23
268	0.24
269	0.24
270	0.24
271	0.26
272	0.26
273	0.18
274	0.16
275	0.16
276	0.16
277	0.16
278	0.15
279	0.12
280	0.11
281	0.1
282	0.1
283	0.09
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.13
294	0.18
295	0.2
296	0.23
297	0.22
298	0.23
299	0.23
300	0.24
301	0.21
302	0.21
303	0.19
304	0.16
305	0.16
306	0.14
307	0.18
308	0.18
309	0.19
310	0.16
311	0.17
312	0.16
313	0.16
314	0.17
315	0.19
316	0.18
317	0.17
318	0.19
319	0.19
320	0.25
321	0.27
322	0.27
323	0.24
324	0.28
325	0.3
326	0.29
327	0.3
328	0.25
329	0.24
330	0.22
331	0.2
332	0.19
333	0.16
334	0.14
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.13
339	0.14
340	0.13
341	0.16
342	0.17
343	0.17
344	0.18
345	0.24
346	0.26
347	0.34
348	0.4
349	0.46
350	0.46
351	0.51
352	0.51
353	0.45
354	0.44
355	0.36
356	0.29
357	0.2
358	0.19
359	0.12
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.1
365	0.12
366	0.12
367	0.12
368	0.16
369	0.17
370	0.21
371	0.24
372	0.27
373	0.34
374	0.38
375	0.42
376	0.43
377	0.41
378	0.39
379	0.39
380	0.43
381	0.39
382	0.36
383	0.39
384	0.4
385	0.41
386	0.42
387	0.43
388	0.38
389	0.41
390	0.4
391	0.36
392	0.31
393	0.32
394	0.32
395	0.3
396	0.27
397	0.2
398	0.23
399	0.23
400	0.25
401	0.24
402	0.28
403	0.29
404	0.31
405	0.33
406	0.35
407	0.39
408	0.43
409	0.47
410	0.44
411	0.42
412	0.42
413	0.41
414	0.36
415	0.28
416	0.22
417	0.16
418	0.14
419	0.18
420	0.22
421	0.23
422	0.27
423	0.3
424	0.35
425	0.42
426	0.44
427	0.45
428	0.47
429	0.53
430	0.56
431	0.6
432	0.59
433	0.61
434	0.6
435	0.57
436	0.53
437	0.44
438	0.38
439	0.31
440	0.28
441	0.2
442	0.19
443	0.16
444	0.13
445	0.13
446	0.14
447	0.15
448	0.15
449	0.2
450	0.18
451	0.18
452	0.19
453	0.23
454	0.26
455	0.28
456	0.32
457	0.31
458	0.36
459	0.38
460	0.37
461	0.34
462	0.28
463	0.26
464	0.22
465	0.19
466	0.14
467	0.12
468	0.11
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.07
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.08
477	0.12
478	0.14
479	0.14
480	0.15
481	0.16
482	0.17
483	0.19
484	0.19
485	0.15
486	0.14
487	0.14
488	0.13
489	0.12
490	0.12
491	0.12
492	0.16
493	0.2
494	0.24
495	0.28
496	0.3
497	0.31
498	0.33
499	0.37
500	0.36
501	0.34
502	0.35
503	0.33
504	0.31
505	0.3
506	0.27
507	0.22
508	0.16
509	0.12
510	0.07
511	0.06
512	0.04
513	0.05
514	0.06
515	0.08
516	0.12
517	0.12
518	0.14
519	0.17
520	0.18
521	0.19
522	0.18
523	0.22
524	0.21
525	0.24
526	0.25
527	0.23
528	0.27
529	0.31
530	0.32
531	0.3
532	0.33
533	0.36
534	0.35
535	0.38
536	0.35
537	0.36
538	0.37
539	0.4
540	0.36
541	0.32
542	0.33
543	0.39
544	0.42
545	0.39
546	0.4
547	0.39
548	0.43
549	0.44
550	0.42
551	0.37
552	0.38
553	0.41
554	0.43
555	0.39
556	0.32
557	0.33
558	0.39
559	0.39
560	0.42
561	0.39

C6HLV1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer