Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0W1J4

Protein Details
Accession A0A0L0W1J4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-188SPDGRSRRVDRSRHKSRHDRSRSRSRSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-204RDRDRPRDRERGQDHSKSNDRDADRDRDRHRERPRDGDGKRRNLDRPARDSTASGNRDREYRDRDRSRSPDGRSRRVDRSRHKSRHDRSRSRSRSGSPGPGRRGGRARSGDR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MRGGPSRYESRAGSPGDERAKDSSSRSQRESSVKERERSSRARDADRDRNRYRDRDGRDRDSPPIRDRGRDYVDRDLDRDRDGDRDRPRDPDRDRDRPRDRERGQDHSKSNDRDADRDRDRHRERPRDGDGKRRNLDRPARDSTASGNRDREYRDRDRSRSPDGRSRRVDRSRHKSRHDRSRSRSRSGSPGPGRRGGRARSGDRSSPDGTRRPDSGIAMDVDPNVEDEDEEAKMARMMGFSALTTTKGKHVSGNDEAGTVDVVKVRTWRQYMNRRGGFNRPLDKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.42
4 0.41
5 0.39
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.38
10 0.41
11 0.44
12 0.49
13 0.5
14 0.51
15 0.54
16 0.6
17 0.62
18 0.6
19 0.61
20 0.63
21 0.64
22 0.65
23 0.66
24 0.65
25 0.65
26 0.65
27 0.63
28 0.62
29 0.64
30 0.67
31 0.68
32 0.71
33 0.74
34 0.76
35 0.71
36 0.75
37 0.74
38 0.71
39 0.71
40 0.68
41 0.67
42 0.68
43 0.72
44 0.69
45 0.7
46 0.67
47 0.67
48 0.66
49 0.64
50 0.57
51 0.59
52 0.53
53 0.51
54 0.52
55 0.53
56 0.51
57 0.51
58 0.51
59 0.51
60 0.55
61 0.51
62 0.49
63 0.44
64 0.4
65 0.35
66 0.32
67 0.23
68 0.24
69 0.26
70 0.32
71 0.36
72 0.41
73 0.41
74 0.48
75 0.51
76 0.53
77 0.54
78 0.56
79 0.57
80 0.62
81 0.68
82 0.7
83 0.76
84 0.77
85 0.8
86 0.8
87 0.74
88 0.73
89 0.71
90 0.7
91 0.68
92 0.66
93 0.61
94 0.58
95 0.62
96 0.54
97 0.52
98 0.48
99 0.42
100 0.4
101 0.41
102 0.43
103 0.41
104 0.46
105 0.46
106 0.5
107 0.55
108 0.59
109 0.64
110 0.65
111 0.63
112 0.64
113 0.68
114 0.67
115 0.64
116 0.65
117 0.64
118 0.63
119 0.63
120 0.59
121 0.54
122 0.53
123 0.59
124 0.54
125 0.52
126 0.49
127 0.47
128 0.44
129 0.41
130 0.37
131 0.38
132 0.35
133 0.3
134 0.28
135 0.26
136 0.27
137 0.3
138 0.31
139 0.3
140 0.35
141 0.43
142 0.47
143 0.51
144 0.56
145 0.58
146 0.61
147 0.61
148 0.58
149 0.57
150 0.57
151 0.62
152 0.61
153 0.62
154 0.63
155 0.65
156 0.69
157 0.7
158 0.74
159 0.76
160 0.77
161 0.8
162 0.81
163 0.82
164 0.84
165 0.85
166 0.84
167 0.82
168 0.85
169 0.83
170 0.79
171 0.75
172 0.67
173 0.65
174 0.6
175 0.62
176 0.58
177 0.6
178 0.57
179 0.59
180 0.58
181 0.53
182 0.55
183 0.48
184 0.48
185 0.47
186 0.48
187 0.49
188 0.52
189 0.51
190 0.47
191 0.49
192 0.43
193 0.41
194 0.41
195 0.4
196 0.4
197 0.4
198 0.39
199 0.37
200 0.37
201 0.33
202 0.3
203 0.26
204 0.23
205 0.2
206 0.19
207 0.15
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.18
234 0.21
235 0.22
236 0.24
237 0.28
238 0.32
239 0.36
240 0.39
241 0.34
242 0.31
243 0.31
244 0.26
245 0.23
246 0.16
247 0.12
248 0.1
249 0.11
250 0.12
251 0.16
252 0.18
253 0.25
254 0.28
255 0.36
256 0.43
257 0.53
258 0.62
259 0.69
260 0.72
261 0.71
262 0.71
263 0.73
264 0.7
265 0.69