FuNGI

C6HC10

Protein Details

Accession

C6HC10

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
483-512	DSNSPFRKLREKAVSQRKRQNSRLIPPFSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006941 RNase_CAF1 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF04857 CAF1

Amino Acid Sequences

MDVTKQSFSQHLPRLLNDLAESTFVALDLEFSGIVARQSGPNPGSDLWGEKQTLQARYEEVKYAAETYQVLQIGLTFAREDTETDMDPESQAFLTQVRRLIDAWINETGDKEDYLNIPEPCPLENGNTESPLGSWRFSLNSYQKRLVHQLVRVEYPSLVSIGRQTFVQIIPYDKQREESIRVDKSRALRERVIQKTGFRWIVEGMVGGGLSAMDPRVFLSCISNSAPVNTSTSALLRYSDDLQLKLKSRQPVLVGHNLFTDLINFYKCFIGDLPDRIEDFKNAIHALFPLVIDTKYMATHNCSSMTPSSSLTEINDKLEQRRTPRILLDPEHDKYVDEKPLHEAGYDSLLTAKVLIRLAAELLGEGTISSPSSPPITESIVLDSWPRTPLKTTSSIRKRIENKGEKLIDVDEPDCSDSKSFSSSTSVMSIFNRPPIRKDKSTPKQAPVDWRTESEVCRIRSLFSEQPADGENGTLKSQLLSLDSNSPFRKLREKAVSQRKRQNSRLIPPFSDDFWDSYGNKLRVFGTLEEICDLN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.47
3	0.44
4	0.35
5	0.29
6	0.22
7	0.2
8	0.18
9	0.13
10	0.12
11	0.11
12	0.1
13	0.07
14	0.08
15	0.07
16	0.08
17	0.06
18	0.06
19	0.07
20	0.07
21	0.08
22	0.08
23	0.09
24	0.12
25	0.13
26	0.2
27	0.2
28	0.21
29	0.24
30	0.23
31	0.25
32	0.23
33	0.26
34	0.22
35	0.26
36	0.26
37	0.23
38	0.3
39	0.33
40	0.36
41	0.33
42	0.32
43	0.32
44	0.35
45	0.37
46	0.33
47	0.28
48	0.25
49	0.25
50	0.26
51	0.22
52	0.19
53	0.17
54	0.15
55	0.19
56	0.17
57	0.16
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.13
62	0.12
63	0.08
64	0.07
65	0.09
66	0.09
67	0.1
68	0.12
69	0.15
70	0.15
71	0.16
72	0.18
73	0.17
74	0.17
75	0.16
76	0.13
77	0.1
78	0.1
79	0.09
80	0.1
81	0.14
82	0.16
83	0.2
84	0.2
85	0.21
86	0.21
87	0.25
88	0.27
89	0.25
90	0.26
91	0.25
92	0.24
93	0.23
94	0.23
95	0.21
96	0.17
97	0.16
98	0.13
99	0.12
100	0.12
101	0.16
102	0.21
103	0.2
104	0.19
105	0.22
106	0.22
107	0.2
108	0.22
109	0.19
110	0.16
111	0.18
112	0.23
113	0.22
114	0.22
115	0.21
116	0.19
117	0.18
118	0.19
119	0.18
120	0.13
121	0.12
122	0.12
123	0.14
124	0.15
125	0.23
126	0.29
127	0.36
128	0.41
129	0.47
130	0.48
131	0.51
132	0.55
133	0.54
134	0.49
135	0.45
136	0.46
137	0.43
138	0.42
139	0.39
140	0.34
141	0.27
142	0.23
143	0.19
144	0.13
145	0.1
146	0.08
147	0.12
148	0.12
149	0.12
150	0.11
151	0.12
152	0.13
153	0.13
154	0.16
155	0.12
156	0.15
157	0.17
158	0.23
159	0.26
160	0.24
161	0.26
162	0.26
163	0.29
164	0.31
165	0.34
166	0.36
167	0.4
168	0.41
169	0.4
170	0.41
171	0.43
172	0.47
173	0.46
174	0.43
175	0.39
176	0.44
177	0.52
178	0.53
179	0.53
180	0.46
181	0.42
182	0.4
183	0.43
184	0.39
185	0.29
186	0.25
187	0.21
188	0.2
189	0.17
190	0.15
191	0.08
192	0.06
193	0.06
194	0.05
195	0.04
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.08
207	0.09
208	0.11
209	0.13
210	0.15
211	0.13
212	0.14
213	0.15
214	0.13
215	0.15
216	0.13
217	0.13
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.09
224	0.1
225	0.11
226	0.15
227	0.15
228	0.15
229	0.17
230	0.19
231	0.22
232	0.24
233	0.27
234	0.27
235	0.27
236	0.28
237	0.29
238	0.31
239	0.33
240	0.37
241	0.33
242	0.29
243	0.28
244	0.26
245	0.24
246	0.18
247	0.14
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.1
258	0.11
259	0.14
260	0.15
261	0.15
262	0.16
263	0.17
264	0.17
265	0.14
266	0.13
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.07
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.1
286	0.12
287	0.13
288	0.14
289	0.14
290	0.15
291	0.16
292	0.18
293	0.15
294	0.14
295	0.14
296	0.13
297	0.14
298	0.12
299	0.15
300	0.14
301	0.15
302	0.17
303	0.18
304	0.2
305	0.26
306	0.28
307	0.29
308	0.37
309	0.37
310	0.36
311	0.38
312	0.41
313	0.4
314	0.39
315	0.39
316	0.37
317	0.35
318	0.34
319	0.31
320	0.26
321	0.24
322	0.25
323	0.27
324	0.21
325	0.21
326	0.23
327	0.26
328	0.26
329	0.23
330	0.19
331	0.14
332	0.16
333	0.15
334	0.11
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.08
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.08
347	0.07
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.09
362	0.11
363	0.13
364	0.13
365	0.14
366	0.16
367	0.15
368	0.16
369	0.15
370	0.14
371	0.13
372	0.15
373	0.15
374	0.13
375	0.16
376	0.19
377	0.23
378	0.31
379	0.34
380	0.42
381	0.51
382	0.59
383	0.59
384	0.64
385	0.66
386	0.67
387	0.74
388	0.72
389	0.68
390	0.68
391	0.67
392	0.58
393	0.53
394	0.45
395	0.36
396	0.29
397	0.24
398	0.16
399	0.15
400	0.16
401	0.15
402	0.14
403	0.13
404	0.11
405	0.12
406	0.14
407	0.13
408	0.13
409	0.17
410	0.17
411	0.19
412	0.2
413	0.19
414	0.18
415	0.2
416	0.24
417	0.21
418	0.28
419	0.33
420	0.31
421	0.37
422	0.44
423	0.51
424	0.52
425	0.58
426	0.62
427	0.66
428	0.76
429	0.78
430	0.75
431	0.75
432	0.73
433	0.76
434	0.69
435	0.66
436	0.57
437	0.52
438	0.5
439	0.45
440	0.43
441	0.41
442	0.42
443	0.37
444	0.4
445	0.38
446	0.34
447	0.34
448	0.4
449	0.36
450	0.34
451	0.38
452	0.33
453	0.34
454	0.34
455	0.32
456	0.25
457	0.21
458	0.18
459	0.15
460	0.15
461	0.15
462	0.13
463	0.12
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.15
469	0.22
470	0.24
471	0.3
472	0.31
473	0.34
474	0.34
475	0.36
476	0.44
477	0.39
478	0.47
479	0.51
480	0.59
481	0.66
482	0.74
483	0.81
484	0.81
485	0.88
486	0.88
487	0.87
488	0.86
489	0.86
490	0.84
491	0.85
492	0.85
493	0.81
494	0.73
495	0.69
496	0.64
497	0.55
498	0.49
499	0.41
500	0.32
501	0.28
502	0.31
503	0.26
504	0.3
505	0.38
506	0.35
507	0.34
508	0.34
509	0.32
510	0.32
511	0.35
512	0.3
513	0.28
514	0.28
515	0.28

C6HC10

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer