FuNGI

C6HJX4

Protein Details

Accession

C6HJX4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1119-1148	ENPNAKGIMRKKKGPEKRSHRDTRTADKSS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1124-1141	KGIMRKKKGPEKRSHRDT

Subcellular Location(s)

mito 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 9.166, nucl 9, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDRARKSIFPVNKSLDSALKKNTAFIKRLRTGITAAALPTFLADIRTLSLHKYLSEIISAAYEGFCKLKTPGEIAAAVEIASALHQRFGPDEFTKQLGWLLGRGLTTPDKAQLKAWTQDVREREEKERLSRQRVLLRIVTELWLVGFLRSLDDVERPDDLGTKGHDGAGAIGGGKGSSPSDGVAKSKPAQATAKADQDKEAEPFPLEVLKDLLGHDREHVNLPLAVLFARTYSWDILGSKGMEGGRKNVEADGATTESPMKDGPEIGSGDDEPNAESTGDDPPLASEKFQLRFRNILNRYLEDVKALVVSDQKGLATQSRKNAEAYVKSGEIFEDRQANFEKQSKAHEKLVSNTQALCEILGSDMPDLMEKETGDSTLGGGSIGLVKTGEYLRGQGEGPGIWEDEEERRFYENLVDLKGKVPAVLLEDGKKKKADGDDQVKRKADGEAANGVPADQFGKGDVTKPGLTASEAANTQEVDDQSASMVNKTVGAQVDALLAKLPELQTKDSVDQLALEFCFLNSKASRNRLVKAIQEAPKGRTDLLPLYARLVATLGQYLPDIPQGLISYLDEEFRSLQRRRQKEFLGQVRTSNIRYLAELTKFGVVPEHVIFHCFKVSLDDFSRMNIEIIGNLLENCGRYLLRNPETSPRMASFLETLGRKKAAQHLGQQERMIIENAMYYVDPPQRPAIQQKERTPMELYIRKLLYLDMNKRNYPRILKCIRKLHWEEQEVVHILERIFSKPGKVRYSNIHILAILVSALYRYHQDFVIGIVDNILENITLGLEQNDFKFNQRRIAEVKYLGELYNYKIVDSPLIFDTLYRIVTFGHEGGIPAPGKINLLDMPDDFFRIRLYYLFTKDPVPMDVDFLVQDTYALTRPQWKIATDLAEATRLFSEAVAQNYKIEESTQEADKAPEPDPDGESSSSDDGFEDDAIPDADEDKDDVNSSSDEVEETVRGPDQDHDSESEEEQIFVTRQEEQLDPEAEAEFDREFEKMMAESLQSRKFERKAMFDVPLPMRRTPHNPSSGAEENGESSQHTPNTMAFSLMTKRGNRQQTRTIDLPSDSSFAVAMKTQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLRDDNESNDGEFNTSSFSCPKNPLLEENPNAKGIMRKKKGPEKRSHRDTRTADKSSSNRSGFRSRKLQLSDVDWYDEN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.51
3	0.49
4	0.48
5	0.46
6	0.46
7	0.43
8	0.46
9	0.52
10	0.51
11	0.51
12	0.53
13	0.57
14	0.55
15	0.59
16	0.57
17	0.51
18	0.46
19	0.45
20	0.41
21	0.32
22	0.28
23	0.24
24	0.2
25	0.17
26	0.15
27	0.12
28	0.09
29	0.08
30	0.08
31	0.08
32	0.1
33	0.12
34	0.13
35	0.14
36	0.18
37	0.18
38	0.18
39	0.2
40	0.21
41	0.2
42	0.2
43	0.18
44	0.15
45	0.14
46	0.14
47	0.12
48	0.1
49	0.09
50	0.09
51	0.1
52	0.1
53	0.11
54	0.13
55	0.17
56	0.2
57	0.23
58	0.25
59	0.27
60	0.28
61	0.27
62	0.26
63	0.21
64	0.18
65	0.14
66	0.1
67	0.07
68	0.07
69	0.09
70	0.08
71	0.1
72	0.1
73	0.11
74	0.13
75	0.16
76	0.21
77	0.21
78	0.25
79	0.25
80	0.28
81	0.27
82	0.26
83	0.26
84	0.22
85	0.2
86	0.18
87	0.17
88	0.16
89	0.16
90	0.16
91	0.18
92	0.18
93	0.19
94	0.2
95	0.25
96	0.27
97	0.27
98	0.3
99	0.34
100	0.37
101	0.39
102	0.44
103	0.43
104	0.42
105	0.48
106	0.48
107	0.48
108	0.49
109	0.49
110	0.49
111	0.51
112	0.54
113	0.56
114	0.62
115	0.63
116	0.65
117	0.68
118	0.69
119	0.68
120	0.67
121	0.64
122	0.58
123	0.51
124	0.45
125	0.39
126	0.33
127	0.26
128	0.21
129	0.16
130	0.13
131	0.12
132	0.09
133	0.09
134	0.08
135	0.09
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.13
140	0.14
141	0.15
142	0.16
143	0.15
144	0.15
145	0.18
146	0.17
147	0.17
148	0.18
149	0.2
150	0.19
151	0.19
152	0.19
153	0.16
154	0.16
155	0.14
156	0.12
157	0.08
158	0.08
159	0.07
160	0.07
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.1
168	0.12
169	0.15
170	0.17
171	0.21
172	0.23
173	0.28
174	0.28
175	0.3
176	0.32
177	0.35
178	0.4
179	0.4
180	0.47
181	0.45
182	0.45
183	0.43
184	0.42
185	0.39
186	0.33
187	0.29
188	0.21
189	0.19
190	0.19
191	0.17
192	0.17
193	0.15
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.18
200	0.17
201	0.17
202	0.19
203	0.19
204	0.2
205	0.22
206	0.22
207	0.19
208	0.18
209	0.18
210	0.16
211	0.14
212	0.12
213	0.1
214	0.09
215	0.07
216	0.07
217	0.08
218	0.09
219	0.1
220	0.11
221	0.12
222	0.13
223	0.14
224	0.17
225	0.16
226	0.14
227	0.16
228	0.16
229	0.17
230	0.18
231	0.21
232	0.22
233	0.22
234	0.23
235	0.2
236	0.21
237	0.17
238	0.18
239	0.17
240	0.15
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.12
245	0.13
246	0.12
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.11
251	0.13
252	0.14
253	0.14
254	0.15
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.13
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.11
266	0.11
267	0.1
268	0.09
269	0.1
270	0.14
271	0.14
272	0.13
273	0.15
274	0.2
275	0.25
276	0.31
277	0.35
278	0.34
279	0.39
280	0.42
281	0.48
282	0.45
283	0.48
284	0.46
285	0.43
286	0.44
287	0.42
288	0.39
289	0.29
290	0.27
291	0.2
292	0.16
293	0.14
294	0.1
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.11
299	0.1
300	0.11
301	0.12
302	0.16
303	0.18
304	0.21
305	0.28
306	0.31
307	0.32
308	0.32
309	0.35
310	0.35
311	0.34
312	0.33
313	0.29
314	0.26
315	0.25
316	0.25
317	0.21
318	0.18
319	0.16
320	0.15
321	0.19
322	0.18
323	0.21
324	0.24
325	0.25
326	0.26
327	0.31
328	0.32
329	0.26
330	0.35
331	0.39
332	0.41
333	0.45
334	0.47
335	0.43
336	0.44
337	0.51
338	0.46
339	0.4
340	0.36
341	0.3
342	0.26
343	0.24
344	0.2
345	0.11
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.07
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.05
367	0.04
368	0.04
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.07
375	0.07
376	0.09
377	0.07
378	0.09
379	0.09
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.13
395	0.15
396	0.15
397	0.15
398	0.17
399	0.18
400	0.18
401	0.2
402	0.2
403	0.19
404	0.2
405	0.21
406	0.18
407	0.13
408	0.11
409	0.09
410	0.11
411	0.13
412	0.13
413	0.15
414	0.23
415	0.24
416	0.26
417	0.26
418	0.23
419	0.25
420	0.29
421	0.32
422	0.34
423	0.42
424	0.49
425	0.55
426	0.61
427	0.57
428	0.53
429	0.47
430	0.39
431	0.32
432	0.26
433	0.23
434	0.22
435	0.21
436	0.21
437	0.2
438	0.18
439	0.14
440	0.11
441	0.09
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.07
446	0.07
447	0.09
448	0.1
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.13
453	0.11
454	0.12
455	0.11
456	0.11
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.11
464	0.1
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.08
469	0.1
470	0.1
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.1
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.08
481	0.1
482	0.09
483	0.09
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.07
489	0.08
490	0.1
491	0.11
492	0.13
493	0.15
494	0.16
495	0.16
496	0.16
497	0.13
498	0.11
499	0.11
500	0.1
501	0.08
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.08
506	0.07
507	0.1
508	0.09
509	0.14
510	0.18
511	0.22
512	0.3
513	0.31
514	0.32
515	0.34
516	0.35
517	0.34
518	0.34
519	0.38
520	0.35
521	0.37
522	0.38
523	0.35
524	0.36
525	0.34
526	0.29
527	0.22
528	0.2
529	0.17
530	0.18
531	0.18
532	0.15
533	0.16
534	0.16
535	0.15
536	0.13
537	0.12
538	0.09
539	0.07
540	0.08
541	0.06
542	0.05
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.07
555	0.06
556	0.07
557	0.06
558	0.07
559	0.07
560	0.09
561	0.16
562	0.16
563	0.21
564	0.29
565	0.36
566	0.4
567	0.44
568	0.46
569	0.47
570	0.55
571	0.57
572	0.56
573	0.5
574	0.46
575	0.43
576	0.42
577	0.35
578	0.27
579	0.2
580	0.13
581	0.13
582	0.15
583	0.16
584	0.15
585	0.15
586	0.14
587	0.14
588	0.14
589	0.13
590	0.11
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.09
596	0.1
597	0.11
598	0.1
599	0.11
600	0.09
601	0.09
602	0.11
603	0.12
604	0.14
605	0.15
606	0.17
607	0.17
608	0.17
609	0.18
610	0.14
611	0.13
612	0.11
613	0.09
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.06
626	0.1
627	0.18
628	0.21
629	0.23
630	0.24
631	0.31
632	0.33
633	0.33
634	0.3
635	0.24
636	0.23
637	0.21
638	0.2
639	0.14
640	0.13
641	0.15
642	0.15
643	0.15
644	0.14
645	0.15
646	0.15
647	0.16
648	0.23
649	0.26
650	0.28
651	0.34
652	0.42
653	0.46
654	0.48
655	0.46
656	0.39
657	0.33
658	0.3
659	0.24
660	0.14
661	0.09
662	0.07
663	0.07
664	0.07
665	0.06
666	0.05
667	0.09
668	0.13
669	0.13
670	0.14
671	0.17
672	0.18
673	0.2
674	0.27
675	0.33
676	0.37
677	0.44
678	0.48
679	0.55
680	0.54
681	0.54
682	0.49
683	0.43
684	0.42
685	0.4
686	0.36
687	0.33
688	0.33
689	0.3
690	0.28
691	0.26
692	0.24
693	0.25
694	0.32
695	0.34
696	0.38
697	0.4
698	0.42
699	0.45
700	0.43
701	0.44
702	0.4
703	0.42
704	0.47
705	0.52
706	0.58
707	0.64
708	0.63
709	0.64
710	0.66
711	0.64
712	0.64
713	0.58
714	0.53
715	0.45
716	0.45
717	0.37
718	0.31
719	0.23
720	0.16
721	0.14
722	0.14
723	0.14
724	0.12
725	0.13
726	0.13
727	0.17
728	0.2
729	0.27
730	0.31
731	0.33
732	0.34
733	0.39
734	0.47
735	0.48
736	0.45
737	0.39
738	0.32
739	0.29
740	0.27
741	0.2
742	0.12
743	0.06
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.04
748	0.05
749	0.07
750	0.08
751	0.08
752	0.09
753	0.09
754	0.1
755	0.12
756	0.11
757	0.09
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.08
762	0.06
763	0.03
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.04
770	0.05
771	0.06
772	0.07
773	0.1
774	0.1
775	0.15
776	0.22
777	0.23
778	0.3
779	0.3
780	0.33
781	0.35
782	0.39
783	0.39
784	0.34
785	0.33
786	0.27
787	0.27
788	0.24
789	0.21
790	0.17
791	0.15
792	0.18
793	0.17
794	0.16
795	0.16
796	0.16
797	0.17
798	0.16
799	0.16
800	0.11
801	0.13
802	0.12
803	0.11
804	0.13
805	0.12
806	0.13
807	0.1
808	0.1
809	0.09
810	0.1
811	0.12
812	0.09
813	0.09
814	0.08
815	0.09
816	0.09
817	0.13
818	0.12
819	0.1
820	0.11
821	0.1
822	0.11
823	0.1
824	0.12
825	0.09
826	0.11
827	0.12
828	0.11
829	0.14
830	0.13
831	0.15
832	0.13
833	0.12
834	0.11
835	0.11
836	0.11
837	0.1
838	0.15
839	0.18
840	0.22
841	0.24
842	0.24
843	0.25
844	0.26
845	0.26
846	0.22
847	0.2
848	0.17
849	0.17
850	0.16
851	0.15
852	0.13
853	0.12
854	0.11
855	0.08
856	0.08
857	0.06
858	0.07
859	0.08
860	0.09
861	0.09
862	0.17
863	0.18
864	0.24
865	0.26
866	0.25
867	0.27
868	0.29
869	0.33
870	0.25
871	0.27
872	0.22
873	0.22
874	0.22
875	0.2
876	0.17
877	0.13
878	0.13
879	0.09
880	0.13
881	0.13
882	0.17
883	0.18
884	0.18
885	0.18
886	0.19
887	0.2
888	0.16
889	0.13
890	0.11
891	0.13
892	0.16
893	0.17
894	0.18
895	0.18
896	0.2
897	0.22
898	0.24
899	0.21
900	0.21
901	0.22
902	0.22
903	0.23
904	0.23
905	0.24
906	0.21
907	0.21
908	0.2
909	0.19
910	0.17
911	0.15
912	0.13
913	0.11
914	0.11
915	0.1
916	0.08
917	0.07
918	0.08
919	0.08
920	0.08
921	0.07
922	0.08
923	0.08
924	0.07
925	0.08
926	0.08
927	0.08
928	0.09
929	0.1
930	0.1
931	0.1
932	0.11
933	0.1
934	0.1
935	0.09
936	0.09
937	0.1
938	0.09
939	0.09
940	0.1
941	0.1
942	0.1
943	0.11
944	0.14
945	0.19
946	0.2
947	0.21
948	0.22
949	0.25
950	0.26
951	0.26
952	0.27
953	0.22
954	0.2
955	0.19
956	0.18
957	0.15
958	0.14
959	0.14
960	0.11
961	0.12
962	0.15
963	0.16
964	0.17
965	0.22
966	0.22
967	0.21
968	0.2
969	0.19
970	0.16
971	0.16
972	0.14
973	0.09
974	0.09
975	0.09
976	0.08
977	0.09
978	0.09
979	0.1
980	0.09
981	0.1
982	0.1
983	0.1
984	0.16
985	0.21
986	0.26
987	0.27
988	0.3
989	0.36
990	0.38
991	0.45
992	0.45
993	0.45
994	0.46
995	0.5
996	0.5
997	0.46
998	0.51
999	0.49
1000	0.51
1001	0.48
1002	0.44
1003	0.41
1004	0.43
1005	0.47
1006	0.47
1007	0.49
1008	0.49
1009	0.48
1010	0.46
1011	0.52
1012	0.52
1013	0.47
1014	0.4
1015	0.32
1016	0.27
1017	0.26
1018	0.25
1019	0.17
1020	0.15
1021	0.18
1022	0.18
1023	0.18
1024	0.17
1025	0.18
1026	0.23
1027	0.22
1028	0.21
1029	0.16
1030	0.19
1031	0.22
1032	0.26
1033	0.3
1034	0.27
1035	0.34
1036	0.42
1037	0.52
1038	0.56
1039	0.59
1040	0.63
1041	0.64
1042	0.69
1043	0.66
1044	0.61
1045	0.54
1046	0.48
1047	0.44
1048	0.37
1049	0.32
1050	0.24
1051	0.21
1052	0.18
1053	0.14
1054	0.14
1055	0.11
1056	0.12
1057	0.16
1058	0.2
1059	0.23
1060	0.26
1061	0.29
1062	0.33
1063	0.38
1064	0.45
1065	0.44
1066	0.49
1067	0.52
1068	0.54
1069	0.59
1070	0.57
1071	0.54
1072	0.49
1073	0.46
1074	0.42
1075	0.42
1076	0.39
1077	0.34
1078	0.36
1079	0.34
1080	0.31
1081	0.34
1082	0.31
1083	0.27
1084	0.29
1085	0.27
1086	0.23
1087	0.24
1088	0.22
1089	0.19
1090	0.18
1091	0.16
1092	0.15
1093	0.15
1094	0.16
1095	0.18
1096	0.2
1097	0.23
1098	0.28
1099	0.32
1100	0.35
1101	0.38
1102	0.43
1103	0.47
1104	0.53
1105	0.55
1106	0.57
1107	0.55
1108	0.49
1109	0.46
1110	0.4
1111	0.4
1112	0.4
1113	0.45
1114	0.45
1115	0.51
1116	0.6
1117	0.7
1118	0.8
1119	0.82
1120	0.84
1121	0.84
1122	0.88
1123	0.91
1124	0.92
1125	0.88
1126	0.88
1127	0.85
1128	0.85
1129	0.84
1130	0.78
1131	0.7
1132	0.68
1133	0.67
1134	0.66
1135	0.68
1136	0.61
1137	0.56
1138	0.57
1139	0.65
1140	0.63
1141	0.65
1142	0.66
1143	0.6
1144	0.65
1145	0.66
1146	0.65
1147	0.59
1148	0.58
1149	0.57
1150	0.5

C6HJX4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer