FuNGI

A0A0L0W075

Protein Details

Accession

A0A0L0W075

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
382-405	EGVPGKPVPRKITKKKKPGLDDWL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-12	RGRGRG
89-108	PAGRGGRGRGRGADRGGRGR
387-399	KPVPRKITKKKKP

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRGSRGRGRGKARETIEEPQNEPVLDPVLSRLTVEDHGGTSTSRTTGGSGDSKPAAVPSKFKPRMVKRVVKVEPDIEVEDSSKVGGPAGRGGRGRGRGADRGGRGRPDMVMTASGAFGMGPAEASTRRTIQGPNRSGMRRIDNSIVPTDNNNNKSDRSANKPWDGGPSEMLELYSDIDDEEGSDDNGGDQDEDGRSKVADLNDITLEHSMAPLSLPWDPKRIAERERLIHARNQKLIKLTNQKIKREQAEDTKPLPSTSPENSRQSSSTAPLNGRENTSNSNESVPLMKLDPVEHLDDNDENHKRDVKLKKDQLEELSNVGKQFTQKKPTHSDRSTTNPIQSTDAHSSPTQETYYVFQFPRNFPQFRDPSNIIEEEVNVEGVPGKPVPRKITKKKKPGLDDWLGWGKGGKRVECMGVPPGDNLNSDGSTSSVQGQIGELVIRRSGRVQMIIANVAYDVLPGAQPTFHQEISVIDPKPDSNLRAMFILGSTNHKFIVVPDVSTLLKREQSLLSSSSTSIPSNPTLNHPSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.71
3	0.65
4	0.65
5	0.64
6	0.59
7	0.55
8	0.51
9	0.49
10	0.41
11	0.36
12	0.29
13	0.23
14	0.18
15	0.17
16	0.15
17	0.15
18	0.15
19	0.15
20	0.14
21	0.15
22	0.16
23	0.18
24	0.16
25	0.14
26	0.15
27	0.16
28	0.15
29	0.14
30	0.14
31	0.13
32	0.12
33	0.12
34	0.12
35	0.13
36	0.18
37	0.21
38	0.21
39	0.24
40	0.24
41	0.24
42	0.23
43	0.25
44	0.27
45	0.24
46	0.28
47	0.31
48	0.41
49	0.46
50	0.51
51	0.58
52	0.6
53	0.7
54	0.75
55	0.77
56	0.72
57	0.78
58	0.79
59	0.74
60	0.68
61	0.59
62	0.52
63	0.46
64	0.41
65	0.32
66	0.27
67	0.22
68	0.19
69	0.17
70	0.14
71	0.12
72	0.1
73	0.1
74	0.1
75	0.1
76	0.16
77	0.19
78	0.23
79	0.22
80	0.25
81	0.31
82	0.34
83	0.35
84	0.35
85	0.37
86	0.38
87	0.42
88	0.46
89	0.44
90	0.46
91	0.48
92	0.45
93	0.42
94	0.38
95	0.34
96	0.29
97	0.26
98	0.2
99	0.17
100	0.15
101	0.14
102	0.12
103	0.11
104	0.09
105	0.07
106	0.06
107	0.05
108	0.04
109	0.04
110	0.04
111	0.06
112	0.07
113	0.09
114	0.11
115	0.13
116	0.14
117	0.16
118	0.22
119	0.29
120	0.39
121	0.4
122	0.42
123	0.47
124	0.48
125	0.5
126	0.49
127	0.48
128	0.41
129	0.41
130	0.41
131	0.37
132	0.38
133	0.37
134	0.33
135	0.26
136	0.25
137	0.29
138	0.32
139	0.33
140	0.32
141	0.31
142	0.31
143	0.33
144	0.37
145	0.34
146	0.36
147	0.41
148	0.46
149	0.48
150	0.48
151	0.46
152	0.46
153	0.44
154	0.36
155	0.29
156	0.24
157	0.21
158	0.2
159	0.19
160	0.12
161	0.09
162	0.09
163	0.07
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.08
183	0.08
184	0.07
185	0.08
186	0.11
187	0.1
188	0.13
189	0.13
190	0.14
191	0.15
192	0.15
193	0.15
194	0.12
195	0.12
196	0.08
197	0.08
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.04
202	0.06
203	0.08
204	0.11
205	0.12
206	0.16
207	0.17
208	0.2
209	0.25
210	0.28
211	0.29
212	0.33
213	0.37
214	0.37
215	0.42
216	0.43
217	0.39
218	0.4
219	0.43
220	0.41
221	0.41
222	0.4
223	0.36
224	0.36
225	0.37
226	0.4
227	0.42
228	0.43
229	0.46
230	0.5
231	0.53
232	0.56
233	0.59
234	0.56
235	0.49
236	0.47
237	0.47
238	0.47
239	0.47
240	0.42
241	0.39
242	0.35
243	0.32
244	0.29
245	0.22
246	0.19
247	0.18
248	0.24
249	0.27
250	0.31
251	0.32
252	0.33
253	0.32
254	0.3
255	0.28
256	0.23
257	0.2
258	0.18
259	0.18
260	0.19
261	0.22
262	0.2
263	0.21
264	0.2
265	0.19
266	0.2
267	0.23
268	0.21
269	0.18
270	0.18
271	0.17
272	0.16
273	0.16
274	0.13
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.11
281	0.11
282	0.14
283	0.13
284	0.12
285	0.13
286	0.13
287	0.13
288	0.18
289	0.19
290	0.17
291	0.19
292	0.22
293	0.21
294	0.29
295	0.36
296	0.37
297	0.45
298	0.51
299	0.56
300	0.56
301	0.58
302	0.55
303	0.5
304	0.43
305	0.36
306	0.31
307	0.25
308	0.22
309	0.19
310	0.15
311	0.15
312	0.22
313	0.26
314	0.34
315	0.36
316	0.42
317	0.51
318	0.58
319	0.65
320	0.59
321	0.57
322	0.52
323	0.57
324	0.59
325	0.52
326	0.47
327	0.4
328	0.39
329	0.38
330	0.34
331	0.32
332	0.28
333	0.27
334	0.25
335	0.22
336	0.24
337	0.23
338	0.24
339	0.18
340	0.14
341	0.15
342	0.15
343	0.17
344	0.19
345	0.18
346	0.2
347	0.24
348	0.27
349	0.35
350	0.39
351	0.38
352	0.36
353	0.46
354	0.46
355	0.44
356	0.5
357	0.42
358	0.38
359	0.41
360	0.39
361	0.3
362	0.26
363	0.23
364	0.17
365	0.15
366	0.12
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.09
372	0.08
373	0.12
374	0.15
375	0.2
376	0.27
377	0.36
378	0.46
379	0.56
380	0.67
381	0.73
382	0.8
383	0.83
384	0.86
385	0.83
386	0.81
387	0.79
388	0.74
389	0.66
390	0.61
391	0.6
392	0.51
393	0.43
394	0.37
395	0.3
396	0.28
397	0.31
398	0.26
399	0.22
400	0.24
401	0.27
402	0.25
403	0.26
404	0.25
405	0.23
406	0.23
407	0.21
408	0.22
409	0.2
410	0.2
411	0.19
412	0.17
413	0.15
414	0.15
415	0.13
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.12
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.1
428	0.09
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.14
433	0.18
434	0.19
435	0.2
436	0.2
437	0.22
438	0.24
439	0.25
440	0.23
441	0.19
442	0.16
443	0.14
444	0.13
445	0.09
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.13
454	0.17
455	0.17
456	0.17
457	0.17
458	0.19
459	0.26
460	0.32
461	0.27
462	0.23
463	0.24
464	0.24
465	0.29
466	0.31
467	0.25
468	0.25
469	0.27
470	0.27
471	0.27
472	0.27
473	0.22
474	0.19
475	0.2
476	0.15
477	0.2
478	0.21
479	0.22
480	0.21
481	0.21
482	0.21
483	0.19
484	0.27
485	0.21
486	0.19
487	0.19
488	0.22
489	0.22
490	0.23
491	0.25
492	0.2
493	0.22
494	0.22
495	0.24
496	0.24
497	0.26
498	0.29
499	0.28
500	0.27
501	0.25
502	0.26
503	0.25
504	0.25
505	0.23
506	0.22
507	0.24
508	0.24
509	0.27
510	0.27
511	0.32

A0A0L0W075

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer