FuNGI

A0A0L0VHC6

Protein Details

Accession

A0A0L0VHC6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
106-126	RAEEAHRKKRAKPNSVSSTQE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
113-115	KKR
584-597	APNQKRKDVVRRRR

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 11.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50118 HMG_BOX_2

Amino Acid Sequences

MECPSLSRRVSTRPSVLSSSAQRHHSTPNASHLPPSSRPTTPIVISPKVSAPIGGSKLISDPHLSTLVTSALQASPISSLCPALSSTQLANCDEGQFSDADSDQERAEEAHRKKRAKPNSVSSTQESLSLRTKSNVQGASSNDSSHHNGVDRYEEAQEDAVESELGGRLTIPSNTPSTASIQQDLRSTRPSKPSTPPAATPTPLTYDSRAQLPIATRRLAMLAGIPESSQAIIQSTLSLPTSRSNPSNSHPYASTARIGVSSRGTTSLPTSDSLNCSGVSSNVSKDYTSRHSNSLSSADAACSSPRDHPNVPARSLATTPRPLTTLATRPSDCGSSQAPKIPSTGPTSNRRGVKEDARLAAPRYGGTSHSSEDFTMPVPGSFSIRAPSSSQLLRSYDPALSSEASEMPNWAGSQLEGYEESSEFDASSQPPSTGPAHSPSASSSYTGMMPTLSSHTPGNRNKRKAGTSKAGTSKAASQTGESDYSQADIELVKPPPTINGKVSHGRKVPVGYIKRTPNSFLMFRSHVINNKLLPPGVENDNRQISRVVSGLWAGLSEEDLRSWQTASRELRAAARAQNPGMKHAPNQKRKDVVRRRRSGQLPGETPEQRVEREKASAAALAKTIINSRGERLDKQQPIAPSARISVQPSTSTAIINRRHTPREEASRPEFRAPIYLNPSSGGQAVTPRSEYAESTLTTSPAADARRSLTRVPESDADKSSVGQAALTPRAAPTGKQAIRYPNPRNPLPPEPTRTMDHHTQAPQQRSSTLANLEPRLISQASQSSQSTIRQRPLSPALAAGNLSEVSLDQLGSEPYSGVFSHMDSGFDVSENFPNTFSNEMLRSLGFAASDLNLDMPATGSLPGTSTGGMHDISFPEKSFAIKDDCRRQDPSFWSQESGFSNLGNSTSAEYPFRDSTVPEDNLSQITAPGNAQATYPRLSQTSPSDATNPLEFSSLIDTSYTDPGKSNCDVLNFESMYLNYQSSSMANQALEDACQSLTTNIGEAASGSTNGEPTINQEYPKGFWVNS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.55
3	0.54
4	0.52
5	0.52
6	0.52
7	0.51
8	0.51
9	0.49
10	0.47
11	0.51
12	0.51
13	0.51
14	0.46
15	0.5
16	0.52
17	0.5
18	0.51
19	0.5
20	0.49
21	0.48
22	0.49
23	0.45
24	0.4
25	0.42
26	0.43
27	0.43
28	0.39
29	0.41
30	0.42
31	0.41
32	0.41
33	0.41
34	0.39
35	0.36
36	0.34
37	0.28
38	0.23
39	0.26
40	0.27
41	0.26
42	0.23
43	0.21
44	0.23
45	0.24
46	0.22
47	0.18
48	0.17
49	0.18
50	0.2
51	0.2
52	0.18
53	0.18
54	0.18
55	0.15
56	0.14
57	0.13
58	0.11
59	0.12
60	0.11
61	0.1
62	0.11
63	0.11
64	0.12
65	0.1
66	0.11
67	0.1
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.14
72	0.15
73	0.16
74	0.19
75	0.22
76	0.22
77	0.23
78	0.22
79	0.21
80	0.19
81	0.18
82	0.16
83	0.13
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.12
88	0.13
89	0.14
90	0.13
91	0.13
92	0.13
93	0.12
94	0.16
95	0.23
96	0.29
97	0.38
98	0.46
99	0.51
100	0.6
101	0.69
102	0.75
103	0.76
104	0.79
105	0.79
106	0.8
107	0.81
108	0.78
109	0.72
110	0.66
111	0.56
112	0.52
113	0.43
114	0.37
115	0.38
116	0.35
117	0.32
118	0.29
119	0.33
120	0.32
121	0.38
122	0.38
123	0.33
124	0.35
125	0.36
126	0.41
127	0.38
128	0.34
129	0.28
130	0.29
131	0.31
132	0.28
133	0.26
134	0.22
135	0.22
136	0.23
137	0.26
138	0.23
139	0.21
140	0.21
141	0.19
142	0.18
143	0.18
144	0.16
145	0.13
146	0.12
147	0.1
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.08
156	0.1
157	0.11
158	0.12
159	0.13
160	0.15
161	0.16
162	0.17
163	0.17
164	0.2
165	0.25
166	0.26
167	0.27
168	0.27
169	0.29
170	0.33
171	0.34
172	0.32
173	0.34
174	0.35
175	0.37
176	0.45
177	0.48
178	0.49
179	0.54
180	0.61
181	0.62
182	0.64
183	0.61
184	0.58
185	0.57
186	0.52
187	0.46
188	0.38
189	0.34
190	0.32
191	0.3
192	0.27
193	0.27
194	0.27
195	0.28
196	0.27
197	0.23
198	0.23
199	0.26
200	0.3
201	0.3
202	0.29
203	0.26
204	0.26
205	0.26
206	0.23
207	0.19
208	0.13
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.08
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.13
228	0.16
229	0.19
230	0.21
231	0.24
232	0.26
233	0.3
234	0.39
235	0.37
236	0.37
237	0.34
238	0.36
239	0.36
240	0.34
241	0.31
242	0.22
243	0.21
244	0.2
245	0.2
246	0.18
247	0.17
248	0.16
249	0.15
250	0.16
251	0.16
252	0.15
253	0.16
254	0.16
255	0.15
256	0.15
257	0.16
258	0.16
259	0.19
260	0.2
261	0.19
262	0.17
263	0.16
264	0.16
265	0.14
266	0.15
267	0.14
268	0.13
269	0.15
270	0.16
271	0.15
272	0.16
273	0.2
274	0.24
275	0.29
276	0.3
277	0.3
278	0.32
279	0.33
280	0.34
281	0.32
282	0.27
283	0.21
284	0.19
285	0.16
286	0.15
287	0.14
288	0.13
289	0.11
290	0.12
291	0.17
292	0.2
293	0.26
294	0.26
295	0.33
296	0.42
297	0.45
298	0.45
299	0.41
300	0.38
301	0.35
302	0.35
303	0.31
304	0.27
305	0.28
306	0.28
307	0.26
308	0.26
309	0.25
310	0.26
311	0.27
312	0.29
313	0.27
314	0.31
315	0.31
316	0.31
317	0.32
318	0.31
319	0.26
320	0.22
321	0.21
322	0.2
323	0.21
324	0.26
325	0.26
326	0.25
327	0.27
328	0.25
329	0.24
330	0.27
331	0.32
332	0.32
333	0.38
334	0.43
335	0.47
336	0.5
337	0.49
338	0.47
339	0.46
340	0.47
341	0.47
342	0.46
343	0.42
344	0.39
345	0.39
346	0.36
347	0.34
348	0.27
349	0.2
350	0.17
351	0.16
352	0.14
353	0.16
354	0.16
355	0.14
356	0.16
357	0.16
358	0.15
359	0.14
360	0.14
361	0.11
362	0.11
363	0.1
364	0.08
365	0.09
366	0.08
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.13
374	0.14
375	0.16
376	0.16
377	0.17
378	0.19
379	0.2
380	0.2
381	0.2
382	0.2
383	0.18
384	0.17
385	0.16
386	0.14
387	0.13
388	0.12
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.1
394	0.08
395	0.09
396	0.08
397	0.07
398	0.06
399	0.05
400	0.06
401	0.05
402	0.06
403	0.05
404	0.06
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.08
413	0.07
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.12
419	0.13
420	0.13
421	0.14
422	0.15
423	0.17
424	0.17
425	0.18
426	0.16
427	0.18
428	0.17
429	0.16
430	0.13
431	0.11
432	0.12
433	0.11
434	0.1
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.09
439	0.08
440	0.09
441	0.1
442	0.13
443	0.21
444	0.28
445	0.38
446	0.44
447	0.48
448	0.52
449	0.56
450	0.6
451	0.58
452	0.58
453	0.56
454	0.51
455	0.53
456	0.53
457	0.5
458	0.44
459	0.39
460	0.36
461	0.31
462	0.29
463	0.22
464	0.18
465	0.18
466	0.19
467	0.2
468	0.15
469	0.13
470	0.1
471	0.11
472	0.1
473	0.08
474	0.07
475	0.05
476	0.06
477	0.09
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.14
483	0.17
484	0.18
485	0.17
486	0.2
487	0.23
488	0.3
489	0.32
490	0.34
491	0.33
492	0.31
493	0.31
494	0.28
495	0.28
496	0.29
497	0.3
498	0.27
499	0.32
500	0.36
501	0.37
502	0.36
503	0.35
504	0.3
505	0.3
506	0.28
507	0.24
508	0.23
509	0.22
510	0.22
511	0.23
512	0.22
513	0.23
514	0.24
515	0.24
516	0.21
517	0.22
518	0.22
519	0.19
520	0.17
521	0.14
522	0.15
523	0.17
524	0.19
525	0.17
526	0.2
527	0.25
528	0.25
529	0.24
530	0.23
531	0.18
532	0.17
533	0.16
534	0.13
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.06
539	0.06
540	0.05
541	0.04
542	0.04
543	0.05
544	0.04
545	0.04
546	0.05
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.08
551	0.09
552	0.15
553	0.17
554	0.19
555	0.2
556	0.21
557	0.22
558	0.22
559	0.23
560	0.21
561	0.23
562	0.23
563	0.22
564	0.24
565	0.22
566	0.25
567	0.26
568	0.22
569	0.22
570	0.31
571	0.4
572	0.46
573	0.51
574	0.52
575	0.57
576	0.6
577	0.68
578	0.68
579	0.7
580	0.71
581	0.73
582	0.72
583	0.73
584	0.72
585	0.69
586	0.66
587	0.62
588	0.53
589	0.49
590	0.51
591	0.43
592	0.4
593	0.36
594	0.3
595	0.24
596	0.26
597	0.25
598	0.21
599	0.22
600	0.21
601	0.18
602	0.18
603	0.19
604	0.16
605	0.14
606	0.13
607	0.11
608	0.11
609	0.1
610	0.11
611	0.1
612	0.12
613	0.12
614	0.13
615	0.19
616	0.21
617	0.22
618	0.27
619	0.34
620	0.33
621	0.35
622	0.36
623	0.31
624	0.33
625	0.33
626	0.29
627	0.2
628	0.19
629	0.2
630	0.18
631	0.2
632	0.18
633	0.17
634	0.17
635	0.17
636	0.18
637	0.16
638	0.15
639	0.15
640	0.21
641	0.25
642	0.29
643	0.35
644	0.37
645	0.4
646	0.42
647	0.46
648	0.45
649	0.49
650	0.49
651	0.48
652	0.5
653	0.54
654	0.54
655	0.51
656	0.45
657	0.35
658	0.36
659	0.31
660	0.31
661	0.29
662	0.28
663	0.26
664	0.25
665	0.26
666	0.21
667	0.2
668	0.15
669	0.09
670	0.12
671	0.13
672	0.13
673	0.13
674	0.13
675	0.14
676	0.14
677	0.14
678	0.13
679	0.14
680	0.14
681	0.16
682	0.17
683	0.15
684	0.15
685	0.14
686	0.12
687	0.13
688	0.14
689	0.11
690	0.12
691	0.14
692	0.19
693	0.21
694	0.22
695	0.24
696	0.28
697	0.29
698	0.31
699	0.33
700	0.32
701	0.34
702	0.34
703	0.3
704	0.26
705	0.24
706	0.22
707	0.19
708	0.15
709	0.12
710	0.12
711	0.13
712	0.15
713	0.14
714	0.13
715	0.11
716	0.15
717	0.15
718	0.14
719	0.16
720	0.25
721	0.27
722	0.3
723	0.34
724	0.39
725	0.47
726	0.55
727	0.57
728	0.53
729	0.57
730	0.56
731	0.58
732	0.56
733	0.57
734	0.54
735	0.53
736	0.53
737	0.52
738	0.53
739	0.51
740	0.48
741	0.46
742	0.45
743	0.41
744	0.4
745	0.39
746	0.43
747	0.47
748	0.49
749	0.46
750	0.41
751	0.39
752	0.36
753	0.36
754	0.31
755	0.27
756	0.26
757	0.27
758	0.27
759	0.28
760	0.24
761	0.22
762	0.22
763	0.19
764	0.15
765	0.14
766	0.18
767	0.18
768	0.21
769	0.21
770	0.2
771	0.22
772	0.27
773	0.33
774	0.33
775	0.38
776	0.4
777	0.4
778	0.44
779	0.48
780	0.45
781	0.37
782	0.35
783	0.29
784	0.26
785	0.25
786	0.19
787	0.14
788	0.11
789	0.1
790	0.08
791	0.06
792	0.07
793	0.07
794	0.07
795	0.05
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.08
800	0.06
801	0.06
802	0.08
803	0.08
804	0.09
805	0.09
806	0.09
807	0.13
808	0.13
809	0.14
810	0.12
811	0.14
812	0.12
813	0.12
814	0.12
815	0.1
816	0.14
817	0.15
818	0.15
819	0.14
820	0.15
821	0.16
822	0.18
823	0.16
824	0.16
825	0.15
826	0.16
827	0.17
828	0.16
829	0.15
830	0.15
831	0.14
832	0.11
833	0.09
834	0.09
835	0.08
836	0.09
837	0.08
838	0.07
839	0.06
840	0.06
841	0.06
842	0.06
843	0.06
844	0.06
845	0.06
846	0.06
847	0.06
848	0.07
849	0.08
850	0.08
851	0.08
852	0.08
853	0.08
854	0.09
855	0.1
856	0.09
857	0.1
858	0.11
859	0.13
860	0.14
861	0.14
862	0.14
863	0.14
864	0.15
865	0.15
866	0.17
867	0.22
868	0.28
869	0.36
870	0.45
871	0.51
872	0.55
873	0.59
874	0.58
875	0.59
876	0.6
877	0.59
878	0.57
879	0.52
880	0.5
881	0.45
882	0.47
883	0.41
884	0.38
885	0.3
886	0.22
887	0.21
888	0.19
889	0.19
890	0.15
891	0.13
892	0.12
893	0.14
894	0.15
895	0.16
896	0.17
897	0.21
898	0.21
899	0.22
900	0.2
901	0.19
902	0.22
903	0.29
904	0.3
905	0.26
906	0.26
907	0.26
908	0.26
909	0.26
910	0.21
911	0.14
912	0.13
913	0.13
914	0.11
915	0.13
916	0.13
917	0.13
918	0.13
919	0.15
920	0.18
921	0.19
922	0.2
923	0.19
924	0.19
925	0.2
926	0.25
927	0.27
928	0.32
929	0.31
930	0.32
931	0.33
932	0.34
933	0.36
934	0.34
935	0.29
936	0.22
937	0.22
938	0.2
939	0.18
940	0.2
941	0.17
942	0.15
943	0.14
944	0.14
945	0.15
946	0.22
947	0.21
948	0.17
949	0.2
950	0.21
951	0.26
952	0.27
953	0.28
954	0.24
955	0.26
956	0.29
957	0.28
958	0.34
959	0.29
960	0.29
961	0.27
962	0.25
963	0.25
964	0.24
965	0.22
966	0.14
967	0.14
968	0.14
969	0.13
970	0.15
971	0.14
972	0.15
973	0.14
974	0.14
975	0.16
976	0.16
977	0.15
978	0.14
979	0.13
980	0.1
981	0.11
982	0.11
983	0.09
984	0.11
985	0.11
986	0.11
987	0.11
988	0.11
989	0.1
990	0.1
991	0.12
992	0.1
993	0.11
994	0.11
995	0.11
996	0.11
997	0.12
998	0.12
999	0.1
1000	0.13
1001	0.21
1002	0.22
1003	0.23
1004	0.26
1005	0.28
1006	0.29
1007	0.34

A0A0L0VHC6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer