FuNGI

A0A0L0VSR1

Protein Details

Accession

A0A0L0VSR1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
235-258	ETTLQPFTDKKNPRKRPLNSGEKE	Hydrophilic
419-438	GATTKKAPKKPKKQVELTPE	Hydrophilic
443-462	AEEKRKKMAEQRKIQKERRL	Basic
773-804	QQQHHQHQQQQQQQQKQNQQQQQQYQHQQQSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
245-263	KNPRKRPLNSGEKEAMRRQ
397-403	KNAKKKA
422-433	TKKAPKKPKKQV
443-461	AEEKRKKMAEQRKIQKERR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MFRQAGVYNLTRTIRSILKRYRKEAPSLTMHLYSAGFRLGHKDSNLHAYDGEMKHWMDCIREQKMPNELLDVLDELGIRFYDGCLIVEVHDHRSAQQSTEQSTTDQQQQPGSSTSSAAAATSHQRPPNNQHNSSNNLPSTSTDLANDQVSLHRLVLTPTCETLWRDILLMNESKVAQLNRGSNQTIRGSSDFQWGPITEEEAVELEAAILDRTAPALCLSPSIITSRIANQMLSETTLQPFTDKKNPRKRPLNSGEKEAMRRQRERHERFMHIADESYDQSFAPTFSRFDCIKRLRTTRPVPVVPKEPEGKWSARDLSQEQSRIFTPQTTIAPSDLLLPGYSVHDSKNESQQNPKVTGGSTSQVSSSARPQSPSAILTPLNGTATIVAPTTATTSKKNAKKKAVERSETGSPAPGSTIGATTKKAPKKPKKQVELTPEAAALAEEKRKKMAEQRKIQKERRLALAAAAKAEAVAQKASAAGGTVNNNNNPSTPNDNNNNNSAATTTAGAHAIVPSSTAENINPMHRQFTTDYLSQQGGDINISVPDSIPVMTGDSIPVPNQFGSHNNNSIPVPNLPSLSNNPSPGSNEITVHQDSNSNSSSIPVPVFNHSIPVPSSGHHHHHHNNNIPVVHQAIPVSGALQSTSMAENSIPVSIPTIHHLPHLQQHQHLQHQHHLQHQQQSSDQMASIPVPQSQQPQLWNNNTNLHHHQFTNFIPTNQHQHPLHSSSDIDINVHSNNSSHQQQAQGMIHNNHLSSSIDVPNIPILSHQLDHHQQQHHQHQQQQQQQQKQNQQQQQQYQHQQQSQQQQQSFHGWSN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.35
3	0.42
4	0.48
5	0.57
6	0.65
7	0.68
8	0.74
9	0.72
10	0.75
11	0.72
12	0.69
13	0.66
14	0.63
15	0.62
16	0.53
17	0.48
18	0.41
19	0.35
20	0.28
21	0.22
22	0.19
23	0.15
24	0.14
25	0.19
26	0.21
27	0.25
28	0.26
29	0.28
30	0.28
31	0.36
32	0.37
33	0.33
34	0.29
35	0.26
36	0.33
37	0.31
38	0.3
39	0.25
40	0.23
41	0.23
42	0.26
43	0.25
44	0.2
45	0.25
46	0.32
47	0.34
48	0.4
49	0.42
50	0.43
51	0.5
52	0.49
53	0.43
54	0.39
55	0.34
56	0.28
57	0.27
58	0.23
59	0.16
60	0.14
61	0.13
62	0.09
63	0.1
64	0.09
65	0.08
66	0.07
67	0.07
68	0.1
69	0.1
70	0.11
71	0.11
72	0.12
73	0.12
74	0.17
75	0.19
76	0.2
77	0.22
78	0.21
79	0.21
80	0.28
81	0.29
82	0.26
83	0.3
84	0.3
85	0.3
86	0.33
87	0.33
88	0.27
89	0.3
90	0.32
91	0.36
92	0.36
93	0.35
94	0.36
95	0.36
96	0.37
97	0.36
98	0.34
99	0.25
100	0.22
101	0.2
102	0.17
103	0.16
104	0.13
105	0.11
106	0.11
107	0.16
108	0.2
109	0.26
110	0.29
111	0.32
112	0.37
113	0.45
114	0.54
115	0.58
116	0.57
117	0.59
118	0.6
119	0.64
120	0.64
121	0.62
122	0.53
123	0.45
124	0.4
125	0.34
126	0.34
127	0.3
128	0.25
129	0.19
130	0.19
131	0.2
132	0.2
133	0.19
134	0.13
135	0.13
136	0.14
137	0.15
138	0.14
139	0.13
140	0.13
141	0.15
142	0.17
143	0.18
144	0.17
145	0.17
146	0.18
147	0.19
148	0.2
149	0.22
150	0.21
151	0.19
152	0.18
153	0.18
154	0.19
155	0.2
156	0.2
157	0.17
158	0.16
159	0.15
160	0.16
161	0.18
162	0.17
163	0.16
164	0.19
165	0.24
166	0.25
167	0.29
168	0.3
169	0.28
170	0.32
171	0.33
172	0.29
173	0.28
174	0.28
175	0.27
176	0.27
177	0.34
178	0.29
179	0.26
180	0.27
181	0.24
182	0.24
183	0.21
184	0.22
185	0.14
186	0.14
187	0.13
188	0.11
189	0.11
190	0.08
191	0.07
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.03
198	0.03
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.09
207	0.09
208	0.1
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.12
213	0.15
214	0.19
215	0.19
216	0.18
217	0.17
218	0.17
219	0.17
220	0.18
221	0.16
222	0.12
223	0.12
224	0.13
225	0.13
226	0.12
227	0.14
228	0.17
229	0.25
230	0.33
231	0.43
232	0.53
233	0.63
234	0.72
235	0.8
236	0.8
237	0.81
238	0.83
239	0.83
240	0.75
241	0.72
242	0.68
243	0.62
244	0.61
245	0.57
246	0.55
247	0.51
248	0.53
249	0.51
250	0.56
251	0.63
252	0.65
253	0.69
254	0.67
255	0.65
256	0.63
257	0.62
258	0.53
259	0.42
260	0.36
261	0.27
262	0.22
263	0.19
264	0.15
265	0.12
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.15
275	0.16
276	0.18
277	0.26
278	0.3
279	0.36
280	0.42
281	0.47
282	0.49
283	0.57
284	0.61
285	0.6
286	0.62
287	0.6
288	0.58
289	0.56
290	0.57
291	0.5
292	0.49
293	0.44
294	0.37
295	0.35
296	0.35
297	0.32
298	0.26
299	0.27
300	0.25
301	0.24
302	0.26
303	0.25
304	0.27
305	0.29
306	0.31
307	0.27
308	0.27
309	0.25
310	0.24
311	0.22
312	0.18
313	0.15
314	0.15
315	0.16
316	0.16
317	0.16
318	0.14
319	0.14
320	0.13
321	0.14
322	0.11
323	0.1
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.09
329	0.07
330	0.07
331	0.09
332	0.12
333	0.14
334	0.22
335	0.26
336	0.27
337	0.33
338	0.37
339	0.39
340	0.38
341	0.37
342	0.29
343	0.24
344	0.25
345	0.2
346	0.17
347	0.14
348	0.12
349	0.11
350	0.12
351	0.13
352	0.12
353	0.14
354	0.19
355	0.19
356	0.2
357	0.21
358	0.22
359	0.23
360	0.23
361	0.19
362	0.15
363	0.14
364	0.13
365	0.13
366	0.11
367	0.1
368	0.09
369	0.08
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.07
378	0.09
379	0.1
380	0.11
381	0.16
382	0.24
383	0.31
384	0.39
385	0.45
386	0.51
387	0.58
388	0.65
389	0.71
390	0.72
391	0.68
392	0.62
393	0.59
394	0.54
395	0.46
396	0.38
397	0.29
398	0.2
399	0.17
400	0.15
401	0.1
402	0.07
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.09
408	0.13
409	0.2
410	0.24
411	0.3
412	0.4
413	0.49
414	0.6
415	0.7
416	0.76
417	0.77
418	0.8
419	0.81
420	0.79
421	0.75
422	0.66
423	0.56
424	0.46
425	0.38
426	0.3
427	0.22
428	0.14
429	0.09
430	0.11
431	0.12
432	0.13
433	0.15
434	0.15
435	0.17
436	0.26
437	0.34
438	0.39
439	0.48
440	0.58
441	0.67
442	0.76
443	0.81
444	0.78
445	0.75
446	0.68
447	0.64
448	0.56
449	0.45
450	0.4
451	0.39
452	0.32
453	0.25
454	0.22
455	0.16
456	0.13
457	0.14
458	0.1
459	0.06
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.04
467	0.04
468	0.06
469	0.08
470	0.11
471	0.13
472	0.15
473	0.16
474	0.16
475	0.16
476	0.16
477	0.18
478	0.21
479	0.22
480	0.27
481	0.32
482	0.37
483	0.38
484	0.39
485	0.37
486	0.3
487	0.27
488	0.22
489	0.16
490	0.12
491	0.1
492	0.09
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.05
500	0.06
501	0.05
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.09
507	0.11
508	0.13
509	0.15
510	0.15
511	0.17
512	0.16
513	0.19
514	0.18
515	0.21
516	0.23
517	0.22
518	0.22
519	0.22
520	0.22
521	0.19
522	0.18
523	0.15
524	0.11
525	0.09
526	0.09
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.05
537	0.06
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.1
549	0.13
550	0.19
551	0.23
552	0.25
553	0.24
554	0.26
555	0.26
556	0.26
557	0.24
558	0.19
559	0.19
560	0.17
561	0.18
562	0.17
563	0.19
564	0.22
565	0.26
566	0.27
567	0.25
568	0.25
569	0.25
570	0.27
571	0.26
572	0.27
573	0.22
574	0.2
575	0.19
576	0.23
577	0.23
578	0.21
579	0.19
580	0.18
581	0.18
582	0.21
583	0.21
584	0.17
585	0.15
586	0.16
587	0.17
588	0.15
589	0.15
590	0.13
591	0.13
592	0.16
593	0.2
594	0.18
595	0.2
596	0.18
597	0.19
598	0.18
599	0.2
600	0.17
601	0.14
602	0.19
603	0.22
604	0.28
605	0.29
606	0.36
607	0.4
608	0.47
609	0.55
610	0.59
611	0.58
612	0.56
613	0.54
614	0.47
615	0.41
616	0.35
617	0.28
618	0.21
619	0.16
620	0.12
621	0.13
622	0.12
623	0.11
624	0.09
625	0.08
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.08
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.09
636	0.09
637	0.08
638	0.07
639	0.09
640	0.1
641	0.11
642	0.14
643	0.16
644	0.16
645	0.18
646	0.19
647	0.2
648	0.25
649	0.33
650	0.32
651	0.33
652	0.41
653	0.45
654	0.51
655	0.55
656	0.52
657	0.51
658	0.56
659	0.57
660	0.56
661	0.58
662	0.55
663	0.58
664	0.57
665	0.52
666	0.46
667	0.46
668	0.4
669	0.34
670	0.29
671	0.2
672	0.18
673	0.16
674	0.17
675	0.15
676	0.14
677	0.15
678	0.17
679	0.21
680	0.24
681	0.27
682	0.3
683	0.36
684	0.42
685	0.48
686	0.51
687	0.49
688	0.53
689	0.52
690	0.52
691	0.52
692	0.49
693	0.45
694	0.41
695	0.39
696	0.35
697	0.35
698	0.38
699	0.33
700	0.29
701	0.31
702	0.33
703	0.4
704	0.38
705	0.45
706	0.36
707	0.39
708	0.44
709	0.42
710	0.41
711	0.35
712	0.34
713	0.27
714	0.31
715	0.26
716	0.21
717	0.18
718	0.18
719	0.17
720	0.17
721	0.16
722	0.12
723	0.14
724	0.19
725	0.21
726	0.22
727	0.23
728	0.27
729	0.29
730	0.35
731	0.35
732	0.36
733	0.39
734	0.38
735	0.4
736	0.38
737	0.36
738	0.29
739	0.28
740	0.23
741	0.19
742	0.22
743	0.2
744	0.19
745	0.19
746	0.2
747	0.22
748	0.21
749	0.18
750	0.15
751	0.16
752	0.18
753	0.19
754	0.19
755	0.23
756	0.28
757	0.34
758	0.41
759	0.42
760	0.45
761	0.53
762	0.62
763	0.66
764	0.67
765	0.69
766	0.7
767	0.74
768	0.78
769	0.79
770	0.77
771	0.77
772	0.79
773	0.81
774	0.83
775	0.83
776	0.84
777	0.83
778	0.83
779	0.82
780	0.83
781	0.83
782	0.83
783	0.82
784	0.82
785	0.82
786	0.78
787	0.76
788	0.74
789	0.74
790	0.74
791	0.73
792	0.67
793	0.62
794	0.61
795	0.61

A0A0L0VSR1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer