Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HSQ2

Protein Details
Accession C6HSQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-52TISNIRGKRKGPRGLRRSHTAAHydrophilic
276-304TATLRHSKKTHHRSHKNRKHRQHFTSHPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-47RGKRKGPRGLRR
283-295KKTHHRSHKNRKH
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.333, cyto 7, cyto_mito 5.833, cysk 5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023797  RNA3'_phos_cyclase_dom  
IPR037136  RNA3'_phos_cyclase_dom_sf  
IPR000228  RNA3'_term_phos_cyc  
IPR013792  RNA3'P_cycl/enolpyr_Trfase_a/b  
Gene Ontology GO:0003963  F:RNA-3'-phosphate cyclase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01137  RTC  
Amino Acid Sequences MLHLDGSNLEGGGQLVRNALTLSALTGRPVTISNIRGKRKGPRGLRRSHTAAIQFLAEVCGARIVGATVGSSEITFYPRDTENALLNGGTGGDESPSVLQVRARLHRNPLTSPVQSEYNIRLTTPGSIFLIFQALYPYLMYAGARLHTQGEGVSVIPASRVIKLNITGGTNISFSPTYDYVSQVLIPTFAKLGLPSLSVKLNCRGWSTGTVQIGSVSFEIEPLAISSVRRVPAGQTESSCFLPVRYPRISLENLDPGYITRVDITVLAPDTTLRQTATLRHSKKTHHRSHKNRKHRQHFTSHPENQPFKRTTFSESEFDVEESKGLEPSSSGGRGLYDSPSLQSIRSFLEDATMKSVTRSLRVFSDNNAVATKQPSADETPVVRIHTTEPTYDPSHIYILLVAHTSTGFRLGRGQLYSEYQPKERNKESCFPNAEAHLETLLYGMVNECVAGLMEEFTTVTDEEPNDVPKKGTKGCLDTFMRDQVVVFQALGELDEEGKGCKSGNQTEEPGLSLHSLTAMWVCERILGVKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.1
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.15
17 0.18
18 0.2
19 0.25
20 0.34
21 0.42
22 0.48
23 0.52
24 0.56
25 0.61
26 0.65
27 0.7
28 0.71
29 0.73
30 0.77
31 0.81
32 0.84
33 0.82
34 0.79
35 0.72
36 0.67
37 0.6
38 0.53
39 0.44
40 0.37
41 0.29
42 0.23
43 0.21
44 0.15
45 0.11
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.19
69 0.2
70 0.21
71 0.21
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.12
76 0.09
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.14
88 0.21
89 0.27
90 0.32
91 0.34
92 0.42
93 0.47
94 0.5
95 0.48
96 0.48
97 0.48
98 0.44
99 0.43
100 0.38
101 0.34
102 0.32
103 0.32
104 0.29
105 0.28
106 0.27
107 0.24
108 0.23
109 0.2
110 0.23
111 0.21
112 0.19
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.13
117 0.15
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.16
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.16
155 0.15
156 0.15
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.09
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.14
186 0.16
187 0.19
188 0.21
189 0.22
190 0.23
191 0.23
192 0.22
193 0.24
194 0.26
195 0.27
196 0.24
197 0.23
198 0.21
199 0.2
200 0.18
201 0.15
202 0.12
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.17
220 0.2
221 0.2
222 0.18
223 0.19
224 0.21
225 0.21
226 0.21
227 0.15
228 0.12
229 0.15
230 0.16
231 0.2
232 0.2
233 0.21
234 0.21
235 0.25
236 0.26
237 0.23
238 0.24
239 0.23
240 0.22
241 0.2
242 0.19
243 0.15
244 0.16
245 0.14
246 0.11
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.13
264 0.19
265 0.27
266 0.29
267 0.33
268 0.36
269 0.42
270 0.52
271 0.58
272 0.62
273 0.64
274 0.72
275 0.79
276 0.88
277 0.91
278 0.92
279 0.92
280 0.92
281 0.92
282 0.91
283 0.86
284 0.83
285 0.81
286 0.79
287 0.79
288 0.75
289 0.7
290 0.68
291 0.67
292 0.6
293 0.58
294 0.51
295 0.42
296 0.39
297 0.34
298 0.31
299 0.32
300 0.34
301 0.29
302 0.27
303 0.28
304 0.25
305 0.24
306 0.2
307 0.14
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.1
322 0.11
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.1
336 0.15
337 0.16
338 0.16
339 0.18
340 0.17
341 0.15
342 0.15
343 0.19
344 0.15
345 0.18
346 0.18
347 0.16
348 0.19
349 0.23
350 0.24
351 0.23
352 0.3
353 0.27
354 0.27
355 0.26
356 0.23
357 0.2
358 0.21
359 0.2
360 0.13
361 0.12
362 0.13
363 0.16
364 0.17
365 0.18
366 0.18
367 0.21
368 0.22
369 0.23
370 0.2
371 0.18
372 0.19
373 0.22
374 0.23
375 0.2
376 0.2
377 0.23
378 0.26
379 0.26
380 0.25
381 0.2
382 0.2
383 0.18
384 0.16
385 0.13
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.12
395 0.11
396 0.11
397 0.15
398 0.17
399 0.21
400 0.22
401 0.24
402 0.2
403 0.24
404 0.28
405 0.31
406 0.32
407 0.31
408 0.39
409 0.43
410 0.49
411 0.53
412 0.56
413 0.55
414 0.6
415 0.62
416 0.64
417 0.62
418 0.57
419 0.53
420 0.48
421 0.45
422 0.37
423 0.33
424 0.24
425 0.19
426 0.16
427 0.12
428 0.1
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.1
449 0.1
450 0.13
451 0.15
452 0.2
453 0.2
454 0.21
455 0.22
456 0.24
457 0.31
458 0.33
459 0.38
460 0.39
461 0.44
462 0.46
463 0.53
464 0.52
465 0.5
466 0.49
467 0.47
468 0.42
469 0.35
470 0.33
471 0.28
472 0.27
473 0.23
474 0.19
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.09
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.09
488 0.13
489 0.19
490 0.26
491 0.31
492 0.36
493 0.39
494 0.42
495 0.43
496 0.4
497 0.34
498 0.28
499 0.23
500 0.18
501 0.14
502 0.11
503 0.1
504 0.09
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.13