Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HLT8

Protein Details
Accession C6HLT8    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-67EVTEVRQKKSKNSDKERKIDKSKKERKEKREKKEKKEKEEKEKNQDNEVRBasic
107-134TAEEERDKKRKEKKKNRKGIKDKQKVEGBasic
148-175QLGSQPEQKKEKKRNKDKDKKDKTGTTLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-59QKKSKNSDKERKIDKSKKERKEKREKKEKKEKEEKE
94-136KKVKEKKAKDGGETAEEERDKKRKEKKKNRKGIKDKQKVEGGR
155-169QKKEKKRNKDKDKKD
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGDKRKRSQLPAEDDAVEVTEVRQKKSKNSDKERKIDKSKKERKEKREKKEKKEKEEKEKNQDNEVRDDVEVNGNYPDVEMNLANGAAEDDVEKKVKEKKAKDGGETAEEERDKKRKEKKKNRKGIKDKQKVEGGREEKEEHENSAEQLGSQPEQKKEKKRNKDKDKKDKTGTTLTNRHGEITEETHVVETDVAAENGVDENIDGASGHDGEKKNLRLIAFIGNLPFHTTLEAVQKHFAKIEPNDIRLPSEKGGKKGRGFAFIEFDRYDRMKTCLKLYHHSLFDDGKNPARKINVELT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.44
3 0.35
4 0.25
5 0.17
6 0.12
7 0.15
8 0.16
9 0.19
10 0.25
11 0.26
12 0.35
13 0.47
14 0.56
15 0.6
16 0.7
17 0.77
18 0.81
19 0.89
20 0.89
21 0.88
22 0.89
23 0.87
24 0.87
25 0.87
26 0.88
27 0.88
28 0.9
29 0.91
30 0.9
31 0.93
32 0.93
33 0.92
34 0.93
35 0.93
36 0.93
37 0.94
38 0.93
39 0.93
40 0.94
41 0.92
42 0.92
43 0.93
44 0.92
45 0.91
46 0.9
47 0.82
48 0.81
49 0.76
50 0.68
51 0.62
52 0.54
53 0.45
54 0.36
55 0.34
56 0.25
57 0.25
58 0.22
59 0.17
60 0.16
61 0.14
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.06
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.06
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.12
82 0.19
83 0.26
84 0.34
85 0.37
86 0.46
87 0.55
88 0.59
89 0.59
90 0.56
91 0.52
92 0.47
93 0.45
94 0.36
95 0.3
96 0.27
97 0.25
98 0.24
99 0.29
100 0.29
101 0.35
102 0.44
103 0.49
104 0.61
105 0.71
106 0.78
107 0.82
108 0.89
109 0.92
110 0.93
111 0.94
112 0.93
113 0.93
114 0.92
115 0.85
116 0.8
117 0.76
118 0.67
119 0.59
120 0.57
121 0.49
122 0.41
123 0.39
124 0.35
125 0.29
126 0.32
127 0.29
128 0.21
129 0.2
130 0.17
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.11
139 0.15
140 0.18
141 0.26
142 0.32
143 0.4
144 0.5
145 0.6
146 0.67
147 0.75
148 0.82
149 0.86
150 0.91
151 0.92
152 0.93
153 0.93
154 0.91
155 0.87
156 0.8
157 0.74
158 0.72
159 0.66
160 0.62
161 0.59
162 0.53
163 0.51
164 0.46
165 0.42
166 0.34
167 0.3
168 0.24
169 0.2
170 0.19
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.1
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.11
197 0.12
198 0.15
199 0.21
200 0.23
201 0.24
202 0.26
203 0.26
204 0.22
205 0.23
206 0.26
207 0.22
208 0.2
209 0.19
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.19
219 0.22
220 0.2
221 0.25
222 0.26
223 0.26
224 0.27
225 0.27
226 0.25
227 0.25
228 0.34
229 0.34
230 0.36
231 0.39
232 0.38
233 0.4
234 0.36
235 0.38
236 0.3
237 0.35
238 0.35
239 0.39
240 0.47
241 0.51
242 0.52
243 0.57
244 0.57
245 0.55
246 0.54
247 0.49
248 0.48
249 0.41
250 0.43
251 0.34
252 0.32
253 0.3
254 0.29
255 0.29
256 0.24
257 0.27
258 0.29
259 0.31
260 0.37
261 0.4
262 0.43
263 0.48
264 0.54
265 0.58
266 0.53
267 0.52
268 0.49
269 0.46
270 0.44
271 0.42
272 0.38
273 0.38
274 0.43
275 0.43
276 0.43
277 0.44
278 0.43