Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0VDZ5

Protein Details
Accession A0A0L0VDZ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-262IEDKNKTQKKLKRKVIVLEDNEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
234-253AKWKQGIEDKNKTQKKLKRK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, pero 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008906  HATC_C_dom  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05699  Dimer_Tnp_hAT  
Amino Acid Sequences MASDRERPPHQSSCASSALGNQTDDDEPEPNTEANPSTPNSTQPSGATQALTDHEELSCFEVLHPLLRDKYFKLANWEPEWITEAIRLAREMWVTHYKPQPITPTSLAPPSNKARTGMLAGLGSAAAARGGDSSTDAFDMWLAGALVLKGNDPVNPLKWWIQQKKSGNTYGGLVHMALDFLSCPATSVDVERAFSFGRDYVSSKRHRLAPQSISRGMTVAFYSKNKKIKEGMLAKWKQGIEDKNKTQKKLKRKVIVLEDNEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.45
3 0.38
4 0.36
5 0.38
6 0.33
7 0.29
8 0.24
9 0.24
10 0.24
11 0.25
12 0.21
13 0.16
14 0.15
15 0.17
16 0.18
17 0.16
18 0.15
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.18
23 0.17
24 0.2
25 0.21
26 0.25
27 0.28
28 0.29
29 0.28
30 0.26
31 0.28
32 0.28
33 0.28
34 0.24
35 0.18
36 0.18
37 0.19
38 0.2
39 0.16
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.1
47 0.1
48 0.12
49 0.12
50 0.15
51 0.16
52 0.17
53 0.19
54 0.2
55 0.23
56 0.21
57 0.27
58 0.27
59 0.27
60 0.32
61 0.35
62 0.39
63 0.39
64 0.41
65 0.34
66 0.32
67 0.33
68 0.25
69 0.2
70 0.15
71 0.14
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.14
80 0.21
81 0.22
82 0.28
83 0.31
84 0.32
85 0.33
86 0.35
87 0.36
88 0.3
89 0.33
90 0.29
91 0.28
92 0.26
93 0.3
94 0.29
95 0.23
96 0.27
97 0.27
98 0.29
99 0.27
100 0.27
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.19
105 0.15
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.04
112 0.03
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.08
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.16
145 0.22
146 0.31
147 0.36
148 0.4
149 0.46
150 0.53
151 0.58
152 0.6
153 0.57
154 0.49
155 0.43
156 0.39
157 0.32
158 0.26
159 0.18
160 0.13
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.14
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.16
187 0.2
188 0.28
189 0.34
190 0.37
191 0.4
192 0.46
193 0.49
194 0.53
195 0.56
196 0.58
197 0.61
198 0.64
199 0.63
200 0.56
201 0.52
202 0.45
203 0.36
204 0.28
205 0.19
206 0.15
207 0.16
208 0.19
209 0.26
210 0.32
211 0.39
212 0.39
213 0.43
214 0.45
215 0.47
216 0.53
217 0.55
218 0.56
219 0.59
220 0.61
221 0.58
222 0.59
223 0.53
224 0.46
225 0.45
226 0.46
227 0.45
228 0.52
229 0.6
230 0.65
231 0.71
232 0.74
233 0.76
234 0.76
235 0.77
236 0.78
237 0.79
238 0.78
239 0.79
240 0.83
241 0.84
242 0.86