FuNGI

C6HND9

Protein Details

Accession

C6HND9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
64-85	NSANNRQPMRPRKEAQRPGDSA	Hydrophilic
402-422	EDPRHRNKPPSPKTRRRTVAE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
407-417	RNKPPSPKTRR

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 12.5, cyto_mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20
CDD	cd22265 UDM1_RNF168

Amino Acid Sequences

MATAVSTKLPAPKIKRPPPSYIQTGINGAKPSQPSPSPLGSASNRASLAKQPGSVTPISATAANSANNRQPMRPRKEAQRPGDSASRLQRLPIKHPGADGATTDRNQLKRFPEPYVKTTSYILKKYSKVPPSLTIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKIFMKHLKAGTVPHDMIEELVRCGVRFYENCLIVRVVDHKSISTQSNPSSNSNSGEKSSPFSLHNYNQHITPSPFVPYPQQNQSKIKRTTNGSSTGSSHKADEQPVPETSSDTVVPNGVKVGSTNSKQPAMKPKVFTTVLHPTPQSLLAELTLLSMTPDPRVNRRQSQAYPASRTGSAVQTPSISALPSSPISDRPPPAKRQKMMVEPSELLEAEARLIHATAPPLYLEPVDSLTASASLLKFLEDPRHRNKPPSPKTRRRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLGPSTSGNAGGAKPPNVDDESGAAPFEPRFSRFKTLEKIRHEHEEKAKIEHEKKLQQDHAKRLQQEAEKEKRRATEQRLAEEQSREDKRRAQMAAAAAHHAQVQAHAQLLVAQNRARSQSRGNPAMGIPHQPQPRQMVPASQGQQSSPPVRNVTPHSSSPLAGNLMGPQMNQGVPMAITGSSQGVGSPLQVTSGVQHSHPAVMAHPMVNTRSQQGQSRHGTPQMGQGTPAIPHATPIMRNATPTQRMTHASPSASTMAQTPVMNHPIMANPQMNGVMMTPQQQQQAILQQRQQLIMQRNLQAQAGAQQFTPQQMAQLQLQANMHAQQSIQHAQPQQHANIFMQQQAQTQAQQQQQIQQQQQIQQQQQTQQQAQQQQTQPQQQQQQQQQGMMSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.75
3	0.74
4	0.78
5	0.78
6	0.78
7	0.74
8	0.69
9	0.64
10	0.56
11	0.57
12	0.51
13	0.47
14	0.41
15	0.35
16	0.34
17	0.33
18	0.32
19	0.32
20	0.31
21	0.32
22	0.35
23	0.38
24	0.35
25	0.33
26	0.39
27	0.35
28	0.4
29	0.37
30	0.36
31	0.34
32	0.32
33	0.33
34	0.32
35	0.38
36	0.34
37	0.35
38	0.32
39	0.34
40	0.37
41	0.35
42	0.3
43	0.23
44	0.21
45	0.2
46	0.19
47	0.17
48	0.16
49	0.18
50	0.19
51	0.21
52	0.24
53	0.28
54	0.34
55	0.35
56	0.37
57	0.45
58	0.53
59	0.59
60	0.64
61	0.66
62	0.69
63	0.78
64	0.83
65	0.82
66	0.81
67	0.76
68	0.72
69	0.72
70	0.64
71	0.59
72	0.57
73	0.54
74	0.44
75	0.45
76	0.45
77	0.42
78	0.47
79	0.51
80	0.48
81	0.43
82	0.44
83	0.44
84	0.42
85	0.38
86	0.33
87	0.28
88	0.27
89	0.27
90	0.31
91	0.32
92	0.33
93	0.34
94	0.38
95	0.38
96	0.43
97	0.46
98	0.48
99	0.53
100	0.55
101	0.58
102	0.6
103	0.57
104	0.5
105	0.49
106	0.51
107	0.48
108	0.46
109	0.47
110	0.45
111	0.46
112	0.51
113	0.58
114	0.56
115	0.54
116	0.54
117	0.57
118	0.57
119	0.59
120	0.56
121	0.49
122	0.48
123	0.46
124	0.45
125	0.4
126	0.37
127	0.37
128	0.34
129	0.34
130	0.32
131	0.32
132	0.38
133	0.35
134	0.38
135	0.36
136	0.39
137	0.37
138	0.33
139	0.33
140	0.28
141	0.26
142	0.21
143	0.2
144	0.17
145	0.2
146	0.23
147	0.27
148	0.26
149	0.3
150	0.3
151	0.29
152	0.3
153	0.29
154	0.31
155	0.31
156	0.28
157	0.25
158	0.25
159	0.22
160	0.21
161	0.21
162	0.17
163	0.1
164	0.13
165	0.12
166	0.11
167	0.12
168	0.13
169	0.15
170	0.14
171	0.21
172	0.27
173	0.3
174	0.3
175	0.32
176	0.31
177	0.26
178	0.27
179	0.24
180	0.19
181	0.19
182	0.19
183	0.18
184	0.19
185	0.22
186	0.23
187	0.23
188	0.24
189	0.24
190	0.29
191	0.31
192	0.32
193	0.34
194	0.33
195	0.33
196	0.32
197	0.31
198	0.28
199	0.28
200	0.26
201	0.24
202	0.25
203	0.24
204	0.22
205	0.24
206	0.28
207	0.31
208	0.37
209	0.4
210	0.38
211	0.37
212	0.37
213	0.37
214	0.32
215	0.28
216	0.22
217	0.2
218	0.19
219	0.19
220	0.23
221	0.26
222	0.3
223	0.37
224	0.43
225	0.46
226	0.54
227	0.61
228	0.65
229	0.66
230	0.66
231	0.62
232	0.61
233	0.61
234	0.58
235	0.56
236	0.49
237	0.44
238	0.42
239	0.4
240	0.38
241	0.32
242	0.28
243	0.26
244	0.26
245	0.27
246	0.28
247	0.25
248	0.25
249	0.26
250	0.27
251	0.22
252	0.21
253	0.19
254	0.17
255	0.15
256	0.13
257	0.12
258	0.12
259	0.12
260	0.1
261	0.1
262	0.08
263	0.07
264	0.07
265	0.12
266	0.15
267	0.16
268	0.21
269	0.23
270	0.28
271	0.29
272	0.33
273	0.39
274	0.42
275	0.46
276	0.45
277	0.44
278	0.46
279	0.47
280	0.43
281	0.39
282	0.4
283	0.38
284	0.36
285	0.34
286	0.28
287	0.27
288	0.28
289	0.22
290	0.13
291	0.11
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.11
303	0.13
304	0.19
305	0.27
306	0.32
307	0.38
308	0.42
309	0.47
310	0.46
311	0.53
312	0.55
313	0.53
314	0.52
315	0.47
316	0.45
317	0.38
318	0.37
319	0.3
320	0.24
321	0.2
322	0.16
323	0.14
324	0.12
325	0.12
326	0.12
327	0.11
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.08
332	0.08
333	0.1
334	0.09
335	0.11
336	0.15
337	0.19
338	0.22
339	0.27
340	0.31
341	0.38
342	0.47
343	0.53
344	0.51
345	0.53
346	0.56
347	0.58
348	0.58
349	0.52
350	0.46
351	0.38
352	0.37
353	0.32
354	0.26
355	0.18
356	0.13
357	0.1
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.16
389	0.18
390	0.24
391	0.3
392	0.39
393	0.4
394	0.46
395	0.52
396	0.55
397	0.61
398	0.67
399	0.71
400	0.72
401	0.77
402	0.81
403	0.8
404	0.74
405	0.69
406	0.62
407	0.59
408	0.5
409	0.45
410	0.36
411	0.29
412	0.24
413	0.18
414	0.14
415	0.06
416	0.04
417	0.04
418	0.02
419	0.02
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.04
427	0.05
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.1
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.1
449	0.11
450	0.12
451	0.11
452	0.11
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.1
457	0.09
458	0.1
459	0.13
460	0.17
461	0.23
462	0.25
463	0.3
464	0.36
465	0.44
466	0.5
467	0.53
468	0.54
469	0.5
470	0.57
471	0.55
472	0.52
473	0.51
474	0.51
475	0.46
476	0.45
477	0.46
478	0.43
479	0.44
480	0.44
481	0.43
482	0.4
483	0.43
484	0.46
485	0.49
486	0.51
487	0.54
488	0.57
489	0.6
490	0.59
491	0.56
492	0.53
493	0.52
494	0.47
495	0.48
496	0.48
497	0.49
498	0.52
499	0.53
500	0.53
501	0.5
502	0.51
503	0.52
504	0.51
505	0.5
506	0.46
507	0.49
508	0.5
509	0.5
510	0.47
511	0.41
512	0.35
513	0.35
514	0.37
515	0.34
516	0.33
517	0.36
518	0.36
519	0.41
520	0.4
521	0.33
522	0.31
523	0.31
524	0.33
525	0.28
526	0.27
527	0.2
528	0.2
529	0.19
530	0.16
531	0.12
532	0.08
533	0.09
534	0.08
535	0.08
536	0.08
537	0.07
538	0.1
539	0.14
540	0.15
541	0.16
542	0.16
543	0.17
544	0.19
545	0.23
546	0.21
547	0.2
548	0.24
549	0.3
550	0.37
551	0.4
552	0.38
553	0.36
554	0.34
555	0.37
556	0.33
557	0.29
558	0.24
559	0.27
560	0.31
561	0.3
562	0.33
563	0.34
564	0.35
565	0.35
566	0.33
567	0.3
568	0.28
569	0.35
570	0.35
571	0.31
572	0.3
573	0.26
574	0.29
575	0.29
576	0.31
577	0.27
578	0.28
579	0.28
580	0.28
581	0.32
582	0.34
583	0.37
584	0.36
585	0.34
586	0.35
587	0.33
588	0.33
589	0.3
590	0.26
591	0.2
592	0.16
593	0.15
594	0.12
595	0.13
596	0.12
597	0.11
598	0.1
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.09
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.05
608	0.05
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.07
617	0.07
618	0.06
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.08
623	0.12
624	0.13
625	0.12
626	0.14
627	0.14
628	0.15
629	0.16
630	0.14
631	0.11
632	0.13
633	0.15
634	0.13
635	0.13
636	0.14
637	0.15
638	0.17
639	0.18
640	0.17
641	0.21
642	0.23
643	0.3
644	0.33
645	0.4
646	0.43
647	0.46
648	0.47
649	0.46
650	0.45
651	0.38
652	0.42
653	0.38
654	0.32
655	0.28
656	0.26
657	0.24
658	0.23
659	0.24
660	0.17
661	0.12
662	0.12
663	0.15
664	0.16
665	0.16
666	0.18
667	0.23
668	0.21
669	0.24
670	0.27
671	0.32
672	0.36
673	0.37
674	0.36
675	0.34
676	0.38
677	0.39
678	0.42
679	0.38
680	0.33
681	0.32
682	0.32
683	0.3
684	0.27
685	0.24
686	0.18
687	0.16
688	0.18
689	0.18
690	0.17
691	0.2
692	0.24
693	0.23
694	0.21
695	0.2
696	0.2
697	0.23
698	0.25
699	0.21
700	0.18
701	0.19
702	0.2
703	0.18
704	0.16
705	0.13
706	0.12
707	0.11
708	0.15
709	0.17
710	0.19
711	0.22
712	0.22
713	0.22
714	0.22
715	0.31
716	0.35
717	0.37
718	0.37
719	0.4
720	0.42
721	0.43
722	0.42
723	0.4
724	0.4
725	0.42
726	0.44
727	0.43
728	0.45
729	0.44
730	0.42
731	0.35
732	0.28
733	0.28
734	0.26
735	0.22
736	0.19
737	0.2
738	0.21
739	0.22
740	0.25
741	0.17
742	0.16
743	0.17
744	0.21
745	0.2
746	0.25
747	0.24
748	0.25
749	0.25
750	0.24
751	0.24
752	0.24
753	0.23
754	0.17
755	0.16
756	0.16
757	0.22
758	0.25
759	0.24
760	0.28
761	0.31
762	0.34
763	0.42
764	0.43
765	0.41
766	0.4
767	0.41
768	0.37
769	0.4
770	0.37
771	0.33
772	0.32
773	0.3
774	0.29
775	0.31
776	0.31
777	0.27
778	0.31
779	0.35
780	0.35
781	0.4
782	0.39
783	0.42
784	0.48
785	0.55
786	0.53
787	0.52
788	0.53
789	0.54
790	0.6
791	0.61
792	0.59
793	0.57
794	0.58
795	0.59
796	0.61
797	0.62
798	0.58
799	0.55
800	0.57
801	0.59
802	0.58
803	0.6
804	0.59
805	0.59
806	0.64
807	0.68
808	0.67
809	0.67
810	0.71
811	0.69
812	0.73
813	0.73
814	0.75
815	0.69
816	0.65

C6HND9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer