Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HG42

Protein Details
Accession C6HG42    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-152SPTSPAKSKKGGKKHVTQPTQPHydrophilic
157-182LSQASLFKPKYKPKDKRETYQRLLRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-143KKGGK
292-296KKRGK
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 7, mito 6, nucl 3.5, plas 3, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045260  Sec12-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0009306  P:protein secretion  
GO:0003400  P:regulation of COPII vesicle coating  
Amino Acid Sequences MAPDISSAKITLSCPLFGVDFDPRNNGFLLVGGGGGEGRSGVGNKIASNPNPRSTALLNTSQRNEISEIANIELSRDEDSVTSLAVSKSNDKSIIALAGINSSVAEQQRDNNEHLRSFQLDYPPGQVPASSPTSPAKSKKGGKKHVTQPTQPMITPLSQASLFKPKYKPKDKRETYQRLLRLSPWKGEEAPRIGVVATGLAPQGEMVVFNATSPAPKESDIVGRVWLEGRDEVEDVDMLPASEGDNGKFKVAFTDGTSIYTLKISASTRSNETPKTKVVYTLPFPDYFARSKKRGKIRALRFLSPTSFLILLNLPDRAGCELAIISLGLAPEGTVVRRTRLPRGMKIGLGLDVCPLSESAMGTRQFIVAVSSNDNSIQILTLECKRKGKPAFSKFRPYATLRNVHPFSMTRLAFSTFTPPAQPVSADVRPQDVKLASISVGNTVVVHSLPITASLPKSRHPRYVLVQPGPSELLQTLLSGFMALIVVALGAFFLQVFTEIRGGVPPALGAHDWLSPKIRSMIARPYLFENGLSSQYQKWRSPTDPLSISATTTTVTSTITTPVMQITPTQSLRDLLSSLSRALPEATPLPETPDESALDHMKIVIHEHPDDPSLVAVTTLSHTYGDGDSDKVGNAGAEKAQHPRKWADLHEHEREAWKAKLSAAGHWAKEEGEAILRGLFFGQVAGVMAGAVGGMMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.21
4 0.18
5 0.21
6 0.23
7 0.25
8 0.26
9 0.31
10 0.3
11 0.31
12 0.32
13 0.28
14 0.2
15 0.16
16 0.16
17 0.11
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.04
25 0.04
26 0.05
27 0.06
28 0.07
29 0.11
30 0.13
31 0.14
32 0.21
33 0.27
34 0.31
35 0.39
36 0.44
37 0.45
38 0.47
39 0.47
40 0.45
41 0.41
42 0.43
43 0.39
44 0.43
45 0.43
46 0.46
47 0.48
48 0.47
49 0.45
50 0.4
51 0.37
52 0.3
53 0.27
54 0.24
55 0.23
56 0.21
57 0.22
58 0.19
59 0.18
60 0.16
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.12
65 0.11
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.15
74 0.19
75 0.22
76 0.25
77 0.26
78 0.24
79 0.25
80 0.24
81 0.23
82 0.18
83 0.15
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.08
89 0.07
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.17
95 0.26
96 0.29
97 0.32
98 0.35
99 0.37
100 0.36
101 0.37
102 0.36
103 0.31
104 0.31
105 0.31
106 0.31
107 0.3
108 0.3
109 0.32
110 0.31
111 0.29
112 0.26
113 0.22
114 0.17
115 0.2
116 0.24
117 0.2
118 0.21
119 0.23
120 0.28
121 0.34
122 0.37
123 0.39
124 0.42
125 0.51
126 0.58
127 0.65
128 0.71
129 0.73
130 0.78
131 0.82
132 0.83
133 0.81
134 0.77
135 0.74
136 0.71
137 0.66
138 0.56
139 0.48
140 0.4
141 0.34
142 0.31
143 0.22
144 0.17
145 0.15
146 0.16
147 0.17
148 0.25
149 0.25
150 0.3
151 0.38
152 0.44
153 0.54
154 0.65
155 0.72
156 0.72
157 0.82
158 0.83
159 0.85
160 0.87
161 0.87
162 0.84
163 0.82
164 0.77
165 0.7
166 0.64
167 0.6
168 0.58
169 0.51
170 0.47
171 0.41
172 0.39
173 0.37
174 0.4
175 0.39
176 0.34
177 0.33
178 0.28
179 0.26
180 0.23
181 0.21
182 0.16
183 0.11
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.15
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.11
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.15
246 0.14
247 0.13
248 0.11
249 0.07
250 0.1
251 0.09
252 0.12
253 0.15
254 0.17
255 0.2
256 0.24
257 0.27
258 0.3
259 0.32
260 0.32
261 0.32
262 0.33
263 0.3
264 0.29
265 0.3
266 0.29
267 0.28
268 0.32
269 0.31
270 0.27
271 0.28
272 0.27
273 0.26
274 0.25
275 0.28
276 0.27
277 0.31
278 0.38
279 0.44
280 0.52
281 0.58
282 0.64
283 0.68
284 0.71
285 0.76
286 0.74
287 0.7
288 0.62
289 0.56
290 0.48
291 0.4
292 0.31
293 0.23
294 0.18
295 0.15
296 0.13
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.07
322 0.08
323 0.09
324 0.14
325 0.17
326 0.22
327 0.29
328 0.33
329 0.34
330 0.41
331 0.41
332 0.37
333 0.36
334 0.31
335 0.24
336 0.2
337 0.16
338 0.1
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.09
363 0.07
364 0.06
365 0.04
366 0.05
367 0.06
368 0.12
369 0.16
370 0.18
371 0.22
372 0.23
373 0.31
374 0.35
375 0.42
376 0.47
377 0.53
378 0.61
379 0.63
380 0.71
381 0.65
382 0.64
383 0.6
384 0.53
385 0.5
386 0.46
387 0.47
388 0.39
389 0.46
390 0.44
391 0.39
392 0.37
393 0.3
394 0.29
395 0.3
396 0.28
397 0.2
398 0.2
399 0.22
400 0.21
401 0.21
402 0.21
403 0.15
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.13
410 0.11
411 0.16
412 0.18
413 0.19
414 0.18
415 0.21
416 0.21
417 0.22
418 0.22
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.14
423 0.1
424 0.11
425 0.11
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.05
433 0.05
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.09
441 0.14
442 0.15
443 0.2
444 0.3
445 0.32
446 0.38
447 0.41
448 0.45
449 0.45
450 0.52
451 0.54
452 0.49
453 0.48
454 0.42
455 0.39
456 0.36
457 0.31
458 0.22
459 0.14
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.02
475 0.02
476 0.02
477 0.02
478 0.02
479 0.02
480 0.02
481 0.02
482 0.04
483 0.04
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.07
493 0.06
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.12
499 0.12
500 0.14
501 0.17
502 0.16
503 0.17
504 0.19
505 0.21
506 0.19
507 0.23
508 0.31
509 0.35
510 0.36
511 0.36
512 0.37
513 0.37
514 0.35
515 0.31
516 0.24
517 0.18
518 0.2
519 0.19
520 0.17
521 0.18
522 0.25
523 0.3
524 0.31
525 0.34
526 0.37
527 0.39
528 0.46
529 0.46
530 0.47
531 0.43
532 0.42
533 0.43
534 0.37
535 0.35
536 0.27
537 0.23
538 0.16
539 0.14
540 0.12
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.1
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.12
550 0.12
551 0.11
552 0.12
553 0.14
554 0.19
555 0.2
556 0.21
557 0.21
558 0.22
559 0.22
560 0.22
561 0.19
562 0.14
563 0.16
564 0.16
565 0.17
566 0.17
567 0.16
568 0.15
569 0.17
570 0.16
571 0.15
572 0.17
573 0.17
574 0.18
575 0.18
576 0.23
577 0.22
578 0.24
579 0.22
580 0.22
581 0.21
582 0.19
583 0.23
584 0.2
585 0.19
586 0.17
587 0.16
588 0.15
589 0.14
590 0.16
591 0.16
592 0.18
593 0.2
594 0.21
595 0.22
596 0.22
597 0.22
598 0.19
599 0.16
600 0.13
601 0.11
602 0.1
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.11
611 0.11
612 0.13
613 0.12
614 0.13
615 0.13
616 0.14
617 0.14
618 0.12
619 0.11
620 0.09
621 0.09
622 0.1
623 0.11
624 0.13
625 0.15
626 0.24
627 0.32
628 0.34
629 0.38
630 0.4
631 0.45
632 0.48
633 0.51
634 0.52
635 0.55
636 0.6
637 0.63
638 0.62
639 0.57
640 0.56
641 0.54
642 0.49
643 0.41
644 0.38
645 0.32
646 0.3
647 0.35
648 0.32
649 0.33
650 0.36
651 0.4
652 0.36
653 0.36
654 0.35
655 0.28
656 0.28
657 0.25
658 0.17
659 0.14
660 0.14
661 0.14
662 0.15
663 0.14
664 0.13
665 0.13
666 0.11
667 0.08
668 0.08
669 0.07
670 0.05
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.04
677 0.04