Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0VNS1

Protein Details
Accession A0A0L0VNS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-307SSAVNATNENRKKKKVKKTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-307RKKKKVKKTK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.666, mito_nucl 11.166, cyto_mito 6.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
CDD cd11372  RNase_PH_RRP46  
Amino Acid Sequences MSIIRSDSRTEVDVRSLTMRMSILSRSDGSGQFSFGDLKALGAVTGPAEVRIRDEKPTEASIEVNVVPVCGLPGPQTKSLAHSIKQFFAPLILVKKYPRSLIQINLQTLSKPSDRWTNGFSTSSLEDVPVRLFDETQSVTEKAALINAASLALLDAGVGMRGCGFAVGVAIIPASVTKSNNNLDNDNSDHIVLDPNPTEESSAKSLHLIGLHFGHQFNTPSSDGLNVGHVTLCESNGNFSFDQLQTVLKYGSLATQQILEFVRRSCETVYQQHEPDQEENSNPSDPNSSAVNATNENRKKKKVKKTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.24
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.16
8 0.17
9 0.17
10 0.16
11 0.19
12 0.19
13 0.19
14 0.23
15 0.23
16 0.27
17 0.25
18 0.24
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.17
23 0.18
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.08
30 0.08
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.13
38 0.19
39 0.2
40 0.23
41 0.25
42 0.26
43 0.29
44 0.31
45 0.29
46 0.25
47 0.24
48 0.2
49 0.2
50 0.18
51 0.16
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.14
61 0.18
62 0.2
63 0.23
64 0.23
65 0.27
66 0.34
67 0.35
68 0.31
69 0.35
70 0.36
71 0.35
72 0.36
73 0.32
74 0.24
75 0.22
76 0.2
77 0.15
78 0.16
79 0.15
80 0.17
81 0.18
82 0.23
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.27
87 0.29
88 0.32
89 0.38
90 0.39
91 0.38
92 0.37
93 0.34
94 0.29
95 0.27
96 0.26
97 0.19
98 0.14
99 0.15
100 0.22
101 0.24
102 0.26
103 0.28
104 0.27
105 0.29
106 0.29
107 0.27
108 0.21
109 0.19
110 0.18
111 0.15
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.03
155 0.03
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.11
166 0.14
167 0.19
168 0.21
169 0.21
170 0.21
171 0.24
172 0.24
173 0.22
174 0.21
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.13
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.15
204 0.14
205 0.17
206 0.16
207 0.15
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.14
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.12
223 0.13
224 0.17
225 0.14
226 0.15
227 0.18
228 0.17
229 0.18
230 0.16
231 0.16
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.1
236 0.11
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.14
243 0.14
244 0.16
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.16
249 0.21
250 0.19
251 0.22
252 0.2
253 0.26
254 0.3
255 0.37
256 0.43
257 0.44
258 0.45
259 0.48
260 0.5
261 0.47
262 0.43
263 0.4
264 0.35
265 0.32
266 0.33
267 0.3
268 0.29
269 0.25
270 0.25
271 0.24
272 0.22
273 0.22
274 0.21
275 0.19
276 0.19
277 0.23
278 0.24
279 0.25
280 0.28
281 0.36
282 0.42
283 0.51
284 0.56
285 0.62
286 0.69
287 0.75