Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0VCM2

Protein Details
Accession A0A0L0VCM2    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MGETKRLTKKQLKTTAFRTKKKIKELIEHydrophilic
52-80DNNTKKVSSSSSKKRKRDKPSTEDKPNDGHydrophilic
93-117GVISTTASKRRKRKNAAKLKEKEDIHydrophilic
283-306GSRPNPSKKSLTRPSNPTRFKPHFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-70SKKRKRDK
101-121KRRKRKNAAKLKEKEDIQKRK
235-236KK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGETKRLTKKQLKTTAFRTKKKIKELIEDKTQALPDQDEEVEGILNKAEGQDNNTKKVSSSSSKKRKRDKPSTEDKPNDGDKQDEDADTSKTGVISTTASKRRKRKNAAKLKEKEDIQKRKTSKLILFIGNLPFDISVERLKSFFSEHCGEEPSVRLMTSKTSQLATVQPPTKGCGFIEFETSAALQKALRLHHTPLSAETEGPTNSRENVEKKARKINIELTAGGGGTSENRRKKIHDSHLRLAKQRDKILEKRIKSSTLEKSNNPTAASADPQFDVSIKLGSRPNPSKKSLTRPSNPTRFKPHFSGANAIRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.83
4 0.81
5 0.8
6 0.8
7 0.81
8 0.83
9 0.82
10 0.77
11 0.78
12 0.79
13 0.77
14 0.76
15 0.7
16 0.62
17 0.58
18 0.52
19 0.42
20 0.36
21 0.29
22 0.21
23 0.22
24 0.2
25 0.16
26 0.15
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.1
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.07
35 0.1
36 0.1
37 0.15
38 0.25
39 0.28
40 0.33
41 0.35
42 0.33
43 0.31
44 0.34
45 0.35
46 0.34
47 0.41
48 0.47
49 0.57
50 0.67
51 0.76
52 0.82
53 0.86
54 0.88
55 0.89
56 0.89
57 0.88
58 0.89
59 0.9
60 0.9
61 0.85
62 0.77
63 0.72
64 0.66
65 0.6
66 0.51
67 0.42
68 0.33
69 0.33
70 0.31
71 0.25
72 0.22
73 0.19
74 0.2
75 0.18
76 0.17
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.12
84 0.19
85 0.27
86 0.35
87 0.42
88 0.52
89 0.61
90 0.7
91 0.77
92 0.8
93 0.82
94 0.87
95 0.89
96 0.91
97 0.87
98 0.83
99 0.79
100 0.71
101 0.69
102 0.68
103 0.68
104 0.61
105 0.62
106 0.59
107 0.58
108 0.59
109 0.56
110 0.48
111 0.46
112 0.46
113 0.4
114 0.39
115 0.36
116 0.33
117 0.27
118 0.24
119 0.16
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.14
133 0.15
134 0.16
135 0.17
136 0.19
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.08
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.16
153 0.16
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.21
158 0.23
159 0.22
160 0.19
161 0.17
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.18
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.12
171 0.09
172 0.09
173 0.05
174 0.07
175 0.1
176 0.11
177 0.15
178 0.16
179 0.19
180 0.22
181 0.23
182 0.22
183 0.21
184 0.25
185 0.22
186 0.2
187 0.18
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.11
193 0.12
194 0.14
195 0.17
196 0.18
197 0.26
198 0.35
199 0.39
200 0.43
201 0.51
202 0.53
203 0.52
204 0.53
205 0.53
206 0.49
207 0.46
208 0.42
209 0.34
210 0.31
211 0.27
212 0.22
213 0.15
214 0.08
215 0.08
216 0.14
217 0.2
218 0.24
219 0.28
220 0.3
221 0.34
222 0.43
223 0.51
224 0.56
225 0.6
226 0.64
227 0.69
228 0.77
229 0.77
230 0.74
231 0.72
232 0.68
233 0.64
234 0.61
235 0.59
236 0.58
237 0.6
238 0.65
239 0.67
240 0.62
241 0.62
242 0.61
243 0.57
244 0.53
245 0.54
246 0.53
247 0.55
248 0.57
249 0.54
250 0.57
251 0.6
252 0.59
253 0.52
254 0.42
255 0.34
256 0.31
257 0.32
258 0.26
259 0.21
260 0.19
261 0.19
262 0.19
263 0.17
264 0.16
265 0.13
266 0.15
267 0.14
268 0.18
269 0.21
270 0.25
271 0.35
272 0.42
273 0.51
274 0.54
275 0.59
276 0.65
277 0.68
278 0.74
279 0.75
280 0.76
281 0.74
282 0.78
283 0.83
284 0.84
285 0.84
286 0.81
287 0.81
288 0.78
289 0.76
290 0.73
291 0.69
292 0.66
293 0.63
294 0.65
295 0.58