Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0VSV8

Protein Details
Accession A0A0L0VSV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
249-271IDYSTPSKRPSKRHHKLDSDMEPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTDADISEEDGYASSDWEPRENVKPRFYIPSEPSSALLNGANITEDSCHIAEEDGYASSDWEPRENVKPRFYIPSKPSSALLDGANITEDSCHIAEEDRYASSDWEPRENVKPRFYIPSEPSSALINGTNIADNVDPFANGSPEGLACIDPNRQFKFDTHRMKSQQSVCVILKGFPYSTTETDIQVHLRELGVQPDRIVICMDEHQHSCRFGFVTFPNVEVASQLVDTHFPGIQWPVPGGVDNTIEVLIDYSTPSKRPSKRHHKLDSDMEPHILKKQCVSPTQGGTTAGPSTIRLVPPAPSSPRPITGANSNRLPSRDVDAVNQTRYPCQDCGINYPSEERLANHLTKSSHKEKVESNNSKGKARG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.14
4 0.17
5 0.19
6 0.22
7 0.32
8 0.4
9 0.45
10 0.48
11 0.5
12 0.51
13 0.57
14 0.56
15 0.56
16 0.51
17 0.53
18 0.51
19 0.48
20 0.46
21 0.39
22 0.36
23 0.29
24 0.24
25 0.18
26 0.13
27 0.12
28 0.12
29 0.09
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.14
47 0.14
48 0.16
49 0.18
50 0.22
51 0.32
52 0.4
53 0.45
54 0.48
55 0.5
56 0.51
57 0.58
58 0.57
59 0.56
60 0.52
61 0.55
62 0.53
63 0.51
64 0.48
65 0.41
66 0.4
67 0.33
68 0.28
69 0.21
70 0.17
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.1
75 0.08
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.12
84 0.14
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.18
91 0.17
92 0.2
93 0.22
94 0.26
95 0.35
96 0.44
97 0.48
98 0.49
99 0.52
100 0.51
101 0.57
102 0.56
103 0.56
104 0.51
105 0.53
106 0.51
107 0.48
108 0.45
109 0.37
110 0.34
111 0.26
112 0.21
113 0.14
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.07
136 0.11
137 0.15
138 0.2
139 0.22
140 0.23
141 0.24
142 0.25
143 0.33
144 0.39
145 0.44
146 0.44
147 0.49
148 0.52
149 0.53
150 0.57
151 0.53
152 0.48
153 0.39
154 0.39
155 0.32
156 0.31
157 0.29
158 0.24
159 0.2
160 0.16
161 0.15
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.17
171 0.15
172 0.13
173 0.12
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.14
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.09
187 0.08
188 0.1
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.17
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.12
208 0.12
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.09
240 0.1
241 0.14
242 0.23
243 0.29
244 0.39
245 0.49
246 0.58
247 0.68
248 0.77
249 0.83
250 0.83
251 0.83
252 0.82
253 0.8
254 0.73
255 0.64
256 0.55
257 0.47
258 0.39
259 0.39
260 0.33
261 0.25
262 0.24
263 0.29
264 0.33
265 0.35
266 0.41
267 0.4
268 0.41
269 0.43
270 0.41
271 0.36
272 0.31
273 0.3
274 0.23
275 0.18
276 0.14
277 0.12
278 0.14
279 0.16
280 0.16
281 0.15
282 0.16
283 0.18
284 0.21
285 0.27
286 0.29
287 0.29
288 0.35
289 0.37
290 0.39
291 0.4
292 0.38
293 0.36
294 0.4
295 0.44
296 0.43
297 0.45
298 0.44
299 0.44
300 0.43
301 0.42
302 0.34
303 0.32
304 0.32
305 0.28
306 0.3
307 0.36
308 0.4
309 0.41
310 0.41
311 0.37
312 0.35
313 0.38
314 0.38
315 0.3
316 0.28
317 0.3
318 0.29
319 0.35
320 0.36
321 0.34
322 0.3
323 0.32
324 0.32
325 0.3
326 0.29
327 0.22
328 0.25
329 0.29
330 0.31
331 0.29
332 0.32
333 0.32
334 0.38
335 0.45
336 0.45
337 0.48
338 0.48
339 0.5
340 0.53
341 0.62
342 0.66
343 0.66
344 0.66
345 0.67
346 0.68