Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0V5V5

Protein Details
Accession A0A0L0V5V5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-202TPPERMKKSTRTRSSIKNPKKEAQSIHydrophilic
215-234GKPPERYSEDRKQRRDDPSVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-201KKSTRTRSSIKNPKKEAQS
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004806  Rad23  
IPR036870  Ribosomal_S18_sf  
IPR015940  UBA  
IPR009060  UBA-like_sf  
IPR015360  XPC-bd  
IPR036353  XPC-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0031593  F:polyubiquitin modification-dependent protein binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00627  UBA  
PF09280  XPC-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50030  UBA  
CDD cd14281  UBA2_Rad23_like  
Amino Acid Sequences MIQLHQLAQQNHHLLQPCLQQLAKSDPNLLAGLTRCPILLMSFLAEGTEGLEDDAGFPPGMLGAGAGGADDQTQYVQVGQEECDAIERLVGTGFERQLVLQAYFACDKNAKMAANYSIEHDFDDLEDAAERETRKPRAAIKITPSKEEGKLSDPVLYCDMKVLNESYDVDLLANSITPPERMKKSTRTRSSIKNPKKEAQSIRRARALSFLPYFGKPPERYSEDRKQRRDDPSVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.37
4 0.32
5 0.31
6 0.3
7 0.28
8 0.28
9 0.36
10 0.36
11 0.31
12 0.31
13 0.28
14 0.3
15 0.3
16 0.26
17 0.2
18 0.16
19 0.17
20 0.15
21 0.15
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.06
36 0.05
37 0.04
38 0.05
39 0.05
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.04
49 0.04
50 0.02
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.02
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.12
91 0.13
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.15
97 0.13
98 0.11
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.16
103 0.15
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.09
109 0.07
110 0.08
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.08
118 0.1
119 0.15
120 0.18
121 0.19
122 0.22
123 0.27
124 0.35
125 0.39
126 0.4
127 0.42
128 0.5
129 0.49
130 0.49
131 0.47
132 0.4
133 0.38
134 0.35
135 0.3
136 0.23
137 0.25
138 0.23
139 0.25
140 0.22
141 0.22
142 0.22
143 0.21
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.11
148 0.13
149 0.12
150 0.09
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.1
166 0.16
167 0.21
168 0.25
169 0.31
170 0.4
171 0.5
172 0.6
173 0.66
174 0.67
175 0.68
176 0.74
177 0.8
178 0.81
179 0.8
180 0.79
181 0.78
182 0.79
183 0.8
184 0.79
185 0.78
186 0.77
187 0.78
188 0.77
189 0.76
190 0.75
191 0.68
192 0.59
193 0.55
194 0.48
195 0.44
196 0.37
197 0.34
198 0.31
199 0.31
200 0.33
201 0.31
202 0.37
203 0.32
204 0.34
205 0.39
206 0.43
207 0.48
208 0.54
209 0.61
210 0.64
211 0.72
212 0.76
213 0.75
214 0.77
215 0.8