Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H7J0

Protein Details
Accession C6H7J0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-132VSTPAKKNAKPTKKTAKRTVKKSTKAKPKVKVTPKRKQPTEKQKEALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-138SKKPVSTPAKKNAKPTKKTAKRTVKKSTKAKPKVKVTPKRKQPTEKQKEALQKKKAR
221-233ARRRLRRLLNKKR
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MTFVLARRGRVLLRCVNLVESSSTGARMAVANAPAYRSVIVFSRNLSSSSNARLFRRTIPILSKKTYATAARGAKAGGTTTSKKPVSTPAKKNAKPTKKTAKRTVKKSTKAKPKVKVTPKRKQPTEKQKEALQKKKAREAIVELKATALEPPKSLPETAYILLQQQHKQFAGISDTYKNLPSEERQRLDEIAESNRAANRAAFHDWVNRHTPLQIKEANAARRRLRRLLNKKRGFMEISDDRQPKRPANAYMHFVKEVSASGDVSTSDRMKKCAELWRSLSMSEKEKYQQMALEAKNRYIHDFKSAYGTDPPTRSRSASPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.39
4 0.35
5 0.32
6 0.27
7 0.2
8 0.19
9 0.17
10 0.16
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.11
15 0.12
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.16
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.2
31 0.2
32 0.21
33 0.22
34 0.23
35 0.23
36 0.29
37 0.34
38 0.33
39 0.34
40 0.37
41 0.38
42 0.4
43 0.44
44 0.4
45 0.38
46 0.44
47 0.51
48 0.53
49 0.54
50 0.51
51 0.44
52 0.44
53 0.44
54 0.37
55 0.31
56 0.33
57 0.34
58 0.33
59 0.32
60 0.3
61 0.25
62 0.24
63 0.21
64 0.15
65 0.16
66 0.19
67 0.21
68 0.29
69 0.29
70 0.29
71 0.3
72 0.37
73 0.43
74 0.49
75 0.54
76 0.57
77 0.67
78 0.7
79 0.79
80 0.79
81 0.79
82 0.74
83 0.76
84 0.77
85 0.76
86 0.82
87 0.82
88 0.83
89 0.82
90 0.85
91 0.87
92 0.86
93 0.85
94 0.86
95 0.85
96 0.85
97 0.87
98 0.86
99 0.84
100 0.83
101 0.84
102 0.85
103 0.86
104 0.85
105 0.84
106 0.86
107 0.87
108 0.85
109 0.84
110 0.84
111 0.85
112 0.85
113 0.82
114 0.75
115 0.72
116 0.74
117 0.74
118 0.72
119 0.71
120 0.67
121 0.64
122 0.68
123 0.66
124 0.58
125 0.5
126 0.48
127 0.47
128 0.45
129 0.41
130 0.33
131 0.28
132 0.27
133 0.25
134 0.2
135 0.13
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.11
148 0.12
149 0.15
150 0.17
151 0.18
152 0.17
153 0.19
154 0.18
155 0.18
156 0.17
157 0.15
158 0.16
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.16
165 0.15
166 0.12
167 0.13
168 0.15
169 0.23
170 0.29
171 0.3
172 0.3
173 0.32
174 0.31
175 0.31
176 0.29
177 0.22
178 0.17
179 0.17
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.14
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.21
192 0.22
193 0.25
194 0.28
195 0.25
196 0.23
197 0.24
198 0.29
199 0.26
200 0.3
201 0.3
202 0.27
203 0.31
204 0.36
205 0.42
206 0.42
207 0.45
208 0.46
209 0.5
210 0.54
211 0.56
212 0.59
213 0.62
214 0.68
215 0.74
216 0.78
217 0.78
218 0.78
219 0.74
220 0.7
221 0.61
222 0.51
223 0.48
224 0.44
225 0.41
226 0.44
227 0.45
228 0.42
229 0.48
230 0.51
231 0.47
232 0.46
233 0.48
234 0.47
235 0.52
236 0.55
237 0.52
238 0.53
239 0.52
240 0.45
241 0.39
242 0.32
243 0.24
244 0.2
245 0.17
246 0.14
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.15
254 0.21
255 0.22
256 0.24
257 0.26
258 0.28
259 0.32
260 0.38
261 0.41
262 0.42
263 0.45
264 0.49
265 0.49
266 0.46
267 0.47
268 0.42
269 0.42
270 0.36
271 0.36
272 0.32
273 0.35
274 0.37
275 0.32
276 0.31
277 0.3
278 0.37
279 0.36
280 0.41
281 0.39
282 0.4
283 0.44
284 0.42
285 0.44
286 0.39
287 0.37
288 0.37
289 0.37
290 0.34
291 0.36
292 0.36
293 0.33
294 0.35
295 0.39
296 0.37
297 0.41
298 0.44
299 0.41
300 0.43
301 0.44