Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0VCF1

Protein Details
Accession A0A0L0VCF1    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-60QSPPSSQPQPQQQQQQHPHSLHydrophilic
521-542FYSNRLKWRNIRKTLRLREEKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
344-358KRGEAEKAAKERERG
453-456RKKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR002483  PWI_dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034268  RBM25_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51025  PWI  
PS50102  RRM  
CDD cd12446  RRM_RBM25  
Amino Acid Sequences MYANNAYPAYHPPPNGQQQPPPAQQLTPGHPTGFGLPPNQSPPSSQPQPQQQQQQHPHSLQPGIPPPFQHLPPPPGFPHLHPPPHLAPPAMMPQHQFPHQPPPGSYFPPPNRHAGLGSHPQPHNIHSAISPPLNLPSAPNLNQTLPASSPNLPSRPAPTEIYSLFVGSIAEGVDDAWLERLLGCAGHLVSLRRIRDPNGKPKPFGFAEYGDPESVLRCLKVVHGSNLPIDGGRAGEKTLMIKPDDKTKARLDAYEANRIKTDQDNELDTQAIERLEGLISQMKDPDIVAATAIDPNSSTNNSNNNSKKNSAAHLQDLAPEDLPEESRGTITREIQFFRERAISKRGEAEKAAKERERGHRDSGAGSSAGPRGYNNQNGKAGYGSSNSTPMGPRGTPNGSGSTGGNHDPQSSNRPMGFVRAGQMAAAKQGTGSSATDGIVPLTDEEEEKSREERKKRMNHLEFKDRERRWETRERNRAQTNQREQQREKSLREEESRIRSQLSKRLENWDDQIEINRGKELFYSNRLKWRNIRKTLRLREEKSDRIDQELEEEELEQIRKESEDFLNKQAEMIAKIQEENRKAGLLQIDEGGKPLQLSFGGFASTTHQSNGTQQVSAINGNGSHNGVLTISMKKESNKGVGLLGNAEEDEDGFKKKRALIPLTYDDEPQDAATKINIRFGKGLLSSNTTVLSEEAKKIKIKEIVNSVPNDKDGLWKVEIKWEHLTDTIIDEKLKGFANKKIIDYLGIQEEELVVAIIDHIKAKKNAQGLVDELEPVLAEEAEEFVVKFWRMLVFEIRVNEAGLSSSSSSTIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.58
3 0.56
4 0.57
5 0.61
6 0.69
7 0.68
8 0.66
9 0.58
10 0.5
11 0.52
12 0.52
13 0.49
14 0.46
15 0.43
16 0.36
17 0.35
18 0.36
19 0.33
20 0.31
21 0.27
22 0.24
23 0.25
24 0.28
25 0.33
26 0.35
27 0.31
28 0.31
29 0.35
30 0.41
31 0.44
32 0.46
33 0.48
34 0.56
35 0.65
36 0.68
37 0.73
38 0.71
39 0.76
40 0.8
41 0.81
42 0.79
43 0.72
44 0.69
45 0.63
46 0.58
47 0.5
48 0.47
49 0.47
50 0.44
51 0.43
52 0.4
53 0.42
54 0.44
55 0.43
56 0.43
57 0.41
58 0.44
59 0.46
60 0.5
61 0.45
62 0.46
63 0.47
64 0.43
65 0.46
66 0.48
67 0.5
68 0.47
69 0.52
70 0.5
71 0.54
72 0.53
73 0.43
74 0.35
75 0.33
76 0.39
77 0.35
78 0.32
79 0.28
80 0.31
81 0.35
82 0.37
83 0.37
84 0.32
85 0.4
86 0.43
87 0.45
88 0.41
89 0.42
90 0.44
91 0.45
92 0.46
93 0.46
94 0.49
95 0.54
96 0.56
97 0.55
98 0.52
99 0.49
100 0.47
101 0.4
102 0.39
103 0.39
104 0.42
105 0.44
106 0.42
107 0.45
108 0.44
109 0.43
110 0.42
111 0.33
112 0.29
113 0.21
114 0.25
115 0.24
116 0.24
117 0.22
118 0.18
119 0.19
120 0.19
121 0.19
122 0.16
123 0.19
124 0.24
125 0.25
126 0.28
127 0.28
128 0.27
129 0.31
130 0.3
131 0.26
132 0.21
133 0.22
134 0.22
135 0.21
136 0.27
137 0.28
138 0.29
139 0.29
140 0.3
141 0.33
142 0.33
143 0.35
144 0.32
145 0.3
146 0.32
147 0.31
148 0.32
149 0.27
150 0.23
151 0.19
152 0.16
153 0.13
154 0.08
155 0.08
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.17
177 0.23
178 0.24
179 0.27
180 0.29
181 0.32
182 0.41
183 0.47
184 0.52
185 0.58
186 0.6
187 0.58
188 0.57
189 0.6
190 0.5
191 0.46
192 0.38
193 0.29
194 0.3
195 0.31
196 0.32
197 0.25
198 0.23
199 0.2
200 0.17
201 0.17
202 0.13
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.17
208 0.19
209 0.21
210 0.24
211 0.25
212 0.26
213 0.26
214 0.24
215 0.17
216 0.14
217 0.11
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.11
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.19
229 0.2
230 0.29
231 0.36
232 0.36
233 0.37
234 0.38
235 0.44
236 0.42
237 0.42
238 0.37
239 0.39
240 0.4
241 0.46
242 0.44
243 0.37
244 0.36
245 0.36
246 0.33
247 0.29
248 0.28
249 0.22
250 0.23
251 0.25
252 0.25
253 0.26
254 0.24
255 0.19
256 0.16
257 0.13
258 0.11
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.12
287 0.19
288 0.22
289 0.3
290 0.34
291 0.38
292 0.41
293 0.41
294 0.42
295 0.38
296 0.39
297 0.35
298 0.33
299 0.3
300 0.29
301 0.27
302 0.26
303 0.26
304 0.23
305 0.18
306 0.15
307 0.13
308 0.11
309 0.11
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.13
317 0.16
318 0.19
319 0.2
320 0.21
321 0.24
322 0.26
323 0.23
324 0.23
325 0.25
326 0.23
327 0.24
328 0.29
329 0.28
330 0.26
331 0.33
332 0.33
333 0.3
334 0.3
335 0.32
336 0.32
337 0.35
338 0.38
339 0.32
340 0.33
341 0.38
342 0.46
343 0.48
344 0.45
345 0.45
346 0.44
347 0.43
348 0.41
349 0.35
350 0.26
351 0.19
352 0.16
353 0.13
354 0.11
355 0.11
356 0.09
357 0.09
358 0.12
359 0.16
360 0.23
361 0.24
362 0.27
363 0.29
364 0.29
365 0.29
366 0.25
367 0.22
368 0.16
369 0.14
370 0.12
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.14
381 0.15
382 0.16
383 0.17
384 0.18
385 0.16
386 0.17
387 0.16
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.18
400 0.19
401 0.17
402 0.19
403 0.19
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.12
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.08
433 0.09
434 0.1
435 0.12
436 0.19
437 0.25
438 0.3
439 0.38
440 0.45
441 0.54
442 0.62
443 0.71
444 0.73
445 0.76
446 0.77
447 0.79
448 0.73
449 0.7
450 0.71
451 0.6
452 0.58
453 0.55
454 0.52
455 0.49
456 0.56
457 0.58
458 0.59
459 0.69
460 0.66
461 0.69
462 0.7
463 0.72
464 0.7
465 0.71
466 0.69
467 0.67
468 0.69
469 0.69
470 0.66
471 0.66
472 0.67
473 0.64
474 0.57
475 0.56
476 0.54
477 0.51
478 0.52
479 0.49
480 0.44
481 0.45
482 0.45
483 0.39
484 0.36
485 0.36
486 0.36
487 0.38
488 0.39
489 0.37
490 0.37
491 0.44
492 0.44
493 0.42
494 0.41
495 0.36
496 0.31
497 0.25
498 0.26
499 0.21
500 0.21
501 0.19
502 0.17
503 0.15
504 0.14
505 0.15
506 0.16
507 0.16
508 0.22
509 0.28
510 0.29
511 0.38
512 0.41
513 0.43
514 0.48
515 0.56
516 0.59
517 0.63
518 0.69
519 0.69
520 0.77
521 0.84
522 0.86
523 0.84
524 0.77
525 0.77
526 0.76
527 0.72
528 0.67
529 0.64
530 0.54
531 0.49
532 0.46
533 0.37
534 0.33
535 0.28
536 0.23
537 0.16
538 0.16
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.11
548 0.14
549 0.22
550 0.25
551 0.28
552 0.31
553 0.31
554 0.3
555 0.29
556 0.25
557 0.19
558 0.18
559 0.17
560 0.14
561 0.16
562 0.2
563 0.23
564 0.24
565 0.24
566 0.24
567 0.21
568 0.21
569 0.22
570 0.22
571 0.17
572 0.16
573 0.16
574 0.16
575 0.16
576 0.17
577 0.14
578 0.11
579 0.1
580 0.09
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.11
590 0.13
591 0.13
592 0.13
593 0.14
594 0.14
595 0.18
596 0.26
597 0.23
598 0.2
599 0.2
600 0.21
601 0.21
602 0.21
603 0.18
604 0.11
605 0.11
606 0.12
607 0.13
608 0.11
609 0.1
610 0.09
611 0.09
612 0.08
613 0.08
614 0.1
615 0.11
616 0.12
617 0.14
618 0.16
619 0.17
620 0.22
621 0.25
622 0.27
623 0.26
624 0.26
625 0.26
626 0.26
627 0.25
628 0.22
629 0.18
630 0.14
631 0.12
632 0.11
633 0.08
634 0.07
635 0.09
636 0.09
637 0.12
638 0.13
639 0.15
640 0.18
641 0.24
642 0.29
643 0.35
644 0.39
645 0.41
646 0.48
647 0.52
648 0.54
649 0.51
650 0.46
651 0.39
652 0.33
653 0.28
654 0.21
655 0.17
656 0.12
657 0.11
658 0.13
659 0.19
660 0.19
661 0.26
662 0.27
663 0.26
664 0.27
665 0.27
666 0.3
667 0.26
668 0.29
669 0.24
670 0.28
671 0.27
672 0.26
673 0.26
674 0.21
675 0.2
676 0.16
677 0.18
678 0.16
679 0.2
680 0.23
681 0.26
682 0.29
683 0.31
684 0.37
685 0.4
686 0.4
687 0.42
688 0.47
689 0.51
690 0.52
691 0.54
692 0.5
693 0.45
694 0.43
695 0.37
696 0.28
697 0.28
698 0.26
699 0.27
700 0.27
701 0.29
702 0.3
703 0.37
704 0.38
705 0.36
706 0.39
707 0.35
708 0.34
709 0.31
710 0.32
711 0.24
712 0.26
713 0.25
714 0.2
715 0.19
716 0.17
717 0.17
718 0.19
719 0.22
720 0.23
721 0.23
722 0.28
723 0.37
724 0.4
725 0.41
726 0.42
727 0.39
728 0.36
729 0.35
730 0.33
731 0.29
732 0.26
733 0.24
734 0.2
735 0.19
736 0.17
737 0.15
738 0.1
739 0.04
740 0.04
741 0.05
742 0.06
743 0.06
744 0.1
745 0.12
746 0.18
747 0.22
748 0.25
749 0.3
750 0.33
751 0.37
752 0.36
753 0.37
754 0.34
755 0.34
756 0.32
757 0.27
758 0.22
759 0.18
760 0.15
761 0.12
762 0.1
763 0.06
764 0.06
765 0.05
766 0.07
767 0.07
768 0.08
769 0.07
770 0.07
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.12
775 0.16
776 0.17
777 0.2
778 0.25
779 0.25
780 0.29
781 0.31
782 0.32
783 0.29
784 0.29
785 0.26
786 0.2
787 0.17
788 0.14
789 0.15
790 0.13
791 0.13