FuNGI

A0A0L0VQC9

Protein Details

Accession

A0A0L0VQC9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MANRPFKPSKSQLKQQARILEN	Hydrophilic
167-192	SLTMVKYKPPTNKRVRKKAAGPPQSI	Hydrophilic
433-463	IIGTNIPKSTKKKKRKRRRSHDGHNNNKIKI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
178-188	NKRVRKKAAGP
440-453	KSTKKKKRKRRRSH

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022042 snRNA-activating_su3
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF12251 SNAPC3
CDD	cd19757 Bbox1

Amino Acid Sequences

MANRPFKPSKSQLKQQARILENQIFKPSKPIKLSSFIKEIKEIQGRKQPEGTATESLEQYQHLKRAATLNDLIGPLEPIYKDSNLLSELRDHHHELATPHGSLHALHLSSEQNEQNEQPNNSKRVRLTQPEDIPVEITTHNIPDYLDPSLFDSFSPSTTDPTTTSTSLTMVKYKPPTNKRVRKKAAGPPQSINHKPKPIQDLINRLSSTGLQMLQSHFDAMLYVRSIGRSDWNTSTQPMHSNLSIPIRSSSSSNEEPILLTVTFHPFSKTNNHNHNTTNSQESLLNTDSKSVSPRKQTIHILSNQRLSDLRDVVSCSANQIPICSNTQNHDSRDEEEEEEGEDLHWSDHRWVSGSAFVIENVLFSDTSSSDSGNDSENLSQKSDYAVLLQELLPGLIEKEKVNNLVTLYSDDDSDDQSETGEEEEDDDEITEIIGTNIPKSTKKKKRKRRRSHDGHNNNKIKISSLSMENVRFDQLTLRINEPYWMLHQGNCEHIFTVDEIRAIHPTDPPLTSIPTANLSTPAPTTTTTENKAPRQEESQSRQTVYPITSFLSRINSPKCRVCDRDPARLIIINDELCAESPCFICFTCFKFLHSHEDIFLDHHLHQSSTTTVVDEISNSDSAPTLGNSSGRKIRWGKVKGREWWVVPLLGST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.83
3	0.83
4	0.75
5	0.71
6	0.68
7	0.65
8	0.59
9	0.54
10	0.56
11	0.49
12	0.46
13	0.5
14	0.49
15	0.5
16	0.5
17	0.54
18	0.5
19	0.57
20	0.63
21	0.59
22	0.62
23	0.58
24	0.55
25	0.54
26	0.51
27	0.5
28	0.54
29	0.51
30	0.49
31	0.53
32	0.55
33	0.55
34	0.56
35	0.5
36	0.45
37	0.47
38	0.44
39	0.39
40	0.37
41	0.36
42	0.32
43	0.31
44	0.27
45	0.23
46	0.24
47	0.23
48	0.26
49	0.25
50	0.25
51	0.27
52	0.33
53	0.35
54	0.35
55	0.33
56	0.3
57	0.3
58	0.3
59	0.27
60	0.2
61	0.19
62	0.14
63	0.14
64	0.13
65	0.12
66	0.15
67	0.15
68	0.16
69	0.16
70	0.18
71	0.17
72	0.18
73	0.17
74	0.19
75	0.22
76	0.25
77	0.29
78	0.3
79	0.3
80	0.31
81	0.33
82	0.28
83	0.33
84	0.31
85	0.27
86	0.24
87	0.22
88	0.21
89	0.18
90	0.2
91	0.17
92	0.14
93	0.14
94	0.17
95	0.18
96	0.19
97	0.23
98	0.23
99	0.2
100	0.21
101	0.23
102	0.27
103	0.32
104	0.33
105	0.36
106	0.42
107	0.46
108	0.47
109	0.5
110	0.46
111	0.49
112	0.54
113	0.55
114	0.54
115	0.57
116	0.59
117	0.59
118	0.58
119	0.5
120	0.42
121	0.34
122	0.29
123	0.2
124	0.17
125	0.13
126	0.12
127	0.12
128	0.11
129	0.11
130	0.11
131	0.13
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.14
136	0.15
137	0.15
138	0.13
139	0.15
140	0.14
141	0.14
142	0.18
143	0.15
144	0.17
145	0.18
146	0.2
147	0.17
148	0.2
149	0.23
150	0.2
151	0.2
152	0.18
153	0.18
154	0.2
155	0.2
156	0.22
157	0.19
158	0.25
159	0.3
160	0.35
161	0.44
162	0.48
163	0.57
164	0.63
165	0.72
166	0.76
167	0.82
168	0.84
169	0.83
170	0.84
171	0.84
172	0.84
173	0.83
174	0.77
175	0.7
176	0.69
177	0.69
178	0.67
179	0.65
180	0.6
181	0.58
182	0.56
183	0.57
184	0.58
185	0.54
186	0.54
187	0.52
188	0.55
189	0.5
190	0.54
191	0.48
192	0.41
193	0.37
194	0.29
195	0.25
196	0.18
197	0.16
198	0.1
199	0.12
200	0.12
201	0.14
202	0.13
203	0.12
204	0.1
205	0.09
206	0.09
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.14
216	0.14
217	0.18
218	0.2
219	0.23
220	0.24
221	0.25
222	0.27
223	0.23
224	0.24
225	0.23
226	0.22
227	0.19
228	0.19
229	0.2
230	0.23
231	0.22
232	0.2
233	0.18
234	0.17
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.19
239	0.2
240	0.2
241	0.2
242	0.18
243	0.18
244	0.17
245	0.17
246	0.1
247	0.09
248	0.09
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.13
253	0.12
254	0.14
255	0.22
256	0.27
257	0.32
258	0.41
259	0.43
260	0.44
261	0.46
262	0.48
263	0.43
264	0.38
265	0.33
266	0.24
267	0.23
268	0.22
269	0.2
270	0.2
271	0.18
272	0.17
273	0.14
274	0.15
275	0.15
276	0.14
277	0.18
278	0.19
279	0.22
280	0.27
281	0.31
282	0.32
283	0.36
284	0.41
285	0.42
286	0.43
287	0.45
288	0.46
289	0.44
290	0.46
291	0.41
292	0.37
293	0.32
294	0.28
295	0.25
296	0.2
297	0.17
298	0.13
299	0.14
300	0.15
301	0.15
302	0.12
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.11
307	0.11
308	0.11
309	0.12
310	0.14
311	0.13
312	0.13
313	0.14
314	0.2
315	0.23
316	0.23
317	0.24
318	0.23
319	0.24
320	0.27
321	0.27
322	0.21
323	0.18
324	0.17
325	0.14
326	0.13
327	0.1
328	0.07
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.1
338	0.1
339	0.11
340	0.12
341	0.13
342	0.11
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.05
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.09
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.09
363	0.11
364	0.15
365	0.15
366	0.15
367	0.14
368	0.13
369	0.14
370	0.14
371	0.12
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.07
379	0.07
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.07
385	0.06
386	0.09
387	0.1
388	0.13
389	0.13
390	0.14
391	0.13
392	0.13
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.11
397	0.11
398	0.1
399	0.1
400	0.1
401	0.11
402	0.09
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.05
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.06
422	0.06
423	0.07
424	0.09
425	0.11
426	0.16
427	0.23
428	0.34
429	0.43
430	0.54
431	0.64
432	0.74
433	0.84
434	0.9
435	0.95
436	0.95
437	0.96
438	0.96
439	0.96
440	0.96
441	0.96
442	0.95
443	0.94
444	0.89
445	0.78
446	0.7
447	0.59
448	0.49
449	0.4
450	0.33
451	0.25
452	0.21
453	0.24
454	0.24
455	0.25
456	0.24
457	0.23
458	0.21
459	0.18
460	0.16
461	0.15
462	0.15
463	0.18
464	0.19
465	0.21
466	0.21
467	0.21
468	0.22
469	0.2
470	0.18
471	0.16
472	0.19
473	0.18
474	0.18
475	0.22
476	0.22
477	0.28
478	0.28
479	0.26
480	0.21
481	0.2
482	0.19
483	0.17
484	0.18
485	0.13
486	0.12
487	0.13
488	0.13
489	0.15
490	0.15
491	0.15
492	0.14
493	0.16
494	0.18
495	0.18
496	0.19
497	0.18
498	0.2
499	0.2
500	0.19
501	0.18
502	0.19
503	0.19
504	0.17
505	0.18
506	0.16
507	0.16
508	0.16
509	0.15
510	0.13
511	0.13
512	0.16
513	0.19
514	0.24
515	0.26
516	0.32
517	0.38
518	0.42
519	0.48
520	0.47
521	0.45
522	0.45
523	0.49
524	0.52
525	0.53
526	0.56
527	0.53
528	0.53
529	0.51
530	0.47
531	0.43
532	0.36
533	0.3
534	0.22
535	0.21
536	0.2
537	0.2
538	0.21
539	0.23
540	0.23
541	0.28
542	0.35
543	0.41
544	0.44
545	0.5
546	0.54
547	0.57
548	0.61
549	0.6
550	0.63
551	0.62
552	0.67
553	0.63
554	0.61
555	0.56
556	0.53
557	0.47
558	0.4
559	0.38
560	0.28
561	0.25
562	0.22
563	0.2
564	0.16
565	0.17
566	0.14
567	0.11
568	0.12
569	0.12
570	0.13
571	0.12
572	0.15
573	0.16
574	0.2
575	0.26
576	0.26
577	0.28
578	0.34
579	0.37
580	0.43
581	0.44
582	0.42
583	0.34
584	0.36
585	0.34
586	0.29
587	0.28
588	0.22
589	0.18
590	0.2
591	0.2
592	0.19
593	0.19
594	0.19
595	0.19
596	0.18
597	0.18
598	0.15
599	0.14
600	0.15
601	0.15
602	0.13
603	0.14
604	0.14
605	0.14
606	0.12
607	0.13
608	0.12
609	0.12
610	0.13
611	0.11
612	0.11
613	0.13
614	0.17
615	0.19
616	0.25
617	0.31
618	0.3
619	0.38
620	0.41
621	0.47
622	0.53
623	0.6
624	0.63
625	0.67
626	0.75
627	0.75
628	0.78
629	0.77
630	0.69
631	0.68
632	0.62
633	0.53

A0A0L0VQC9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer