Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HER0

Protein Details
Accession C6HER0    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-70VKKSAQSDGPPRKRGRPRKNPSDPPKPVPAGPKRGRGRPRKDDPTAPSBasic
91-112SSKPAPTPSKRGRPKKSATEAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-73PRKRGRPPKLDATGNPVKKSAQSDGPPRKRGRPRKNPSDPPKPVPAGPKRGRGRPRKDDPTAPSKKP
98-106PSKRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MADAPLPRKRGRPPKLDATGNPVKKSAQSDGPPRKRGRPRKNPSDPPKPVPAGPKRGRGRPRKDDPTAPSKKPRLSTDAAATTTTTTSSSSSKPAPTPSKRGRPKKSATEAAAKAVNGAGDTGFLLDKIIGIYSLDCKEVEDNWPDDAEEMELTITRTSESPLGLIGGFNLGVIQGTMLFAADKRTLDKFRAVMSKRGHVAGGARGGNVEGETGSSDAGDDIPHAAGPAHVKDLRVYFSWRGRSTGEGEIHTEEGTSPQDGYLVFTSDEAITFNGVAGFPALGENCKFKGTKIDDDAADAPEPWTSFSRQAAEEAAVSRWG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.79
3 0.8
4 0.71
5 0.69
6 0.7
7 0.66
8 0.6
9 0.51
10 0.44
11 0.41
12 0.44
13 0.4
14 0.39
15 0.4
16 0.49
17 0.59
18 0.67
19 0.72
20 0.72
21 0.76
22 0.79
23 0.83
24 0.84
25 0.84
26 0.85
27 0.87
28 0.94
29 0.94
30 0.93
31 0.93
32 0.89
33 0.84
34 0.82
35 0.74
36 0.67
37 0.66
38 0.65
39 0.65
40 0.63
41 0.68
42 0.65
43 0.71
44 0.77
45 0.77
46 0.79
47 0.78
48 0.83
49 0.82
50 0.82
51 0.81
52 0.78
53 0.78
54 0.76
55 0.71
56 0.71
57 0.68
58 0.68
59 0.65
60 0.63
61 0.59
62 0.56
63 0.54
64 0.51
65 0.48
66 0.44
67 0.38
68 0.34
69 0.28
70 0.24
71 0.2
72 0.13
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.15
78 0.18
79 0.21
80 0.23
81 0.3
82 0.38
83 0.41
84 0.49
85 0.55
86 0.63
87 0.7
88 0.78
89 0.79
90 0.79
91 0.81
92 0.82
93 0.81
94 0.78
95 0.71
96 0.7
97 0.62
98 0.55
99 0.49
100 0.38
101 0.3
102 0.23
103 0.19
104 0.1
105 0.09
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.02
164 0.02
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.13
173 0.15
174 0.17
175 0.2
176 0.19
177 0.21
178 0.3
179 0.3
180 0.34
181 0.35
182 0.38
183 0.37
184 0.36
185 0.32
186 0.24
187 0.24
188 0.19
189 0.21
190 0.17
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.12
196 0.09
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.09
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.17
220 0.18
221 0.2
222 0.2
223 0.23
224 0.24
225 0.29
226 0.37
227 0.36
228 0.36
229 0.35
230 0.36
231 0.36
232 0.37
233 0.34
234 0.27
235 0.28
236 0.27
237 0.27
238 0.24
239 0.2
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.1
271 0.13
272 0.14
273 0.18
274 0.18
275 0.17
276 0.27
277 0.31
278 0.39
279 0.42
280 0.46
281 0.42
282 0.47
283 0.48
284 0.4
285 0.35
286 0.26
287 0.21
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.16
292 0.17
293 0.2
294 0.24
295 0.28
296 0.27
297 0.29
298 0.28
299 0.27
300 0.26
301 0.23