Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HDT1

Protein Details
Accession C6HDT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-200HVVARRRKEERERERERDRERRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-202RRRKEERERERERDRERRRVE
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.666, mito_nucl 9.999, cyto 7.5, cyto_mito 5.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Amino Acid Sequences MAAADVHRLNLRPGFESGIIVARDEQERRSILVLDDSSGACLEVQYQYHHQQQHQQQQHGQHHTIPTHPPNFPPPKSRSISLRCSQASVQSSKAPISYFRGMFQLCLERYEMLHNMTAEVHFWDERTRFRLQVLCVPWVVTQEEVEKLRGEAEGLTAASAARIGGVGGCDVDLNADGHVVARRRKEERERERERDRERRRVEREERDCLRIEKRHLAEGTPSTYESSTVVPTAASLFVNTLTNFCSHQHSRSHHHLHWLPVEDIAEVFSNGTFLDPGVLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.24
4 0.22
5 0.24
6 0.22
7 0.2
8 0.19
9 0.17
10 0.21
11 0.22
12 0.22
13 0.22
14 0.23
15 0.24
16 0.24
17 0.23
18 0.2
19 0.25
20 0.23
21 0.2
22 0.2
23 0.19
24 0.17
25 0.16
26 0.15
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.13
33 0.18
34 0.23
35 0.3
36 0.34
37 0.34
38 0.41
39 0.49
40 0.56
41 0.59
42 0.58
43 0.56
44 0.62
45 0.69
46 0.66
47 0.59
48 0.52
49 0.48
50 0.45
51 0.44
52 0.41
53 0.39
54 0.38
55 0.37
56 0.36
57 0.41
58 0.48
59 0.48
60 0.49
61 0.47
62 0.51
63 0.53
64 0.54
65 0.53
66 0.52
67 0.57
68 0.53
69 0.56
70 0.48
71 0.47
72 0.44
73 0.42
74 0.39
75 0.33
76 0.31
77 0.26
78 0.26
79 0.24
80 0.25
81 0.19
82 0.16
83 0.2
84 0.23
85 0.21
86 0.21
87 0.23
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.22
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.15
96 0.16
97 0.18
98 0.17
99 0.12
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.1
111 0.11
112 0.13
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.18
117 0.22
118 0.2
119 0.25
120 0.26
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.2
125 0.18
126 0.17
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.08
166 0.11
167 0.14
168 0.18
169 0.23
170 0.26
171 0.34
172 0.44
173 0.52
174 0.6
175 0.67
176 0.72
177 0.76
178 0.81
179 0.82
180 0.81
181 0.81
182 0.78
183 0.78
184 0.77
185 0.79
186 0.78
187 0.79
188 0.8
189 0.8
190 0.78
191 0.77
192 0.73
193 0.66
194 0.61
195 0.55
196 0.53
197 0.48
198 0.47
199 0.46
200 0.45
201 0.48
202 0.46
203 0.43
204 0.41
205 0.39
206 0.37
207 0.29
208 0.28
209 0.22
210 0.22
211 0.21
212 0.17
213 0.15
214 0.13
215 0.11
216 0.11
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.21
233 0.22
234 0.27
235 0.34
236 0.39
237 0.45
238 0.54
239 0.61
240 0.56
241 0.63
242 0.63
243 0.61
244 0.61
245 0.58
246 0.49
247 0.42
248 0.4
249 0.3
250 0.26
251 0.21
252 0.15
253 0.11
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.06