Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D9P1W4

Protein Details
Accession A0A0D9P1W4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
326-349AVELHSRNWRWHKKHQIWLTKDEHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
Amino Acid Sequences MTEFPSLSNNSQLNNANPASMWSSGASRNLSGPIQRNQSTPVSSQQGGQDDLFASGSSRLPLHQTSFRFGNQGNMATASQGQPSSVDDFPPLNRAGNGEIGSDRSGNLMSLAFGSQQGASGAQRGNGLLNALSANSRANDVRSPPGVALNRGQDPKRLGADDDSRQKPISREDGLGKSTVDDTNQNPLGAIGNEDSIAKLRDVKENKAPDAVDPLGGMSAVDKWGIKGLRTLMNNYPDYQAMVVGMDPITIGLDINSQEMISTQVYSLFDDAPPRPTVNGSKFRLPECYNVTNVQPIESKIQNFNEETLFWIFYSCPADVKQQMAAVELHSRNWRWHKKHQIWLTKDEHMTPQILSPNHERGFYIVWDTDNWRKDRRELTLFYGDLDTTLNQPPAIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.34
3 0.28
4 0.26
5 0.27
6 0.25
7 0.22
8 0.2
9 0.15
10 0.17
11 0.19
12 0.24
13 0.23
14 0.21
15 0.22
16 0.24
17 0.25
18 0.28
19 0.32
20 0.35
21 0.41
22 0.42
23 0.42
24 0.43
25 0.46
26 0.43
27 0.39
28 0.39
29 0.37
30 0.35
31 0.36
32 0.36
33 0.35
34 0.34
35 0.31
36 0.26
37 0.21
38 0.21
39 0.18
40 0.14
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.15
48 0.17
49 0.21
50 0.26
51 0.28
52 0.32
53 0.35
54 0.35
55 0.35
56 0.32
57 0.35
58 0.31
59 0.31
60 0.27
61 0.25
62 0.24
63 0.21
64 0.23
65 0.16
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.1
70 0.12
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.16
76 0.17
77 0.2
78 0.19
79 0.16
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.19
84 0.19
85 0.16
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.08
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.18
129 0.18
130 0.19
131 0.17
132 0.23
133 0.22
134 0.22
135 0.23
136 0.23
137 0.26
138 0.29
139 0.29
140 0.27
141 0.28
142 0.29
143 0.28
144 0.25
145 0.22
146 0.23
147 0.27
148 0.3
149 0.36
150 0.34
151 0.34
152 0.34
153 0.34
154 0.32
155 0.31
156 0.31
157 0.24
158 0.25
159 0.28
160 0.3
161 0.3
162 0.29
163 0.24
164 0.18
165 0.18
166 0.15
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.12
177 0.12
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.09
187 0.1
188 0.17
189 0.2
190 0.23
191 0.3
192 0.32
193 0.33
194 0.32
195 0.31
196 0.24
197 0.26
198 0.23
199 0.16
200 0.13
201 0.12
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.14
216 0.19
217 0.2
218 0.23
219 0.24
220 0.29
221 0.3
222 0.29
223 0.27
224 0.22
225 0.22
226 0.18
227 0.14
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.17
261 0.17
262 0.16
263 0.19
264 0.25
265 0.29
266 0.38
267 0.38
268 0.43
269 0.45
270 0.46
271 0.5
272 0.45
273 0.43
274 0.41
275 0.41
276 0.36
277 0.35
278 0.35
279 0.33
280 0.31
281 0.27
282 0.22
283 0.2
284 0.23
285 0.24
286 0.26
287 0.26
288 0.29
289 0.3
290 0.29
291 0.29
292 0.25
293 0.23
294 0.23
295 0.2
296 0.18
297 0.14
298 0.14
299 0.12
300 0.14
301 0.17
302 0.14
303 0.13
304 0.14
305 0.2
306 0.21
307 0.23
308 0.22
309 0.22
310 0.22
311 0.22
312 0.21
313 0.17
314 0.23
315 0.21
316 0.23
317 0.25
318 0.27
319 0.33
320 0.43
321 0.52
322 0.51
323 0.61
324 0.7
325 0.74
326 0.83
327 0.85
328 0.85
329 0.8
330 0.81
331 0.76
332 0.72
333 0.64
334 0.57
335 0.51
336 0.43
337 0.39
338 0.31
339 0.29
340 0.28
341 0.28
342 0.29
343 0.31
344 0.38
345 0.37
346 0.38
347 0.34
348 0.3
349 0.32
350 0.29
351 0.28
352 0.21
353 0.2
354 0.22
355 0.28
356 0.33
357 0.36
358 0.39
359 0.42
360 0.44
361 0.5
362 0.55
363 0.58
364 0.59
365 0.56
366 0.6
367 0.61
368 0.57
369 0.52
370 0.46
371 0.37
372 0.29
373 0.27
374 0.2
375 0.15
376 0.19
377 0.18