Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D9NSB3

Protein Details
Accession A0A0D9NSB3    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-34ASPGPATPKHEKKIKKEKKRAREEEVAVVEBasic
54-109DDIHGQDVNKDKKKKKEKKNKHRHDAGEVADEAHKHKAEKKKKKHHKEETETLTHABasic
116-142GDDELKPEKKDKKKKKKHAEVADEAVEBasic
406-428RTAQMRRYKKGGRGIERRRAPDFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-28PKHEKKIKKEKKRAREE
36-41ERKHKR
63-100KDKKKKKEKKNKHRHDAGEVADEAHKHKAEKKKKKHHK
121-133KPEKKDKKKKKKH
410-424MRRYKKGGRGIERRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 10.333, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSTAASPGPATPKHEKKIKKEKKRAREEEVAVVEGERKHKRSKSITADAIAQSDDIHGQDVNKDKKKKKEKKNKHRHDAGEVADEAHKHKAEKKKKKHHKEETETLTHAEVKAELGDDELKPEKKDKKKKKKHAEVADEAVETVISKKPKPSTQLTELEDTDAMDIDKPLASVYQPPDIPANPQFPFFEQTVSLYEPLYPNGWAQPITSCQYQHLQHLQNKYVPSLRGVLLNYKNVALGPSPGRDGAAMDDETPTTVVSQNEYAVGFGWITADVELFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCYGKFNASVEARRLPPAWKWVSNESPEAHGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWVDGNGDRVKGRVRFRIRNFDAGTSGETSYLSLEGTMLDKDSEKKLVKEEARTAQMRRYKKGGRGIERRRAPDFSMTRFVDVEVDKDGQQAEAETGGETTKES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.66
3 0.71
4 0.8
5 0.84
6 0.85
7 0.87
8 0.9
9 0.92
10 0.95
11 0.93
12 0.9
13 0.89
14 0.82
15 0.8
16 0.73
17 0.63
18 0.52
19 0.43
20 0.38
21 0.31
22 0.34
23 0.32
24 0.33
25 0.4
26 0.45
27 0.54
28 0.59
29 0.66
30 0.68
31 0.71
32 0.72
33 0.66
34 0.66
35 0.58
36 0.5
37 0.4
38 0.3
39 0.21
40 0.16
41 0.15
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.14
47 0.23
48 0.32
49 0.39
50 0.49
51 0.55
52 0.65
53 0.76
54 0.82
55 0.84
56 0.86
57 0.89
58 0.92
59 0.96
60 0.96
61 0.96
62 0.95
63 0.89
64 0.86
65 0.81
66 0.73
67 0.66
68 0.55
69 0.46
70 0.38
71 0.33
72 0.27
73 0.24
74 0.23
75 0.19
76 0.26
77 0.35
78 0.44
79 0.55
80 0.64
81 0.71
82 0.81
83 0.9
84 0.95
85 0.95
86 0.95
87 0.94
88 0.93
89 0.89
90 0.83
91 0.73
92 0.63
93 0.53
94 0.43
95 0.34
96 0.24
97 0.16
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.1
104 0.09
105 0.13
106 0.17
107 0.18
108 0.19
109 0.27
110 0.35
111 0.43
112 0.54
113 0.62
114 0.69
115 0.79
116 0.89
117 0.93
118 0.95
119 0.95
120 0.94
121 0.92
122 0.87
123 0.8
124 0.71
125 0.6
126 0.48
127 0.38
128 0.27
129 0.17
130 0.13
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.17
135 0.23
136 0.27
137 0.33
138 0.39
139 0.43
140 0.48
141 0.54
142 0.52
143 0.51
144 0.46
145 0.42
146 0.34
147 0.27
148 0.2
149 0.13
150 0.1
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.1
160 0.12
161 0.16
162 0.15
163 0.16
164 0.18
165 0.18
166 0.21
167 0.21
168 0.23
169 0.2
170 0.21
171 0.21
172 0.2
173 0.23
174 0.2
175 0.17
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.09
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.14
195 0.15
196 0.14
197 0.15
198 0.19
199 0.2
200 0.23
201 0.27
202 0.3
203 0.33
204 0.37
205 0.38
206 0.36
207 0.35
208 0.33
209 0.29
210 0.23
211 0.2
212 0.18
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.21
217 0.2
218 0.21
219 0.2
220 0.18
221 0.17
222 0.14
223 0.15
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.05
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.13
294 0.14
295 0.17
296 0.19
297 0.24
298 0.24
299 0.26
300 0.27
301 0.24
302 0.24
303 0.31
304 0.33
305 0.32
306 0.35
307 0.39
308 0.43
309 0.44
310 0.45
311 0.37
312 0.35
313 0.32
314 0.3
315 0.24
316 0.19
317 0.16
318 0.12
319 0.12
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.1
343 0.11
344 0.14
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.15
349 0.16
350 0.22
351 0.27
352 0.3
353 0.36
354 0.44
355 0.53
356 0.6
357 0.7
358 0.68
359 0.71
360 0.68
361 0.6
362 0.53
363 0.45
364 0.4
365 0.31
366 0.27
367 0.18
368 0.16
369 0.14
370 0.12
371 0.11
372 0.09
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.13
382 0.16
383 0.23
384 0.25
385 0.26
386 0.3
387 0.39
388 0.43
389 0.47
390 0.52
391 0.51
392 0.56
393 0.58
394 0.56
395 0.54
396 0.57
397 0.56
398 0.54
399 0.55
400 0.55
401 0.59
402 0.67
403 0.69
404 0.71
405 0.76
406 0.81
407 0.83
408 0.83
409 0.81
410 0.76
411 0.7
412 0.63
413 0.62
414 0.58
415 0.54
416 0.55
417 0.51
418 0.48
419 0.44
420 0.41
421 0.37
422 0.31
423 0.26
424 0.21
425 0.22
426 0.2
427 0.21
428 0.21
429 0.16
430 0.15
431 0.15
432 0.12
433 0.11
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.1