FuNGI

A0A0D9P7M2

Protein Details

Accession

A0A0D9P7M2

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-40	DQNGAHRNQKPNPLRPMRKRPRPANPLVAPSRK	Hydrophilic
183-208	APVAKDNNPKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-44	KPNPLRPMRKRPRPANPLVAPSRKIPSK
190-208	NPKRPKKQKEEKTMFNRAP
494-514	GKQKPGELAKKTKSLKRAGSP
525-531	SRKKMKK
672-676	LRRRR

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAGQPSMDQNGAHRNQKPNPLRPMRKRPRPANPLVAPSRKIPSKPSVKANSGTLQQTSLNGSKPNNDDQRKQYGGWSEPPPQHQYSDIPIMTTKKSLLEGLRYHLMKFSQARVSDSPIDPTDQDEFARPVTLHRRDARQPPPGRATKVEEPEPPQVGEQEAERLAQAKAEREAQRAIDLAKIAPVAKDNNPKRPKKQKEEKTMFNRAPKSEAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSEANVAFMIDKSVFRMVPLEKWYRFGAKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWIMKDEEKKAGQSDLEATRKLLYGRGQMIKTESDTFKAASRSEKLDHDELDVSGDEFQDDDETPYFERMEDDDTKESKDRIRREQLGANLFGEGDEQGVDKELQEQLREELERQKYGKSTKKALIKRDREDIYESDDSEENPWSSSSDEGSSGDDEQEEGEEENKDDDKKDADKETQGDGKDRTKGTGSKGSMTPQGKQKPGELAKKTKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKSSMIGNGSRAGTPASQPNVARRSKAGHGSGSDAEATTAEMSDSAVAPRKGVKMVGSSGRGTPVASRASSPNPATGDMSPTTQTSGIEPWEILDKIPADGIAITDLIKQFHGRVGDRPGQMPRGDWIKLVKRLCDYGSDRRLRRRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.54
3	0.64
4	0.71
5	0.7
6	0.75
7	0.79
8	0.83
9	0.85
10	0.9
11	0.91
12	0.92
13	0.94
14	0.93
15	0.93
16	0.92
17	0.9
18	0.89
19	0.84
20	0.82
21	0.81
22	0.77
23	0.68
24	0.62
25	0.62
26	0.57
27	0.53
28	0.5
29	0.51
30	0.55
31	0.6
32	0.66
33	0.66
34	0.66
35	0.67
36	0.66
37	0.61
38	0.55
39	0.51
40	0.42
41	0.36
42	0.31
43	0.29
44	0.29
45	0.27
46	0.25
47	0.26
48	0.27
49	0.31
50	0.35
51	0.43
52	0.48
53	0.51
54	0.55
55	0.57
56	0.65
57	0.62
58	0.58
59	0.54
60	0.51
61	0.49
62	0.49
63	0.48
64	0.47
65	0.48
66	0.53
67	0.54
68	0.48
69	0.46
70	0.41
71	0.39
72	0.36
73	0.39
74	0.34
75	0.29
76	0.3
77	0.32
78	0.31
79	0.29
80	0.25
81	0.19
82	0.2
83	0.23
84	0.23
85	0.27
86	0.28
87	0.31
88	0.38
89	0.37
90	0.35
91	0.35
92	0.32
93	0.31
94	0.32
95	0.32
96	0.31
97	0.32
98	0.37
99	0.35
100	0.4
101	0.4
102	0.38
103	0.37
104	0.31
105	0.32
106	0.27
107	0.28
108	0.25
109	0.2
110	0.2
111	0.18
112	0.19
113	0.17
114	0.19
115	0.16
116	0.19
117	0.28
118	0.33
119	0.38
120	0.42
121	0.48
122	0.53
123	0.62
124	0.64
125	0.65
126	0.64
127	0.64
128	0.68
129	0.68
130	0.65
131	0.6
132	0.59
133	0.57
134	0.57
135	0.54
136	0.5
137	0.49
138	0.5
139	0.48
140	0.41
141	0.34
142	0.29
143	0.25
144	0.22
145	0.17
146	0.15
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.13
151	0.11
152	0.13
153	0.14
154	0.14
155	0.16
156	0.24
157	0.26
158	0.27
159	0.3
160	0.28
161	0.27
162	0.26
163	0.24
164	0.18
165	0.16
166	0.13
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.14
173	0.19
174	0.3
175	0.33
176	0.43
177	0.52
178	0.59
179	0.67
180	0.74
181	0.79
182	0.8
183	0.86
184	0.86
185	0.88
186	0.89
187	0.89
188	0.86
189	0.86
190	0.8
191	0.77
192	0.71
193	0.61
194	0.56
195	0.49
196	0.47
197	0.45
198	0.46
199	0.44
200	0.41
201	0.42
202	0.47
203	0.47
204	0.44
205	0.39
206	0.35
207	0.32
208	0.31
209	0.31
210	0.24
211	0.23
212	0.2
213	0.18
214	0.16
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.14
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.05
243	0.06
244	0.07
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.13
249	0.12
250	0.16
251	0.21
252	0.26
253	0.24
254	0.27
255	0.28
256	0.3
257	0.29
258	0.32
259	0.36
260	0.37
261	0.44
262	0.46
263	0.47
264	0.43
265	0.46
266	0.41
267	0.38
268	0.34
269	0.27
270	0.22
271	0.21
272	0.21
273	0.18
274	0.18
275	0.13
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.1
280	0.11
281	0.14
282	0.16
283	0.2
284	0.21
285	0.22
286	0.22
287	0.25
288	0.28
289	0.27
290	0.29
291	0.24
292	0.24
293	0.24
294	0.24
295	0.2
296	0.17
297	0.19
298	0.18
299	0.19
300	0.19
301	0.18
302	0.18
303	0.19
304	0.18
305	0.16
306	0.13
307	0.15
308	0.2
309	0.24
310	0.23
311	0.23
312	0.24
313	0.22
314	0.22
315	0.21
316	0.17
317	0.14
318	0.15
319	0.15
320	0.15
321	0.16
322	0.16
323	0.15
324	0.17
325	0.18
326	0.2
327	0.21
328	0.22
329	0.22
330	0.22
331	0.21
332	0.19
333	0.16
334	0.15
335	0.13
336	0.1
337	0.08
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.08
352	0.07
353	0.12
354	0.13
355	0.16
356	0.18
357	0.19
358	0.21
359	0.21
360	0.22
361	0.22
362	0.26
363	0.29
364	0.35
365	0.42
366	0.45
367	0.47
368	0.51
369	0.51
370	0.48
371	0.44
372	0.35
373	0.27
374	0.22
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.07
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.14
392	0.15
393	0.14
394	0.2
395	0.22
396	0.25
397	0.25
398	0.26
399	0.27
400	0.35
401	0.42
402	0.39
403	0.42
404	0.45
405	0.53
406	0.57
407	0.63
408	0.66
409	0.67
410	0.66
411	0.67
412	0.63
413	0.56
414	0.54
415	0.45
416	0.41
417	0.34
418	0.3
419	0.24
420	0.23
421	0.21
422	0.19
423	0.19
424	0.12
425	0.11
426	0.11
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.09
432	0.1
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.09
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.11
449	0.11
450	0.11
451	0.12
452	0.15
453	0.17
454	0.21
455	0.23
456	0.25
457	0.28
458	0.29
459	0.32
460	0.33
461	0.31
462	0.31
463	0.3
464	0.31
465	0.33
466	0.32
467	0.29
468	0.29
469	0.31
470	0.33
471	0.38
472	0.36
473	0.34
474	0.35
475	0.36
476	0.4
477	0.39
478	0.38
479	0.38
480	0.44
481	0.43
482	0.43
483	0.43
484	0.45
485	0.51
486	0.56
487	0.54
488	0.56
489	0.57
490	0.64
491	0.67
492	0.62
493	0.62
494	0.6
495	0.61
496	0.59
497	0.62
498	0.58
499	0.57
500	0.53
501	0.48
502	0.43
503	0.36
504	0.29
505	0.22
506	0.23
507	0.22
508	0.21
509	0.23
510	0.22
511	0.27
512	0.36
513	0.41
514	0.39
515	0.45
516	0.54
517	0.6
518	0.65
519	0.69
520	0.7
521	0.73
522	0.71
523	0.66
524	0.6
525	0.51
526	0.44
527	0.35
528	0.26
529	0.19
530	0.19
531	0.21
532	0.21
533	0.23
534	0.24
535	0.32
536	0.38
537	0.39
538	0.39
539	0.35
540	0.37
541	0.39
542	0.45
543	0.41
544	0.37
545	0.36
546	0.39
547	0.38
548	0.33
549	0.28
550	0.21
551	0.17
552	0.13
553	0.13
554	0.08
555	0.07
556	0.06
557	0.05
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.08
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.19
566	0.21
567	0.22
568	0.23
569	0.23
570	0.21
571	0.26
572	0.32
573	0.31
574	0.31
575	0.3
576	0.31
577	0.29
578	0.25
579	0.22
580	0.21
581	0.21
582	0.21
583	0.22
584	0.24
585	0.28
586	0.34
587	0.33
588	0.33
589	0.31
590	0.32
591	0.33
592	0.3
593	0.3
594	0.25
595	0.25
596	0.22
597	0.21
598	0.21
599	0.19
600	0.18
601	0.16
602	0.17
603	0.17
604	0.16
605	0.16
606	0.15
607	0.19
608	0.19
609	0.17
610	0.18
611	0.17
612	0.16
613	0.17
614	0.16
615	0.11
616	0.11
617	0.11
618	0.09
619	0.08
620	0.08
621	0.11
622	0.13
623	0.13
624	0.14
625	0.15
626	0.15
627	0.18
628	0.24
629	0.22
630	0.27
631	0.34
632	0.41
633	0.42
634	0.46
635	0.47
636	0.46
637	0.45
638	0.41
639	0.39
640	0.36
641	0.35
642	0.33
643	0.37
644	0.4
645	0.48
646	0.5
647	0.49
648	0.48
649	0.51
650	0.5
651	0.5
652	0.47
653	0.5
654	0.57
655	0.61
656	0.63

A0A0D9P7M2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer