Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H6D1

Protein Details
Accession C6H6D1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-78YFCRLLNHYLPKKKVKKLKNLLSADEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 6.5, cyto_mito 6.333, plas 6, cyto_nucl 5.833, nucl 5.5, cyto 5, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008429  CLPTM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05602  CLPTM1  
Amino Acid Sequences MLSQRTQKEIVTSFKVPKEVQQNGTLWAHFYMSLSGHPLNPNDKGYSSANAVYFCRLLNHYLPKKKVKKLKNLLSADEAEEDEVLPQGTQIGSFYHPNFTLSVIPDTGIVTLPSMAPAARQYLQLETTGARDATGQNGWYYPLLFVNTFWQLKSHMIELNSTVETLPLHITLKNMQNWKFTLLANIDESTKQNQRQAASGGPFPAGGDGSEFETFKEILLDTNSYLLATTFFVSILHMIFEGLAFKNDISHWRQKKDSVGTSLRTILANVFMQTIIFLYLLDNSEGTSWMILGGQAFGIVLEAWKITKTVDVRLRRPQPGSAFSFLPYVVVFEDKHKLSETEQKTKEYDEIAFRYLYMLAVPLLAAYAVYSLMYEDHKSWYSFVIETLVGSVYAYGFLMMVPSLYINYRLKSVAHMPGKALTYKFLNTFIDDLFAFTIKMPTLHRIATLRDDVIFFIWLYQSYKYKVDYTRVNEFGQGGEAEENEETKAEEQPKSLKDSEPVTALEPETSTLGTKTKTESVRKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.53
3 0.47
4 0.48
5 0.52
6 0.52
7 0.51
8 0.51
9 0.49
10 0.48
11 0.5
12 0.43
13 0.35
14 0.28
15 0.25
16 0.19
17 0.18
18 0.15
19 0.13
20 0.14
21 0.17
22 0.17
23 0.19
24 0.22
25 0.25
26 0.28
27 0.3
28 0.32
29 0.3
30 0.3
31 0.31
32 0.3
33 0.3
34 0.28
35 0.28
36 0.27
37 0.27
38 0.27
39 0.25
40 0.24
41 0.21
42 0.21
43 0.19
44 0.21
45 0.26
46 0.36
47 0.43
48 0.5
49 0.58
50 0.65
51 0.72
52 0.77
53 0.8
54 0.8
55 0.81
56 0.84
57 0.87
58 0.86
59 0.82
60 0.77
61 0.72
62 0.64
63 0.54
64 0.45
65 0.35
66 0.25
67 0.2
68 0.16
69 0.11
70 0.1
71 0.08
72 0.06
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.1
80 0.14
81 0.16
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.2
90 0.16
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.11
96 0.09
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.12
106 0.12
107 0.14
108 0.15
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.13
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.13
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.19
140 0.2
141 0.19
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.18
146 0.19
147 0.17
148 0.16
149 0.13
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.15
159 0.21
160 0.25
161 0.3
162 0.31
163 0.33
164 0.34
165 0.35
166 0.32
167 0.26
168 0.26
169 0.21
170 0.2
171 0.18
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.17
176 0.18
177 0.21
178 0.22
179 0.24
180 0.26
181 0.26
182 0.28
183 0.28
184 0.28
185 0.25
186 0.24
187 0.21
188 0.18
189 0.17
190 0.14
191 0.13
192 0.08
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.11
236 0.15
237 0.24
238 0.28
239 0.31
240 0.33
241 0.35
242 0.4
243 0.42
244 0.41
245 0.38
246 0.37
247 0.36
248 0.35
249 0.34
250 0.29
251 0.23
252 0.19
253 0.13
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.08
295 0.09
296 0.16
297 0.24
298 0.3
299 0.35
300 0.44
301 0.5
302 0.51
303 0.52
304 0.49
305 0.46
306 0.45
307 0.45
308 0.38
309 0.33
310 0.29
311 0.28
312 0.23
313 0.19
314 0.13
315 0.1
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.15
321 0.14
322 0.15
323 0.16
324 0.16
325 0.18
326 0.27
327 0.31
328 0.37
329 0.39
330 0.4
331 0.4
332 0.41
333 0.4
334 0.32
335 0.28
336 0.23
337 0.23
338 0.22
339 0.21
340 0.2
341 0.19
342 0.17
343 0.14
344 0.09
345 0.07
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.05
360 0.06
361 0.08
362 0.08
363 0.12
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.12
373 0.11
374 0.11
375 0.1
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.11
393 0.13
394 0.14
395 0.15
396 0.16
397 0.17
398 0.2
399 0.25
400 0.29
401 0.31
402 0.31
403 0.31
404 0.34
405 0.35
406 0.35
407 0.3
408 0.23
409 0.22
410 0.23
411 0.24
412 0.23
413 0.23
414 0.21
415 0.22
416 0.2
417 0.19
418 0.16
419 0.15
420 0.13
421 0.12
422 0.11
423 0.09
424 0.11
425 0.09
426 0.12
427 0.13
428 0.16
429 0.19
430 0.19
431 0.22
432 0.23
433 0.25
434 0.29
435 0.3
436 0.27
437 0.25
438 0.25
439 0.22
440 0.21
441 0.19
442 0.13
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.16
448 0.18
449 0.21
450 0.24
451 0.26
452 0.31
453 0.34
454 0.39
455 0.44
456 0.47
457 0.53
458 0.53
459 0.52
460 0.47
461 0.43
462 0.37
463 0.3
464 0.24
465 0.16
466 0.14
467 0.13
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.17
476 0.2
477 0.21
478 0.24
479 0.31
480 0.34
481 0.4
482 0.42
483 0.38
484 0.38
485 0.4
486 0.4
487 0.35
488 0.33
489 0.29
490 0.29
491 0.27
492 0.23
493 0.2
494 0.18
495 0.17
496 0.16
497 0.14
498 0.13
499 0.16
500 0.17
501 0.18
502 0.22
503 0.28
504 0.36
505 0.46