Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BPN6

Protein Details
Accession Q6BPN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-70LGTDKKWSKERINKRVKSLKVKIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-63KERINKRVK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 12.5, cyto 12, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG dha:DEHA2E12144g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02867  PseudoU_synth_TruB_4  
Amino Acid Sequences MNGVFAIEKPSGITSSKFIGDIQALFTQSEIFKNDLNEAKTKAAQALGTDKKWSKERINKRVKSLKVKIGHGGTLDPMASGVLVVGVGLGTKKLQYYLSECNKTYETKALLGISTTTGDAEGEIITKNQVSHITQEMIKETAPKFIGDLKQTPPIFSALKMNGKPLYDYAREGIPLPMPIKVRQVKVFDVKVHDEDSLRTDHEFQTLKSELDEQGNPKEHELSNNPTLNDSPLYFSEQYLSKAETEGLPKEVGKPRSLADDSLPEKLPLIHLTADVSSGTYIRSLVSDYGRALESSAYMVELIRVRQSEWQLGKNVFKISDFENRDERIWGPVLKKVLDSDHDIDVSKELNDFSEKIAPLLEREQEVIEKFGDANKQDKEAHVADTTSIANTNTTERDAEIPKKRTIDEIEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.22
4 0.21
5 0.19
6 0.2
7 0.21
8 0.2
9 0.21
10 0.2
11 0.2
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.19
17 0.18
18 0.17
19 0.18
20 0.2
21 0.26
22 0.29
23 0.31
24 0.32
25 0.32
26 0.35
27 0.35
28 0.34
29 0.3
30 0.27
31 0.24
32 0.23
33 0.29
34 0.31
35 0.31
36 0.36
37 0.37
38 0.4
39 0.46
40 0.5
41 0.51
42 0.55
43 0.65
44 0.69
45 0.77
46 0.78
47 0.83
48 0.85
49 0.83
50 0.84
51 0.81
52 0.79
53 0.74
54 0.72
55 0.68
56 0.62
57 0.55
58 0.45
59 0.38
60 0.3
61 0.24
62 0.2
63 0.13
64 0.1
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.02
73 0.02
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.07
81 0.09
82 0.11
83 0.17
84 0.26
85 0.35
86 0.4
87 0.4
88 0.42
89 0.43
90 0.42
91 0.39
92 0.35
93 0.28
94 0.24
95 0.25
96 0.23
97 0.21
98 0.19
99 0.18
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.07
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.1
117 0.11
118 0.13
119 0.16
120 0.18
121 0.18
122 0.19
123 0.2
124 0.18
125 0.17
126 0.19
127 0.17
128 0.19
129 0.18
130 0.17
131 0.17
132 0.21
133 0.25
134 0.23
135 0.26
136 0.24
137 0.32
138 0.32
139 0.31
140 0.27
141 0.26
142 0.23
143 0.2
144 0.23
145 0.19
146 0.26
147 0.26
148 0.27
149 0.27
150 0.26
151 0.26
152 0.23
153 0.24
154 0.19
155 0.2
156 0.18
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.16
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.14
165 0.15
166 0.16
167 0.23
168 0.26
169 0.28
170 0.3
171 0.33
172 0.33
173 0.37
174 0.38
175 0.32
176 0.32
177 0.31
178 0.28
179 0.26
180 0.23
181 0.18
182 0.16
183 0.16
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.15
190 0.16
191 0.14
192 0.18
193 0.19
194 0.18
195 0.17
196 0.18
197 0.15
198 0.17
199 0.18
200 0.14
201 0.18
202 0.22
203 0.22
204 0.21
205 0.22
206 0.2
207 0.22
208 0.24
209 0.25
210 0.27
211 0.29
212 0.29
213 0.27
214 0.27
215 0.24
216 0.22
217 0.17
218 0.12
219 0.1
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.17
226 0.16
227 0.17
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.19
238 0.25
239 0.25
240 0.24
241 0.24
242 0.23
243 0.29
244 0.3
245 0.24
246 0.19
247 0.25
248 0.26
249 0.28
250 0.28
251 0.21
252 0.21
253 0.2
254 0.2
255 0.13
256 0.13
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.09
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.18
294 0.2
295 0.26
296 0.28
297 0.31
298 0.34
299 0.36
300 0.39
301 0.37
302 0.37
303 0.29
304 0.26
305 0.24
306 0.24
307 0.3
308 0.31
309 0.31
310 0.35
311 0.36
312 0.36
313 0.36
314 0.33
315 0.27
316 0.27
317 0.27
318 0.23
319 0.25
320 0.28
321 0.26
322 0.27
323 0.25
324 0.25
325 0.24
326 0.28
327 0.27
328 0.26
329 0.27
330 0.26
331 0.25
332 0.22
333 0.2
334 0.15
335 0.13
336 0.1
337 0.11
338 0.13
339 0.14
340 0.15
341 0.21
342 0.2
343 0.2
344 0.22
345 0.2
346 0.21
347 0.24
348 0.24
349 0.19
350 0.2
351 0.21
352 0.22
353 0.23
354 0.22
355 0.18
356 0.16
357 0.15
358 0.18
359 0.22
360 0.21
361 0.26
362 0.26
363 0.3
364 0.31
365 0.32
366 0.35
367 0.31
368 0.33
369 0.28
370 0.27
371 0.22
372 0.23
373 0.22
374 0.17
375 0.16
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.16
380 0.16
381 0.17
382 0.18
383 0.18
384 0.23
385 0.29
386 0.37
387 0.43
388 0.46
389 0.5
390 0.53
391 0.53
392 0.54