Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BNU7

Protein Details
Accession Q6BNU7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-119DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-406RKRHEGEKRREENDKRRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG dha:DEHA2E18898g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRKYPKIISPVVEDDVTQEIGAAQFSDPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPEHKLPPETEDEMFLDVFKYTDRVLLMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQDAKIAHEEKERQIRERESRGESIDDAIKGKKSWDSNAITPGTPFMDSLAQALRYWVAYKLATDPGWANLQVIISDATVPGEGEHKLMSFIRSQRSDPEYDPNTKHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFRVLREDVFANQSRQMRISDQLSMTQDQKDSIAEQDAKKPFLWLHVNVLREYLEIELYNPHLSFPFDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDVRDNGIDILVNCWKRMLPKLRDYITCDGNLNLESVEKLLSSLSYKEDEIFRKRHEGEKRREENDKRRKLAQEEEKALKNQYIPQVSKGSDKAPLTADINMPLLSTSGDAVEGYAQLSNKDIVENRDVITKANMSNADAAAALKKLLDSKNNKESDKNVSASAAIQEQQNKSDINTTENSKKRPIDQVEAELPKPDENGDSVRMWEPGYRQRYYQSKFGVVSEEEINKIRRDMVRCYLEGISWVLLYYYQGCPSWQWYYPYHYAPFAADFVNINDIIGEQGIKFTLGEPFKPYEQLMSVLPAASGHNLPEVLRILMSDPSSEILDFYPEEFQIDMNGKKMSWQGIALLPFIDENRLLEALEKRYHLLTDDERERNTLKNEVLFISNQNKNYKRFYNELYDNNVKELKFRFSRSSLAGTVIKNEYFVPDGITKFPLSEGDMPDLNNIEFFQSSYKMPTKKMGKSMLINGYISHTRTLTQEDRDSILHGNQRNGGYNRFRTPNDNSGYVNKGPSGKEDYLIYSMRRGGYRAFMHNLKNQNQQHQQPVPMNAMANNSYDNQYNSYSNNNNYNNNYNGGYPNQSNNNYSNQNSYNNYSNQNSYNNYNNQNSYNNYNNRNNHGNYNNYNRYNNQGSNYDRQGQGNASSNRSGYIPAPNRTGNFRNRNGYNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.66
4 0.66
5 0.61
6 0.58
7 0.56
8 0.53
9 0.44
10 0.38
11 0.32
12 0.29
13 0.25
14 0.18
15 0.13
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.1
20 0.07
21 0.11
22 0.12
23 0.21
24 0.21
25 0.23
26 0.24
27 0.24
28 0.24
29 0.21
30 0.23
31 0.16
32 0.17
33 0.16
34 0.14
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.12
45 0.17
46 0.21
47 0.25
48 0.3
49 0.39
50 0.45
51 0.53
52 0.52
53 0.51
54 0.53
55 0.52
56 0.47
57 0.4
58 0.34
59 0.27
60 0.25
61 0.22
62 0.16
63 0.12
64 0.12
65 0.09
66 0.1
67 0.08
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.14
72 0.2
73 0.29
74 0.36
75 0.38
76 0.38
77 0.38
78 0.38
79 0.38
80 0.35
81 0.27
82 0.25
83 0.23
84 0.21
85 0.22
86 0.2
87 0.2
88 0.18
89 0.15
90 0.1
91 0.13
92 0.19
93 0.26
94 0.37
95 0.46
96 0.55
97 0.66
98 0.74
99 0.8
100 0.82
101 0.79
102 0.76
103 0.77
104 0.76
105 0.72
106 0.73
107 0.65
108 0.59
109 0.64
110 0.58
111 0.49
112 0.47
113 0.44
114 0.42
115 0.51
116 0.51
117 0.47
118 0.52
119 0.58
120 0.6
121 0.64
122 0.63
123 0.58
124 0.59
125 0.56
126 0.52
127 0.44
128 0.39
129 0.34
130 0.29
131 0.25
132 0.24
133 0.23
134 0.21
135 0.22
136 0.24
137 0.24
138 0.27
139 0.34
140 0.37
141 0.38
142 0.45
143 0.45
144 0.4
145 0.36
146 0.34
147 0.26
148 0.21
149 0.17
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.15
158 0.14
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.13
165 0.16
166 0.2
167 0.19
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.21
172 0.2
173 0.17
174 0.14
175 0.14
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.16
195 0.21
196 0.28
197 0.3
198 0.31
199 0.36
200 0.4
201 0.42
202 0.38
203 0.43
204 0.4
205 0.44
206 0.46
207 0.42
208 0.44
209 0.41
210 0.39
211 0.3
212 0.28
213 0.23
214 0.25
215 0.23
216 0.2
217 0.19
218 0.19
219 0.18
220 0.16
221 0.13
222 0.08
223 0.06
224 0.03
225 0.04
226 0.05
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.19
234 0.2
235 0.21
236 0.22
237 0.23
238 0.21
239 0.26
240 0.28
241 0.25
242 0.27
243 0.29
244 0.27
245 0.28
246 0.28
247 0.24
248 0.26
249 0.26
250 0.26
251 0.23
252 0.26
253 0.27
254 0.28
255 0.27
256 0.25
257 0.23
258 0.19
259 0.19
260 0.16
261 0.14
262 0.13
263 0.16
264 0.19
265 0.2
266 0.28
267 0.3
268 0.31
269 0.3
270 0.3
271 0.25
272 0.27
273 0.31
274 0.24
275 0.3
276 0.32
277 0.34
278 0.32
279 0.33
280 0.26
281 0.21
282 0.2
283 0.12
284 0.09
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.12
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.08
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.12
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.1
332 0.06
333 0.08
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.14
339 0.16
340 0.24
341 0.31
342 0.33
343 0.41
344 0.48
345 0.52
346 0.54
347 0.57
348 0.53
349 0.46
350 0.4
351 0.33
352 0.26
353 0.23
354 0.2
355 0.15
356 0.1
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.16
372 0.2
373 0.25
374 0.28
375 0.28
376 0.33
377 0.35
378 0.41
379 0.47
380 0.52
381 0.57
382 0.64
383 0.69
384 0.66
385 0.73
386 0.74
387 0.75
388 0.76
389 0.75
390 0.68
391 0.66
392 0.67
393 0.62
394 0.63
395 0.62
396 0.59
397 0.56
398 0.56
399 0.53
400 0.5
401 0.46
402 0.38
403 0.29
404 0.25
405 0.25
406 0.27
407 0.25
408 0.27
409 0.3
410 0.3
411 0.32
412 0.29
413 0.24
414 0.24
415 0.23
416 0.21
417 0.19
418 0.2
419 0.18
420 0.18
421 0.17
422 0.13
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.09
427 0.08
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.1
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.16
451 0.16
452 0.15
453 0.15
454 0.14
455 0.12
456 0.14
457 0.14
458 0.11
459 0.12
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.04
468 0.05
469 0.08
470 0.09
471 0.16
472 0.21
473 0.28
474 0.37
475 0.41
476 0.42
477 0.4
478 0.41
479 0.42
480 0.41
481 0.35
482 0.27
483 0.23
484 0.22
485 0.21
486 0.19
487 0.12
488 0.08
489 0.09
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.14
494 0.13
495 0.13
496 0.17
497 0.16
498 0.15
499 0.17
500 0.2
501 0.27
502 0.3
503 0.32
504 0.32
505 0.33
506 0.33
507 0.39
508 0.39
509 0.37
510 0.35
511 0.37
512 0.38
513 0.39
514 0.36
515 0.29
516 0.26
517 0.2
518 0.18
519 0.14
520 0.09
521 0.08
522 0.1
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.13
530 0.14
531 0.19
532 0.24
533 0.23
534 0.23
535 0.28
536 0.36
537 0.38
538 0.41
539 0.36
540 0.34
541 0.34
542 0.34
543 0.31
544 0.23
545 0.22
546 0.19
547 0.17
548 0.15
549 0.16
550 0.17
551 0.15
552 0.15
553 0.16
554 0.17
555 0.2
556 0.23
557 0.29
558 0.31
559 0.31
560 0.33
561 0.3
562 0.26
563 0.24
564 0.2
565 0.12
566 0.09
567 0.09
568 0.06
569 0.05
570 0.06
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.13
578 0.16
579 0.16
580 0.19
581 0.19
582 0.25
583 0.29
584 0.31
585 0.29
586 0.26
587 0.25
588 0.22
589 0.21
590 0.16
591 0.12
592 0.1
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.1
597 0.08
598 0.07
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.05
603 0.03
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.05
609 0.1
610 0.11
611 0.12
612 0.15
613 0.17
614 0.18
615 0.19
616 0.19
617 0.14
618 0.14
619 0.15
620 0.12
621 0.12
622 0.12
623 0.1
624 0.1
625 0.09
626 0.09
627 0.08
628 0.08
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.09
634 0.1
635 0.08
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.1
640 0.11
641 0.09
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.07
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.08
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.09
657 0.13
658 0.12
659 0.13
660 0.13
661 0.13
662 0.15
663 0.17
664 0.16
665 0.14
666 0.14
667 0.14
668 0.16
669 0.18
670 0.16
671 0.14
672 0.12
673 0.11
674 0.11
675 0.1
676 0.07
677 0.06
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.11
682 0.14
683 0.18
684 0.2
685 0.2
686 0.2
687 0.2
688 0.2
689 0.19
690 0.19
691 0.19
692 0.24
693 0.31
694 0.33
695 0.33
696 0.35
697 0.35
698 0.34
699 0.33
700 0.3
701 0.24
702 0.23
703 0.24
704 0.23
705 0.24
706 0.21
707 0.22
708 0.25
709 0.28
710 0.3
711 0.37
712 0.4
713 0.42
714 0.47
715 0.49
716 0.46
717 0.47
718 0.47
719 0.48
720 0.5
721 0.5
722 0.51
723 0.51
724 0.47
725 0.45
726 0.44
727 0.34
728 0.32
729 0.31
730 0.3
731 0.29
732 0.32
733 0.35
734 0.35
735 0.39
736 0.38
737 0.4
738 0.34
739 0.34
740 0.34
741 0.28
742 0.3
743 0.28
744 0.25
745 0.21
746 0.2
747 0.17
748 0.15
749 0.15
750 0.14
751 0.15
752 0.16
753 0.17
754 0.19
755 0.17
756 0.16
757 0.16
758 0.14
759 0.15
760 0.18
761 0.18
762 0.2
763 0.21
764 0.21
765 0.21
766 0.21
767 0.17
768 0.14
769 0.11
770 0.1
771 0.09
772 0.09
773 0.1
774 0.11
775 0.12
776 0.17
777 0.24
778 0.25
779 0.27
780 0.35
781 0.42
782 0.46
783 0.53
784 0.54
785 0.53
786 0.55
787 0.6
788 0.58
789 0.52
790 0.46
791 0.39
792 0.36
793 0.33
794 0.3
795 0.24
796 0.17
797 0.16
798 0.17
799 0.24
800 0.24
801 0.27
802 0.29
803 0.3
804 0.32
805 0.32
806 0.32
807 0.27
808 0.28
809 0.28
810 0.27
811 0.28
812 0.3
813 0.32
814 0.37
815 0.37
816 0.4
817 0.41
818 0.44
819 0.48
820 0.48
821 0.48
822 0.47
823 0.52
824 0.53
825 0.5
826 0.47
827 0.43
828 0.43
829 0.46
830 0.42
831 0.36
832 0.3
833 0.29
834 0.27
835 0.29
836 0.32
837 0.28
838 0.28
839 0.28
840 0.28
841 0.28
842 0.3
843 0.27
844 0.22
845 0.24
846 0.26
847 0.25
848 0.24
849 0.22
850 0.27
851 0.31
852 0.34
853 0.36
854 0.38
855 0.42
856 0.48
857 0.54
858 0.51
859 0.57
860 0.56
861 0.6
862 0.63
863 0.63
864 0.66
865 0.62
866 0.63
867 0.59
868 0.58
869 0.52
870 0.45
871 0.41
872 0.33
873 0.32
874 0.27
875 0.23
876 0.21
877 0.19
878 0.19
879 0.2
880 0.2
881 0.2
882 0.21
883 0.22
884 0.22
885 0.28
886 0.31
887 0.34
888 0.42
889 0.43
890 0.46
891 0.49
892 0.53
893 0.48
894 0.45
895 0.42
896 0.35
897 0.33
898 0.31
899 0.31
900 0.27
901 0.31
902 0.36
903 0.38
904 0.39
905 0.39
906 0.43
907 0.43
908 0.42
909 0.43
910 0.39
911 0.42
912 0.42
913 0.44
914 0.44
915 0.43
916 0.47
917 0.43
918 0.44
919 0.42
920 0.43
921 0.43
922 0.4
923 0.45
924 0.47
925 0.5
926 0.51
927 0.5
928 0.49
929 0.5
930 0.49
931 0.47
932 0.5
933 0.51
934 0.54
935 0.6
936 0.61
937 0.63
938 0.67
939 0.63
940 0.63
941 0.61
942 0.61
943 0.59
944 0.64
945 0.67
946 0.64
947 0.65
948 0.58
949 0.59
950 0.59
951 0.56
952 0.5
953 0.48
954 0.49
955 0.53
956 0.57
957 0.55
958 0.5
959 0.47
960 0.45
961 0.41
962 0.4
963 0.41
964 0.4
965 0.38
966 0.38
967 0.36
968 0.34
969 0.32
970 0.29
971 0.22
972 0.29
973 0.33
974 0.35
975 0.4
976 0.43
977 0.45
978 0.5
979 0.56
980 0.55
981 0.57
982 0.6
983 0.64