Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D9NIM3

Protein Details
Accession A0A0D9NIM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
963-990GPATWVKKPPAQPRRSLRLRRVPLPTVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
969-980KKPPAQPRRSLR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.833, nucl 8, cyto 7.5, cyto_mito 6.166, extr 4, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR041588  Integrase_H2C2  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR041373  RT_RNaseH  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF17921  Integrase_H2C2  
PF17917  RT_RNaseH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS50994  INTEGRASE  
CDD cd00024  CD_CSD  
cd09272  RNase_HI_RT_Ty1  
cd09274  RNase_HI_RT_Ty3  
Amino Acid Sequences MDLQTNLVRSNSGHFLVLATSNDDLVLDGWDYYRFPACWNNRLVHSGSLHLARPDLDQPCGPCLTLAEYVGMGEATKAALWGRRLLAELEGKGEQAVPLLLGDNKGAVQLTRGVSNTSKIKHIDIAFHHVVDEVKEGRIQVFWEHSQHVREVIDRLIEAGLQIDINKCEFETTKTKYLGLIIASDGIQMDPDKVATVTGWEKPANVRELQRFLGFANFYRRFIRDFSSICRPLNDLLRKESAWRWAEQQQHAFMQLKIAITTGPALAFFDYNRKTVLETDASDWASGGVLSQYDDDGSLRPVAYFSSKHSAAECNYEIYDKELLAIIKALEEWRPELQGNASEFEIMTDHKNLEYFTTTKVLNQRQVRWSEFLSQFNFRIIYRPGSKAVRPDALSRRSQDVPSKSDVEDDRLKQRRKTLLPRDRFDPSARADLLGDIDDTTPMAAAPVTTLTPDLERPIDDIIDQAYNNSDLAQTMLTALRDPNVKCWPKSVRRELRIAMQDCKVRGNRIYYRDRLFLPPTDEAKIQVIYRTHSSGPGGHPGRVKTLDLITRTYWWPRMSQDVEIFVKGCDLCVRTKTSRSAPPGFLQPLPVPFRAWSDISVDYITPLPDCKRFQSVYKHILVIVCRLTKTRHFVATRTLNVDELADAFVSRVYALHGAPDNIVSDRGPQFVSEFWRQLSRRLGISLKHSSAYHPETDGQTERMNSGVEQYLRAFMSFHQNDWVDWLPLAEFAPNNATSDTTGVSPLFANYGFHPRLGIEPADPCPPNLSMAQRRGFYKANTVVERFERILDQLRALAQQSINRYERNANESRTESPIYHVGQEGMISGRDLIRSLVCTHAHVASNSFLLPDRIRIFPVFHNSLLRPVSTDEDGNRIGLPGQSEINENESRNIRGRILERDDETEEVIEKWLFDSILDCRNKDGLQYLVKWKYHAPSWQPASDLKGQDDTLLEFHREHPDKPGPATWVKKPPAQPRRSLRLRRVPLPTVKGVSFAATQLVKQIGVHFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.2
4 0.22
5 0.18
6 0.16
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.13
11 0.11
12 0.09
13 0.1
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.1
18 0.1
19 0.12
20 0.16
21 0.15
22 0.17
23 0.27
24 0.32
25 0.39
26 0.43
27 0.45
28 0.44
29 0.48
30 0.48
31 0.43
32 0.39
33 0.34
34 0.34
35 0.32
36 0.31
37 0.28
38 0.26
39 0.22
40 0.23
41 0.27
42 0.26
43 0.25
44 0.26
45 0.28
46 0.31
47 0.31
48 0.27
49 0.21
50 0.2
51 0.21
52 0.2
53 0.19
54 0.16
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.13
59 0.08
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.11
67 0.13
68 0.17
69 0.19
70 0.2
71 0.21
72 0.22
73 0.25
74 0.26
75 0.25
76 0.25
77 0.23
78 0.22
79 0.21
80 0.2
81 0.15
82 0.11
83 0.1
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.09
96 0.14
97 0.15
98 0.17
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.27
103 0.32
104 0.28
105 0.32
106 0.31
107 0.33
108 0.37
109 0.37
110 0.38
111 0.35
112 0.42
113 0.39
114 0.37
115 0.34
116 0.29
117 0.28
118 0.22
119 0.22
120 0.15
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.19
129 0.21
130 0.23
131 0.26
132 0.28
133 0.3
134 0.29
135 0.29
136 0.25
137 0.24
138 0.22
139 0.21
140 0.19
141 0.17
142 0.17
143 0.14
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.12
156 0.13
157 0.17
158 0.24
159 0.29
160 0.35
161 0.36
162 0.37
163 0.35
164 0.36
165 0.33
166 0.26
167 0.21
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.13
172 0.11
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.07
183 0.1
184 0.12
185 0.15
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.22
190 0.27
191 0.27
192 0.28
193 0.31
194 0.33
195 0.37
196 0.38
197 0.36
198 0.31
199 0.28
200 0.3
201 0.25
202 0.22
203 0.28
204 0.28
205 0.29
206 0.32
207 0.32
208 0.3
209 0.31
210 0.33
211 0.29
212 0.29
213 0.33
214 0.4
215 0.43
216 0.41
217 0.4
218 0.37
219 0.34
220 0.41
221 0.43
222 0.36
223 0.36
224 0.39
225 0.38
226 0.4
227 0.4
228 0.39
229 0.34
230 0.33
231 0.33
232 0.36
233 0.43
234 0.45
235 0.46
236 0.41
237 0.39
238 0.41
239 0.38
240 0.31
241 0.27
242 0.23
243 0.19
244 0.16
245 0.15
246 0.12
247 0.1
248 0.11
249 0.09
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.14
257 0.16
258 0.16
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.19
263 0.23
264 0.19
265 0.19
266 0.21
267 0.23
268 0.23
269 0.22
270 0.2
271 0.15
272 0.12
273 0.1
274 0.08
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.15
293 0.2
294 0.2
295 0.21
296 0.22
297 0.25
298 0.23
299 0.28
300 0.25
301 0.2
302 0.2
303 0.2
304 0.19
305 0.18
306 0.18
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.11
320 0.11
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.17
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.13
342 0.12
343 0.13
344 0.15
345 0.15
346 0.17
347 0.25
348 0.28
349 0.32
350 0.36
351 0.4
352 0.44
353 0.48
354 0.48
355 0.43
356 0.4
357 0.41
358 0.39
359 0.37
360 0.34
361 0.32
362 0.3
363 0.29
364 0.28
365 0.2
366 0.21
367 0.18
368 0.21
369 0.22
370 0.24
371 0.27
372 0.29
373 0.31
374 0.32
375 0.34
376 0.33
377 0.31
378 0.35
379 0.39
380 0.4
381 0.42
382 0.39
383 0.4
384 0.38
385 0.39
386 0.39
387 0.36
388 0.35
389 0.35
390 0.35
391 0.3
392 0.33
393 0.31
394 0.29
395 0.29
396 0.28
397 0.35
398 0.41
399 0.44
400 0.42
401 0.49
402 0.52
403 0.54
404 0.62
405 0.64
406 0.65
407 0.71
408 0.71
409 0.68
410 0.62
411 0.57
412 0.49
413 0.42
414 0.34
415 0.31
416 0.28
417 0.25
418 0.22
419 0.19
420 0.18
421 0.14
422 0.11
423 0.06
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.02
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.05
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.11
469 0.12
470 0.15
471 0.24
472 0.26
473 0.26
474 0.32
475 0.38
476 0.43
477 0.52
478 0.58
479 0.58
480 0.59
481 0.63
482 0.59
483 0.57
484 0.56
485 0.5
486 0.42
487 0.37
488 0.35
489 0.31
490 0.35
491 0.29
492 0.23
493 0.23
494 0.27
495 0.29
496 0.34
497 0.39
498 0.39
499 0.41
500 0.42
501 0.41
502 0.38
503 0.34
504 0.29
505 0.27
506 0.27
507 0.25
508 0.25
509 0.23
510 0.21
511 0.2
512 0.19
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.13
517 0.15
518 0.16
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.15
523 0.16
524 0.22
525 0.22
526 0.22
527 0.24
528 0.24
529 0.26
530 0.25
531 0.24
532 0.17
533 0.18
534 0.19
535 0.18
536 0.2
537 0.17
538 0.18
539 0.2
540 0.2
541 0.21
542 0.19
543 0.19
544 0.18
545 0.24
546 0.24
547 0.26
548 0.25
549 0.25
550 0.25
551 0.24
552 0.23
553 0.16
554 0.15
555 0.12
556 0.11
557 0.08
558 0.09
559 0.1
560 0.13
561 0.18
562 0.19
563 0.23
564 0.27
565 0.31
566 0.36
567 0.41
568 0.44
569 0.41
570 0.4
571 0.42
572 0.4
573 0.34
574 0.3
575 0.24
576 0.25
577 0.26
578 0.25
579 0.2
580 0.18
581 0.21
582 0.21
583 0.2
584 0.16
585 0.16
586 0.16
587 0.16
588 0.16
589 0.13
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.07
594 0.09
595 0.1
596 0.14
597 0.16
598 0.17
599 0.22
600 0.23
601 0.29
602 0.37
603 0.42
604 0.44
605 0.44
606 0.43
607 0.38
608 0.38
609 0.34
610 0.27
611 0.23
612 0.18
613 0.16
614 0.17
615 0.19
616 0.22
617 0.27
618 0.27
619 0.31
620 0.31
621 0.32
622 0.39
623 0.43
624 0.41
625 0.39
626 0.36
627 0.29
628 0.27
629 0.26
630 0.18
631 0.11
632 0.1
633 0.06
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.04
640 0.05
641 0.06
642 0.06
643 0.09
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.11
648 0.11
649 0.1
650 0.11
651 0.08
652 0.11
653 0.12
654 0.13
655 0.13
656 0.12
657 0.12
658 0.14
659 0.19
660 0.19
661 0.19
662 0.19
663 0.26
664 0.27
665 0.31
666 0.35
667 0.31
668 0.29
669 0.31
670 0.33
671 0.28
672 0.34
673 0.35
674 0.3
675 0.3
676 0.29
677 0.27
678 0.31
679 0.31
680 0.26
681 0.21
682 0.22
683 0.22
684 0.25
685 0.25
686 0.21
687 0.2
688 0.19
689 0.17
690 0.16
691 0.15
692 0.12
693 0.13
694 0.15
695 0.13
696 0.14
697 0.14
698 0.16
699 0.16
700 0.16
701 0.14
702 0.11
703 0.21
704 0.2
705 0.2
706 0.23
707 0.23
708 0.23
709 0.27
710 0.27
711 0.17
712 0.17
713 0.16
714 0.11
715 0.12
716 0.12
717 0.09
718 0.07
719 0.07
720 0.11
721 0.11
722 0.12
723 0.11
724 0.12
725 0.11
726 0.12
727 0.12
728 0.09
729 0.1
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.08
734 0.09
735 0.08
736 0.09
737 0.09
738 0.17
739 0.17
740 0.17
741 0.17
742 0.17
743 0.19
744 0.2
745 0.19
746 0.13
747 0.15
748 0.17
749 0.23
750 0.22
751 0.21
752 0.21
753 0.2
754 0.21
755 0.21
756 0.26
757 0.29
758 0.36
759 0.4
760 0.4
761 0.41
762 0.43
763 0.44
764 0.38
765 0.39
766 0.39
767 0.41
768 0.42
769 0.42
770 0.41
771 0.39
772 0.41
773 0.33
774 0.27
775 0.21
776 0.2
777 0.26
778 0.24
779 0.22
780 0.2
781 0.2
782 0.21
783 0.21
784 0.22
785 0.16
786 0.19
787 0.22
788 0.28
789 0.29
790 0.29
791 0.31
792 0.33
793 0.35
794 0.39
795 0.4
796 0.36
797 0.38
798 0.41
799 0.41
800 0.4
801 0.38
802 0.31
803 0.29
804 0.32
805 0.28
806 0.27
807 0.25
808 0.21
809 0.19
810 0.18
811 0.16
812 0.11
813 0.1
814 0.08
815 0.08
816 0.09
817 0.09
818 0.09
819 0.1
820 0.1
821 0.11
822 0.13
823 0.18
824 0.17
825 0.19
826 0.2
827 0.23
828 0.24
829 0.23
830 0.23
831 0.19
832 0.19
833 0.17
834 0.16
835 0.13
836 0.14
837 0.14
838 0.18
839 0.2
840 0.2
841 0.22
842 0.23
843 0.26
844 0.28
845 0.35
846 0.33
847 0.32
848 0.36
849 0.34
850 0.38
851 0.37
852 0.32
853 0.25
854 0.23
855 0.25
856 0.22
857 0.24
858 0.2
859 0.23
860 0.24
861 0.23
862 0.21
863 0.17
864 0.16
865 0.15
866 0.15
867 0.12
868 0.13
869 0.13
870 0.15
871 0.16
872 0.21
873 0.23
874 0.22
875 0.25
876 0.27
877 0.29
878 0.32
879 0.34
880 0.3
881 0.32
882 0.36
883 0.39
884 0.43
885 0.45
886 0.43
887 0.45
888 0.45
889 0.41
890 0.38
891 0.3
892 0.24
893 0.19
894 0.19
895 0.14
896 0.12
897 0.11
898 0.12
899 0.11
900 0.09
901 0.11
902 0.13
903 0.22
904 0.24
905 0.24
906 0.25
907 0.29
908 0.29
909 0.28
910 0.28
911 0.26
912 0.29
913 0.33
914 0.4
915 0.45
916 0.46
917 0.46
918 0.46
919 0.45
920 0.45
921 0.48
922 0.45
923 0.47
924 0.53
925 0.53
926 0.51
927 0.48
928 0.49
929 0.48
930 0.44
931 0.37
932 0.34
933 0.32
934 0.31
935 0.3
936 0.26
937 0.22
938 0.22
939 0.21
940 0.18
941 0.22
942 0.31
943 0.32
944 0.31
945 0.37
946 0.43
947 0.45
948 0.48
949 0.49
950 0.44
951 0.5
952 0.55
953 0.55
954 0.56
955 0.56
956 0.59
957 0.64
958 0.69
959 0.72
960 0.73
961 0.75
962 0.74
963 0.81
964 0.85
965 0.86
966 0.85
967 0.85
968 0.87
969 0.85
970 0.83
971 0.81
972 0.79
973 0.76
974 0.72
975 0.66
976 0.58
977 0.52
978 0.44
979 0.39
980 0.31
981 0.24
982 0.23
983 0.19
984 0.19
985 0.2
986 0.21
987 0.18
988 0.18