Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HSM7

Protein Details
Accession C6HSM7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-214APKDAKSRPRVQKQRGPPEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-169GEGRKRGYGRGRGRGRGRGGRFGARGGRAAK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 9.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSTANELAENMASVSINDSTNGATPVGAIQTDATAASADEGRRLYIGNLAYATTEGELKDFFKAYTIENTSIPVNPRTTRPVGYAFVDLATAQEAQAAIAELSGKEILERKVSVQLARKPEPAENKGEAVSGGEGASGGEGRKRGYGRGRGRGRGRGGRFGARGGRAAKEPNGEHAEGTAEGTPLADVTNEPGDAPKDAKSRPRVQKQRGPPEDGIPSKTKVMVANLPYDLSEEKLKELFAAYEPVSAKIALRPIPRFMVKKLQARGEPRKGRGFGFVTLGSEALQTKAVEEMHGKEIEGREIAVKVAIDSPGKEDDISGEEQATAEAPADAPVTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.13
8 0.15
9 0.12
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.1
25 0.1
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.13
32 0.15
33 0.16
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.09
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.14
52 0.21
53 0.24
54 0.24
55 0.24
56 0.25
57 0.24
58 0.26
59 0.27
60 0.23
61 0.22
62 0.22
63 0.25
64 0.3
65 0.32
66 0.31
67 0.32
68 0.33
69 0.31
70 0.32
71 0.3
72 0.24
73 0.2
74 0.19
75 0.15
76 0.11
77 0.1
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.09
94 0.11
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.2
99 0.21
100 0.25
101 0.29
102 0.33
103 0.39
104 0.41
105 0.43
106 0.39
107 0.42
108 0.45
109 0.41
110 0.41
111 0.35
112 0.33
113 0.3
114 0.28
115 0.24
116 0.17
117 0.14
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.11
131 0.15
132 0.21
133 0.31
134 0.37
135 0.46
136 0.5
137 0.54
138 0.58
139 0.6
140 0.59
141 0.57
142 0.53
143 0.5
144 0.47
145 0.44
146 0.41
147 0.37
148 0.34
149 0.27
150 0.28
151 0.22
152 0.21
153 0.18
154 0.19
155 0.18
156 0.19
157 0.18
158 0.2
159 0.22
160 0.2
161 0.19
162 0.18
163 0.17
164 0.13
165 0.14
166 0.09
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.12
184 0.15
185 0.17
186 0.24
187 0.3
188 0.4
189 0.49
190 0.58
191 0.64
192 0.69
193 0.76
194 0.79
195 0.84
196 0.79
197 0.75
198 0.66
199 0.6
200 0.59
201 0.52
202 0.45
203 0.37
204 0.34
205 0.28
206 0.27
207 0.24
208 0.19
209 0.2
210 0.22
211 0.21
212 0.22
213 0.22
214 0.21
215 0.2
216 0.19
217 0.17
218 0.13
219 0.14
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.1
228 0.13
229 0.11
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.18
238 0.19
239 0.23
240 0.24
241 0.27
242 0.32
243 0.37
244 0.37
245 0.37
246 0.43
247 0.45
248 0.51
249 0.53
250 0.55
251 0.56
252 0.62
253 0.68
254 0.69
255 0.69
256 0.67
257 0.7
258 0.65
259 0.6
260 0.58
261 0.51
262 0.42
263 0.38
264 0.33
265 0.27
266 0.25
267 0.24
268 0.17
269 0.15
270 0.13
271 0.1
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.15
279 0.18
280 0.2
281 0.21
282 0.2
283 0.21
284 0.23
285 0.23
286 0.22
287 0.18
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.13
295 0.15
296 0.14
297 0.15
298 0.18
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.17
303 0.16
304 0.19
305 0.2
306 0.18
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.13
312 0.09
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08