Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BI39

Protein Details
Accession Q6BI39    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-32IISTSRKSIKSKRLNRGGNGKVHydrophilic
183-216AAKANLKSKKAKPAQAKKPAKRSKKTVEQLDQEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-56RKSIKSKRLNRGGNGKVGKKIGASNKKPIVSFKKSTPAAPK
161-207KVTGPKVAGPKAANPKLAAAKAAAKANLKSKKAKPAQAKKPAKRSKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG dha:DEHA2G13662g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSLDKSLDDIISTSRKSIKSKRLNRGGNGKVGKKIGASNKKPIVSFKKSTPAAPKKSTAVDVSYATKVVVYGLPRDIKLDAIKDFFQSQVGGVQNIALSYNEKGQFKGIATIIFKSSKSASKAVEKYNGAPIDGGSSKLKLELIVDPTKKPLTSRIAPNKVTGPKVAGPKAANPKLAAAKAAAKANLKSKKAKPAQAKKPAKRSKKTVEQLDQEMADYFDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.3
4 0.37
5 0.46
6 0.52
7 0.58
8 0.68
9 0.76
10 0.8
11 0.83
12 0.83
13 0.84
14 0.78
15 0.76
16 0.73
17 0.66
18 0.6
19 0.54
20 0.48
21 0.39
22 0.41
23 0.42
24 0.46
25 0.47
26 0.51
27 0.56
28 0.58
29 0.57
30 0.59
31 0.58
32 0.55
33 0.54
34 0.5
35 0.53
36 0.51
37 0.55
38 0.58
39 0.58
40 0.58
41 0.59
42 0.57
43 0.5
44 0.51
45 0.49
46 0.4
47 0.33
48 0.27
49 0.25
50 0.25
51 0.22
52 0.2
53 0.17
54 0.15
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.09
59 0.1
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.17
68 0.15
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.17
73 0.15
74 0.14
75 0.11
76 0.1
77 0.12
78 0.12
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.16
94 0.15
95 0.17
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.13
105 0.15
106 0.18
107 0.2
108 0.2
109 0.27
110 0.31
111 0.33
112 0.37
113 0.34
114 0.32
115 0.36
116 0.34
117 0.26
118 0.22
119 0.19
120 0.17
121 0.16
122 0.17
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.08
129 0.1
130 0.11
131 0.15
132 0.22
133 0.23
134 0.23
135 0.26
136 0.27
137 0.26
138 0.24
139 0.25
140 0.26
141 0.3
142 0.4
143 0.48
144 0.54
145 0.55
146 0.56
147 0.57
148 0.54
149 0.5
150 0.4
151 0.34
152 0.31
153 0.36
154 0.36
155 0.33
156 0.3
157 0.36
158 0.45
159 0.45
160 0.42
161 0.36
162 0.39
163 0.39
164 0.38
165 0.32
166 0.23
167 0.24
168 0.26
169 0.28
170 0.27
171 0.25
172 0.28
173 0.36
174 0.43
175 0.42
176 0.47
177 0.5
178 0.58
179 0.63
180 0.69
181 0.71
182 0.74
183 0.8
184 0.83
185 0.88
186 0.86
187 0.9
188 0.91
189 0.91
190 0.89
191 0.88
192 0.87
193 0.87
194 0.88
195 0.87
196 0.86
197 0.82
198 0.78
199 0.73
200 0.63
201 0.52
202 0.44