Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D9PC44

Protein Details
Accession A0A0D9PC44    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
440-460LTGLVRKKKAKEEEKPEPAAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-467RKKKAKEEEKPEPAAPATNGKRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 15, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MAEPAPETRPADEGTSTPTVTEGTPAATEDVATPISRDEDPKSRRVSLADLSAKGTALYAHKQYEDAAEIFSRASVLQVELNGETAPENAEILFHYGRSLFKVGQSKSDVLGGPAAADQKNAAAAAAAADSSSKPTAPALTEAQKVTQEGVAIASGQAGDAQEKKEDKTKEGGPDEKKPLFQFTGDENFDDSSDEEQQEEAPEEEDDDLATAFEILDLARVCYEKQLEQLSKDDEAGKGKETAEDPPSVRHIKERLADTHDCLAEISLENERYPNAIEDGRTSLNYKLELYPEDSEIIAEAHYKLSLALEFASVTMSDDEGKNTKREAMDQSLRDEAIKEMSLAIKSFKLKMQNKEVEVATMASPEDNDLARKAIFEMKEVIADMEQRLVDLKKDPIDASDLLGGPQANALGGLFGAALGESAADTQARVEEAKKTATDLTGLVRKKKAKEEEKPEPAAPATNGKRKAGDEVPEAAESPKRAKMEDEPEEVKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.24
4 0.21
5 0.2
6 0.18
7 0.17
8 0.18
9 0.13
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.14
23 0.15
24 0.17
25 0.21
26 0.3
27 0.35
28 0.42
29 0.46
30 0.46
31 0.47
32 0.47
33 0.46
34 0.41
35 0.46
36 0.44
37 0.4
38 0.38
39 0.37
40 0.34
41 0.28
42 0.24
43 0.17
44 0.15
45 0.19
46 0.21
47 0.22
48 0.23
49 0.23
50 0.24
51 0.24
52 0.24
53 0.2
54 0.17
55 0.15
56 0.15
57 0.15
58 0.14
59 0.12
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.11
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.12
84 0.12
85 0.15
86 0.18
87 0.14
88 0.2
89 0.28
90 0.28
91 0.33
92 0.37
93 0.35
94 0.33
95 0.36
96 0.3
97 0.22
98 0.23
99 0.16
100 0.13
101 0.13
102 0.15
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.11
124 0.11
125 0.15
126 0.17
127 0.2
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.24
132 0.23
133 0.2
134 0.17
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.04
146 0.06
147 0.08
148 0.09
149 0.12
150 0.14
151 0.15
152 0.22
153 0.23
154 0.25
155 0.28
156 0.32
157 0.36
158 0.4
159 0.47
160 0.44
161 0.5
162 0.55
163 0.51
164 0.49
165 0.42
166 0.41
167 0.34
168 0.3
169 0.24
170 0.22
171 0.27
172 0.25
173 0.24
174 0.21
175 0.2
176 0.2
177 0.18
178 0.15
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.1
211 0.09
212 0.12
213 0.17
214 0.18
215 0.19
216 0.22
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.19
221 0.14
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.16
230 0.15
231 0.16
232 0.16
233 0.16
234 0.2
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.22
240 0.25
241 0.27
242 0.26
243 0.3
244 0.31
245 0.29
246 0.31
247 0.26
248 0.22
249 0.19
250 0.16
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.15
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.14
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.09
307 0.12
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.18
312 0.18
313 0.21
314 0.25
315 0.29
316 0.34
317 0.35
318 0.37
319 0.35
320 0.35
321 0.31
322 0.27
323 0.19
324 0.14
325 0.13
326 0.1
327 0.09
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.13
333 0.14
334 0.16
335 0.18
336 0.27
337 0.33
338 0.4
339 0.49
340 0.52
341 0.52
342 0.54
343 0.51
344 0.42
345 0.36
346 0.3
347 0.2
348 0.14
349 0.13
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.16
362 0.16
363 0.17
364 0.2
365 0.18
366 0.19
367 0.19
368 0.18
369 0.13
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.12
376 0.12
377 0.13
378 0.15
379 0.19
380 0.19
381 0.21
382 0.22
383 0.2
384 0.24
385 0.23
386 0.21
387 0.21
388 0.18
389 0.16
390 0.18
391 0.16
392 0.12
393 0.12
394 0.1
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.09
417 0.1
418 0.15
419 0.18
420 0.21
421 0.21
422 0.23
423 0.24
424 0.23
425 0.23
426 0.19
427 0.22
428 0.26
429 0.3
430 0.33
431 0.39
432 0.44
433 0.49
434 0.57
435 0.62
436 0.65
437 0.72
438 0.76
439 0.8
440 0.82
441 0.82
442 0.73
443 0.66
444 0.56
445 0.5
446 0.42
447 0.41
448 0.4
449 0.43
450 0.46
451 0.46
452 0.48
453 0.46
454 0.51
455 0.47
456 0.45
457 0.41
458 0.42
459 0.43
460 0.39
461 0.39
462 0.33
463 0.31
464 0.27
465 0.27
466 0.28
467 0.26
468 0.26
469 0.3
470 0.37
471 0.43
472 0.48
473 0.52