Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D9P6L1

Protein Details
Accession A0A0D9P6L1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-369LIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-174KKRKTAKKA
348-360KGFTKEKNKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, cyto 3.5, mito 3, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKKNSKAVSSTREEAAPAPPAALLNLVGSFLNQHSFAKTHSAFQKEVAKNGWSCETSIDGDNSLVSIFKIWESGQNSKVESEEDSDDDSSDASSEESSDESSSSSSSEDEKTVTPATRKNVVETKNLKRKAPVESSSSESSDSSDSDSDSDSDSSSDSDDEPQAKKRKTAKKAASKSDSGSDSSDDGKMDVDQISSDDSSSDDDSSSEADSDNKIDVEIEVAAAAKVALPESDSSSDNSSSDSDSDSDSASDSDSAKAKSKKAKGVASKDSSDTSVTLDNQSPAPKPKVEDPPLPPNPVTNGRKKQNEPFSRIPKNIKVDPRFASNEYVSMDYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDITQKKGVYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.38
3 0.35
4 0.31
5 0.24
6 0.2
7 0.18
8 0.18
9 0.17
10 0.16
11 0.13
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.24
26 0.24
27 0.29
28 0.34
29 0.38
30 0.37
31 0.41
32 0.5
33 0.43
34 0.46
35 0.42
36 0.4
37 0.36
38 0.38
39 0.38
40 0.29
41 0.27
42 0.25
43 0.24
44 0.22
45 0.24
46 0.22
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.11
52 0.09
53 0.06
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.08
58 0.08
59 0.15
60 0.2
61 0.25
62 0.28
63 0.3
64 0.31
65 0.3
66 0.3
67 0.25
68 0.21
69 0.19
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.14
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.17
101 0.19
102 0.19
103 0.22
104 0.26
105 0.32
106 0.32
107 0.34
108 0.38
109 0.39
110 0.45
111 0.48
112 0.55
113 0.56
114 0.59
115 0.55
116 0.54
117 0.54
118 0.52
119 0.53
120 0.46
121 0.41
122 0.4
123 0.44
124 0.41
125 0.39
126 0.32
127 0.24
128 0.21
129 0.17
130 0.15
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.1
148 0.12
149 0.14
150 0.21
151 0.28
152 0.29
153 0.35
154 0.43
155 0.51
156 0.56
157 0.64
158 0.67
159 0.7
160 0.77
161 0.79
162 0.74
163 0.66
164 0.6
165 0.54
166 0.45
167 0.36
168 0.29
169 0.21
170 0.17
171 0.16
172 0.15
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.05
219 0.07
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.14
227 0.13
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.12
243 0.14
244 0.2
245 0.24
246 0.29
247 0.36
248 0.42
249 0.47
250 0.52
251 0.58
252 0.6
253 0.65
254 0.69
255 0.65
256 0.61
257 0.55
258 0.49
259 0.42
260 0.34
261 0.26
262 0.19
263 0.17
264 0.16
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.18
269 0.2
270 0.21
271 0.24
272 0.27
273 0.26
274 0.27
275 0.34
276 0.43
277 0.46
278 0.51
279 0.51
280 0.58
281 0.61
282 0.62
283 0.54
284 0.46
285 0.46
286 0.48
287 0.47
288 0.47
289 0.51
290 0.56
291 0.65
292 0.68
293 0.72
294 0.73
295 0.76
296 0.74
297 0.75
298 0.76
299 0.76
300 0.77
301 0.74
302 0.71
303 0.7
304 0.7
305 0.7
306 0.65
307 0.64
308 0.6
309 0.6
310 0.57
311 0.51
312 0.49
313 0.4
314 0.38
315 0.33
316 0.31
317 0.25
318 0.23
319 0.22
320 0.18
321 0.19
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.19
328 0.19
329 0.24
330 0.26
331 0.25
332 0.25
333 0.29
334 0.29
335 0.34
336 0.36
337 0.4
338 0.48
339 0.58
340 0.67
341 0.74
342 0.82
343 0.84
344 0.9
345 0.91
346 0.9
347 0.91
348 0.89
349 0.87
350 0.83
351 0.78
352 0.67
353 0.59
354 0.58
355 0.5
356 0.46
357 0.39
358 0.33
359 0.29