Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D9NZD1

Protein Details
Accession A0A0D9NZD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24LSEPRRPRLLPQNRKLRHLKGBasic
67-94SDSLRRDGLRPEKRRPPPQPRRTSLSLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-87LRPEKRRPPPQPR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040939  Vps38  
Gene Ontology GO:0034272  C:phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type II  
Pfam View protein in Pfam  
PF17649  VPS38  
Amino Acid Sequences MSTLSEPRRPRLLPQNRKLRHLKGLSLRNLTFALATLYSADDAVIPGSPSKLGMLREAAHLHTSRSSDSLRRDGLRPEKRRPPPQPRRTSLSLSHANPSTRQKRLESLVQASVGDVFFSLHVAECEEPIYISEVRNQSANFNFQFFDLSADKPLVSRSCTVSIRVWAKRPQQTSWVFLLQEFIDLRRLNFIGTLIDRQFPPNAIILHLEDGVYSLDFPTKTADPKHAPPAAATSSYNALMKLANLESSIQDAIDTQHRITQQINHILEKSPSDPTPAADEEVSLADKFVATQQRANKTARRRRDEMLESLRSRREAISIGREAQAAAEKDIANNKEKLAASEALLHKTEQQIRGQRRRICSELSDIFPITPIPNAPPLSFQICNLPLPNSTYDAATARTINEDVLSAALGLVATLTRHLQDDISHIPERQPQRREFPLYLPRGGSTIAQWRFEYGWFLLNKNIEALCASQGLKVVDIRHSLPNLKYLLYVCSAGTDEVPERKKGGVRGLWAGRLKGRMGAAADAESGSSAGGSRRGSVDSEVANQHGEVLRSAAVQANGDGDGGWGADSGVGLLPFGDDARFTLRTKGLRENVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.75
4 0.82
5 0.82
6 0.78
7 0.77
8 0.71
9 0.7
10 0.69
11 0.74
12 0.73
13 0.73
14 0.66
15 0.58
16 0.53
17 0.44
18 0.35
19 0.26
20 0.21
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.11
38 0.14
39 0.14
40 0.17
41 0.2
42 0.21
43 0.25
44 0.27
45 0.26
46 0.27
47 0.27
48 0.26
49 0.26
50 0.26
51 0.23
52 0.24
53 0.26
54 0.28
55 0.33
56 0.38
57 0.4
58 0.41
59 0.43
60 0.49
61 0.56
62 0.6
63 0.62
64 0.65
65 0.7
66 0.76
67 0.84
68 0.86
69 0.86
70 0.87
71 0.9
72 0.92
73 0.88
74 0.86
75 0.81
76 0.77
77 0.71
78 0.68
79 0.65
80 0.57
81 0.56
82 0.52
83 0.48
84 0.46
85 0.51
86 0.5
87 0.47
88 0.49
89 0.47
90 0.49
91 0.53
92 0.56
93 0.52
94 0.49
95 0.46
96 0.42
97 0.39
98 0.33
99 0.29
100 0.21
101 0.14
102 0.1
103 0.07
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.05
108 0.06
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.17
120 0.19
121 0.19
122 0.22
123 0.22
124 0.23
125 0.25
126 0.3
127 0.24
128 0.24
129 0.23
130 0.21
131 0.22
132 0.18
133 0.2
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.14
140 0.17
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.19
145 0.24
146 0.25
147 0.28
148 0.27
149 0.32
150 0.38
151 0.39
152 0.41
153 0.43
154 0.51
155 0.55
156 0.56
157 0.52
158 0.53
159 0.52
160 0.51
161 0.47
162 0.42
163 0.35
164 0.31
165 0.31
166 0.21
167 0.21
168 0.17
169 0.13
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.14
176 0.15
177 0.14
178 0.12
179 0.13
180 0.17
181 0.14
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.18
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.12
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.1
206 0.11
207 0.14
208 0.16
209 0.22
210 0.24
211 0.28
212 0.35
213 0.34
214 0.33
215 0.31
216 0.33
217 0.29
218 0.26
219 0.23
220 0.17
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.12
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.11
241 0.12
242 0.1
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.2
248 0.21
249 0.28
250 0.29
251 0.27
252 0.28
253 0.28
254 0.28
255 0.24
256 0.2
257 0.14
258 0.13
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.08
276 0.12
277 0.12
278 0.16
279 0.21
280 0.26
281 0.3
282 0.33
283 0.35
284 0.41
285 0.48
286 0.54
287 0.56
288 0.54
289 0.53
290 0.59
291 0.57
292 0.54
293 0.53
294 0.5
295 0.45
296 0.44
297 0.43
298 0.35
299 0.32
300 0.25
301 0.19
302 0.16
303 0.17
304 0.2
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.19
310 0.16
311 0.18
312 0.12
313 0.11
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.16
318 0.18
319 0.17
320 0.17
321 0.17
322 0.2
323 0.2
324 0.2
325 0.19
326 0.18
327 0.16
328 0.22
329 0.24
330 0.2
331 0.21
332 0.2
333 0.18
334 0.22
335 0.25
336 0.21
337 0.25
338 0.31
339 0.4
340 0.49
341 0.56
342 0.56
343 0.57
344 0.6
345 0.57
346 0.51
347 0.45
348 0.42
349 0.37
350 0.34
351 0.31
352 0.25
353 0.23
354 0.2
355 0.19
356 0.12
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.17
365 0.21
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.21
371 0.2
372 0.2
373 0.16
374 0.18
375 0.19
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.15
380 0.14
381 0.15
382 0.13
383 0.13
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.13
409 0.15
410 0.2
411 0.21
412 0.2
413 0.22
414 0.28
415 0.35
416 0.39
417 0.43
418 0.42
419 0.48
420 0.55
421 0.6
422 0.56
423 0.56
424 0.57
425 0.55
426 0.53
427 0.46
428 0.4
429 0.34
430 0.32
431 0.24
432 0.18
433 0.23
434 0.23
435 0.24
436 0.24
437 0.25
438 0.25
439 0.25
440 0.25
441 0.17
442 0.2
443 0.19
444 0.2
445 0.22
446 0.22
447 0.22
448 0.21
449 0.2
450 0.14
451 0.14
452 0.14
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.16
461 0.17
462 0.18
463 0.2
464 0.22
465 0.23
466 0.26
467 0.29
468 0.28
469 0.31
470 0.29
471 0.27
472 0.26
473 0.23
474 0.23
475 0.2
476 0.2
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.14
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.2
485 0.23
486 0.23
487 0.24
488 0.26
489 0.3
490 0.32
491 0.38
492 0.35
493 0.36
494 0.43
495 0.45
496 0.49
497 0.47
498 0.45
499 0.4
500 0.38
501 0.35
502 0.3
503 0.28
504 0.24
505 0.23
506 0.22
507 0.2
508 0.18
509 0.17
510 0.14
511 0.13
512 0.1
513 0.08
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.1
519 0.11
520 0.13
521 0.14
522 0.16
523 0.18
524 0.19
525 0.22
526 0.2
527 0.24
528 0.24
529 0.23
530 0.23
531 0.21
532 0.22
533 0.2
534 0.19
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.14
543 0.14
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.11
548 0.08
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.06
565 0.05
566 0.07
567 0.13
568 0.16
569 0.17
570 0.24
571 0.29
572 0.34
573 0.39
574 0.47