FuNGI

C6H944

Protein Details

Accession

C6H944

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-52	SSKQRRKATTRTFSERVRNS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR010994 RuvA_2-like IPR042066 Spt6_death-like IPR032706 Spt6_HHH IPR028231 Spt6_YqgF IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14635 HHH_7 PF14639 YqgF

Amino Acid Sequences

MEELQDVQDYLYFQYPGQLKDIAMVNGSGENGSSKQRRKATTRTFSERVRNSRAYGLVRAFGITADAFAQNALKEGKRQYTEDPAEQPDVMADNFVDENFTNGGHALRAAKAMFAEELTMSPKMRKVMRQAFYMNGVIECFRTEKGLKKIDEQHPYYEFKYLRNQQLSDIARRPELFLRMLKAEEEGLVEVKVRFQNFENFKKSLYSQIESDNFSELADAWNRERREVVDMALGKLDRIMSRGVKENIRTECENHVVKECREAFSLRLDQAPYKPKGMILGTIPRVLALSNGNGVVGKDPIYWAWIEEDGRVLENGKFVDLSLGDSGRMVSDGIDVAAFVELVDRRKPDVIGVAGFSPETRKLYKQLVDLVSSKDLRSATYTNEYDEEVSDHLEVVIVNDEVARLYQTSERAKMEHPGFATLTHYCVALAKYLQNPMKEYASLGRDIVSIQFKPGQQLVPEDKILKQLETALVDMVNLCGVDINEAVTDIATANLLPYVCGLGPRKAAQLLKIINMNGGIVNNRMELLGVNAQYPAMGVKVWNNCASFLYIDYDSTDPDADYLDNTRVHPEDYDIGRKMAADALELDEEDIKAETDENGQGAIIRKLIKEDAQDRVNDLILEEYAEQLEKNLNQRKRATLETIRAELQQPYEELRKQFAFLSTDAIFIMLTGETTESLAEGMVVPISIKRVSDDHIDGKLDCGIDAIAGEVEITDRYDIPVRSLFSPHQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.24
3	0.24
4	0.26
5	0.26
6	0.22
7	0.26
8	0.3
9	0.24
10	0.21
11	0.2
12	0.17
13	0.17
14	0.17
15	0.13
16	0.09
17	0.1
18	0.11
19	0.19
20	0.27
21	0.32
22	0.41
23	0.48
24	0.56
25	0.61
26	0.7
27	0.73
28	0.76
29	0.79
30	0.79
31	0.78
32	0.77
33	0.8
34	0.78
35	0.75
36	0.73
37	0.68
38	0.61
39	0.61
40	0.6
41	0.54
42	0.51
43	0.45
44	0.39
45	0.35
46	0.33
47	0.27
48	0.21
49	0.19
50	0.12
51	0.1
52	0.09
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.1
57	0.08
58	0.12
59	0.14
60	0.14
61	0.18
62	0.24
63	0.32
64	0.34
65	0.37
66	0.39
67	0.46
68	0.51
69	0.51
70	0.5
71	0.46
72	0.45
73	0.42
74	0.37
75	0.28
76	0.24
77	0.19
78	0.15
79	0.1
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.09
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.09
89	0.09
90	0.1
91	0.08
92	0.1
93	0.1
94	0.1
95	0.13
96	0.13
97	0.13
98	0.12
99	0.13
100	0.12
101	0.1
102	0.11
103	0.08
104	0.09
105	0.11
106	0.13
107	0.13
108	0.14
109	0.17
110	0.21
111	0.25
112	0.3
113	0.38
114	0.46
115	0.5
116	0.54
117	0.53
118	0.51
119	0.5
120	0.46
121	0.36
122	0.27
123	0.23
124	0.18
125	0.15
126	0.14
127	0.12
128	0.1
129	0.13
130	0.16
131	0.23
132	0.31
133	0.38
134	0.39
135	0.45
136	0.54
137	0.59
138	0.66
139	0.6
140	0.57
141	0.54
142	0.56
143	0.49
144	0.46
145	0.39
146	0.33
147	0.41
148	0.43
149	0.48
150	0.49
151	0.49
152	0.44
153	0.52
154	0.52
155	0.49
156	0.47
157	0.39
158	0.37
159	0.37
160	0.38
161	0.33
162	0.32
163	0.29
164	0.26
165	0.28
166	0.26
167	0.27
168	0.24
169	0.21
170	0.18
171	0.15
172	0.13
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.1
177	0.09
178	0.12
179	0.15
180	0.14
181	0.15
182	0.16
183	0.25
184	0.31
185	0.39
186	0.41
187	0.39
188	0.39
189	0.4
190	0.39
191	0.39
192	0.37
193	0.31
194	0.27
195	0.33
196	0.35
197	0.35
198	0.34
199	0.27
200	0.22
201	0.2
202	0.18
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.13
207	0.14
208	0.2
209	0.2
210	0.21
211	0.22
212	0.21
213	0.23
214	0.23
215	0.21
216	0.21
217	0.21
218	0.21
219	0.22
220	0.2
221	0.15
222	0.15
223	0.15
224	0.09
225	0.1
226	0.12
227	0.12
228	0.15
229	0.22
230	0.25
231	0.27
232	0.3
233	0.35
234	0.35
235	0.37
236	0.36
237	0.32
238	0.32
239	0.35
240	0.34
241	0.28
242	0.32
243	0.31
244	0.3
245	0.36
246	0.33
247	0.29
248	0.29
249	0.29
250	0.24
251	0.26
252	0.29
253	0.22
254	0.22
255	0.22
256	0.22
257	0.26
258	0.33
259	0.28
260	0.27
261	0.26
262	0.24
263	0.26
264	0.25
265	0.22
266	0.17
267	0.22
268	0.22
269	0.22
270	0.22
271	0.18
272	0.18
273	0.16
274	0.14
275	0.08
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.07
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.1
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.07
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.03
326	0.03
327	0.04
328	0.05
329	0.07
330	0.09
331	0.09
332	0.1
333	0.12
334	0.12
335	0.11
336	0.13
337	0.12
338	0.11
339	0.11
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.09
344	0.07
345	0.07
346	0.09
347	0.1
348	0.11
349	0.14
350	0.19
351	0.22
352	0.23
353	0.27
354	0.27
355	0.28
356	0.28
357	0.26
358	0.24
359	0.22
360	0.2
361	0.16
362	0.15
363	0.13
364	0.15
365	0.14
366	0.14
367	0.2
368	0.2
369	0.18
370	0.19
371	0.19
372	0.16
373	0.15
374	0.14
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.05
393	0.07
394	0.11
395	0.14
396	0.17
397	0.18
398	0.19
399	0.2
400	0.25
401	0.25
402	0.23
403	0.21
404	0.2
405	0.19
406	0.18
407	0.2
408	0.13
409	0.13
410	0.11
411	0.1
412	0.08
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.12
419	0.18
420	0.21
421	0.21
422	0.22
423	0.23
424	0.24
425	0.21
426	0.21
427	0.19
428	0.18
429	0.17
430	0.15
431	0.14
432	0.12
433	0.13
434	0.14
435	0.13
436	0.12
437	0.12
438	0.16
439	0.16
440	0.18
441	0.19
442	0.18
443	0.15
444	0.21
445	0.24
446	0.23
447	0.24
448	0.23
449	0.22
450	0.27
451	0.27
452	0.21
453	0.17
454	0.16
455	0.17
456	0.17
457	0.16
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.07
463	0.05
464	0.04
465	0.03
466	0.04
467	0.04
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.03
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.06
486	0.06
487	0.1
488	0.12
489	0.14
490	0.17
491	0.18
492	0.2
493	0.23
494	0.23
495	0.22
496	0.27
497	0.25
498	0.25
499	0.26
500	0.25
501	0.21
502	0.21
503	0.19
504	0.12
505	0.11
506	0.1
507	0.08
508	0.09
509	0.08
510	0.09
511	0.08
512	0.08
513	0.07
514	0.09
515	0.12
516	0.11
517	0.12
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.11
522	0.08
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.11
527	0.15
528	0.18
529	0.22
530	0.22
531	0.22
532	0.23
533	0.24
534	0.19
535	0.16
536	0.17
537	0.13
538	0.13
539	0.15
540	0.14
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.09
545	0.08
546	0.09
547	0.07
548	0.08
549	0.1
550	0.12
551	0.14
552	0.14
553	0.17
554	0.17
555	0.18
556	0.17
557	0.18
558	0.21
559	0.23
560	0.29
561	0.27
562	0.27
563	0.26
564	0.25
565	0.23
566	0.2
567	0.16
568	0.11
569	0.1
570	0.12
571	0.12
572	0.12
573	0.12
574	0.1
575	0.1
576	0.09
577	0.08
578	0.07
579	0.06
580	0.07
581	0.07
582	0.09
583	0.1
584	0.1
585	0.09
586	0.09
587	0.11
588	0.13
589	0.14
590	0.14
591	0.15
592	0.15
593	0.18
594	0.2
595	0.21
596	0.25
597	0.29
598	0.33
599	0.34
600	0.35
601	0.34
602	0.34
603	0.31
604	0.24
605	0.21
606	0.15
607	0.11
608	0.12
609	0.1
610	0.09
611	0.08
612	0.09
613	0.08
614	0.08
615	0.12
616	0.14
617	0.23
618	0.31
619	0.36
620	0.43
621	0.47
622	0.53
623	0.54
624	0.56
625	0.55
626	0.54
627	0.58
628	0.56
629	0.56
630	0.5
631	0.47
632	0.44
633	0.38
634	0.32
635	0.26
636	0.21
637	0.23
638	0.27
639	0.3
640	0.3
641	0.33
642	0.32
643	0.31
644	0.33
645	0.32
646	0.29
647	0.25
648	0.29
649	0.24
650	0.23
651	0.22
652	0.19
653	0.14
654	0.11
655	0.12
656	0.06
657	0.05
658	0.05
659	0.06
660	0.06
661	0.07
662	0.07
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.06
672	0.06
673	0.09
674	0.1
675	0.1
676	0.12
677	0.14
678	0.17
679	0.23
680	0.28
681	0.3
682	0.33
683	0.35
684	0.33
685	0.32
686	0.32
687	0.26
688	0.2
689	0.16
690	0.12
691	0.1
692	0.1
693	0.09
694	0.06
695	0.06
696	0.06
697	0.05
698	0.06
699	0.06
700	0.07
701	0.08
702	0.08
703	0.11
704	0.17
705	0.17
706	0.21
707	0.25
708	0.27
709	0.28
710	0.33

C6H944

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer