Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6H1Q0

Protein Details
Accession C6H1Q0    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-366MKNRCRGTSVHAWRRSRKSRTRYNEFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11.5, mito_nucl 11, nucl 9.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
Amino Acid Sequences MSTPSGGKSGNPRSVAVSLSPRAEDPFPGHDWSSRNPRQLAIRDSNARSVRPAFRRDVIYRKRWLKPLTCRAFVQAVDKAQSEMTKVLRVRTEQKVRLRLTDFLSYFTLNRLFVNECEAVSGHSGTALKDVANNQILGFIPFLHEVEKQKLVQKMEFEKWERIDFKPQDELMLAHIAYAAKQNKKGPTLAVIEEGKFMLVDSAVFALRGIEQYTILLASIPAMANEISTVLLDYRKLHNSCTPLLIFGAGARITAGLTNINAKHLALTSQSLSFIALIPYVRKCVRRRPSITASGMAEYDRLKRLFQDHRSSIHEKLIDIMSFRVTLYIREMEKIKWDDEMKNRCRGTSVHAWRRSRKSRTRYNEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.42
3 0.36
4 0.34
5 0.31
6 0.31
7 0.31
8 0.27
9 0.29
10 0.28
11 0.27
12 0.24
13 0.26
14 0.27
15 0.29
16 0.29
17 0.3
18 0.33
19 0.37
20 0.44
21 0.45
22 0.49
23 0.47
24 0.49
25 0.54
26 0.58
27 0.59
28 0.56
29 0.57
30 0.58
31 0.59
32 0.64
33 0.58
34 0.51
35 0.47
36 0.46
37 0.47
38 0.46
39 0.49
40 0.46
41 0.48
42 0.54
43 0.56
44 0.6
45 0.6
46 0.61
47 0.65
48 0.69
49 0.7
50 0.71
51 0.73
52 0.72
53 0.73
54 0.77
55 0.75
56 0.7
57 0.65
58 0.6
59 0.57
60 0.48
61 0.42
62 0.36
63 0.3
64 0.29
65 0.28
66 0.25
67 0.22
68 0.22
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.2
73 0.21
74 0.24
75 0.26
76 0.29
77 0.34
78 0.41
79 0.49
80 0.5
81 0.57
82 0.63
83 0.61
84 0.63
85 0.6
86 0.54
87 0.48
88 0.48
89 0.41
90 0.34
91 0.34
92 0.28
93 0.26
94 0.24
95 0.22
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.18
102 0.16
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.1
117 0.11
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.11
132 0.12
133 0.16
134 0.19
135 0.19
136 0.23
137 0.27
138 0.27
139 0.27
140 0.29
141 0.31
142 0.32
143 0.36
144 0.35
145 0.35
146 0.34
147 0.37
148 0.35
149 0.31
150 0.37
151 0.33
152 0.32
153 0.33
154 0.31
155 0.27
156 0.25
157 0.24
158 0.16
159 0.16
160 0.13
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.13
166 0.16
167 0.16
168 0.19
169 0.23
170 0.25
171 0.27
172 0.28
173 0.23
174 0.23
175 0.24
176 0.22
177 0.22
178 0.2
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.12
183 0.09
184 0.08
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.04
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.09
221 0.12
222 0.19
223 0.2
224 0.22
225 0.25
226 0.29
227 0.29
228 0.31
229 0.27
230 0.21
231 0.2
232 0.18
233 0.14
234 0.1
235 0.11
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.05
244 0.06
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.16
268 0.19
269 0.26
270 0.3
271 0.4
272 0.49
273 0.57
274 0.62
275 0.67
276 0.71
277 0.73
278 0.72
279 0.65
280 0.58
281 0.48
282 0.42
283 0.33
284 0.27
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.2
289 0.19
290 0.21
291 0.29
292 0.37
293 0.44
294 0.5
295 0.49
296 0.53
297 0.6
298 0.61
299 0.56
300 0.52
301 0.45
302 0.35
303 0.35
304 0.33
305 0.27
306 0.24
307 0.23
308 0.18
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.13
313 0.13
314 0.17
315 0.21
316 0.21
317 0.24
318 0.26
319 0.25
320 0.33
321 0.35
322 0.31
323 0.32
324 0.35
325 0.39
326 0.47
327 0.56
328 0.53
329 0.59
330 0.59
331 0.53
332 0.52
333 0.46
334 0.44
335 0.45
336 0.51
337 0.52
338 0.6
339 0.68
340 0.74
341 0.83
342 0.86
343 0.85
344 0.84
345 0.84
346 0.86